More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0311 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
639 aa  1291    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.35 
 
 
657 aa  440  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.79 
 
 
871 aa  387  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 
881 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 
1049 aa  313  5.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.34 
 
 
680 aa  306  6e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 
785 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 
791 aa  280  4e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 
874 aa  279  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
882 aa  276  7e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 
1116 aa  276  7e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  32.24 
 
 
823 aa  276  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  41.51 
 
 
631 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.79 
 
 
780 aa  273  7e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.13 
 
 
1548 aa  272  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
973 aa  273  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.62 
 
 
969 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 
896 aa  270  8e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 
1075 aa  269  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3675  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 
966 aa  269  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 
862 aa  268  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.31 
 
 
803 aa  268  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 
674 aa  268  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 
959 aa  266  7e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.38 
 
 
1127 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  34.55 
 
 
1193 aa  266  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 
1090 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 
1090 aa  265  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 
957 aa  264  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.94 
 
 
965 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332193  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.72 
 
 
902 aa  261  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1328  histidine kinase  42.55 
 
 
672 aa  261  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  38.89 
 
 
661 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1934  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 
1015 aa  258  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.452261  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.21 
 
 
763 aa  258  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  40.9 
 
 
810 aa  258  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.56 
 
 
969 aa  258  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  37.14 
 
 
968 aa  257  5e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 
827 aa  256  6e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  37.65 
 
 
606 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 
1177 aa  255  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 
846 aa  254  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0181  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.78 
 
 
837 aa  254  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.415169  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.03 
 
 
1070 aa  254  3e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 
1120 aa  254  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 
940 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.89 
 
 
968 aa  254  5.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 
781 aa  253  7e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 
1229 aa  253  9.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 
1350 aa  252  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 
785 aa  252  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 
1099 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 
1363 aa  251  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3431  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 
756 aa  252  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  41.9 
 
 
729 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 
1029 aa  252  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.98 
 
 
1121 aa  251  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.84 
 
 
1068 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 
939 aa  251  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  39.57 
 
 
571 aa  251  4e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 
902 aa  250  5e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  39.04 
 
 
758 aa  250  6e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 
1199 aa  250  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 
989 aa  250  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.42 
 
 
1069 aa  249  9e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2951  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.39 
 
 
1118 aa  249  9e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.38957  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  34.75 
 
 
764 aa  249  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.32 
 
 
989 aa  249  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1413  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 
918 aa  249  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  39.31 
 
 
559 aa  248  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  39.79 
 
 
588 aa  248  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
1055 aa  248  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 
1131 aa  248  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 
1691 aa  248  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0370  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 
1070 aa  247  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 
866 aa  247  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 
738 aa  247  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1982  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 
1058 aa  247  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.69 
 
 
846 aa  246  6e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  32.32 
 
 
982 aa  246  8e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 
747 aa  246  8e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 
1223 aa  246  8e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  37.35 
 
 
882 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.94 
 
 
1070 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 
1044 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.06 
 
 
1433 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.84 
 
 
827 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  36.27 
 
 
641 aa  245  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 
778 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2964  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.49 
 
 
647 aa  244  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 
627 aa  244  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3563  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.08 
 
 
1023 aa  244  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 
764 aa  244  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  38.87 
 
 
578 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2769  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 
773 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 
913 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  33.1 
 
 
786 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.6 
 
 
1313 aa  244  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.01 
 
 
1027 aa  244  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.3 
 
 
1271 aa  244  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>