More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0302 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  100 
 
 
670 aa  1317    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  38.94 
 
 
758 aa  478  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  39.1 
 
 
758 aa  469  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  40.96 
 
 
741 aa  445  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  41.58 
 
 
737 aa  422  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  40.78 
 
 
734 aa  419  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.75 
 
 
696 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.77 
 
 
758 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  37.81 
 
 
744 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  40.75 
 
 
729 aa  363  5.0000000000000005e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  36.99 
 
 
760 aa  360  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  37.23 
 
 
759 aa  357  5e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  35.68 
 
 
758 aa  357  5e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.63 
 
 
754 aa  339  9e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.16 
 
 
764 aa  336  9e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  34.82 
 
 
756 aa  332  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  34.15 
 
 
794 aa  326  9e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.23 
 
 
753 aa  318  2e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  35.21 
 
 
746 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  33.11 
 
 
738 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.66 
 
 
658 aa  298  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  33.38 
 
 
725 aa  296  9e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.38 
 
 
723 aa  289  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.3 
 
 
656 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  32.44 
 
 
731 aa  284  4.0000000000000003e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.4 
 
 
723 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  33.39 
 
 
729 aa  279  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  34.14 
 
 
645 aa  276  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.02 
 
 
672 aa  271  4e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  30.96 
 
 
694 aa  261  4e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.71 
 
 
657 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  30.59 
 
 
752 aa  257  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.29 
 
 
656 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  29.69 
 
 
721 aa  254  4.0000000000000004e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.11 
 
 
643 aa  250  7e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  30.54 
 
 
665 aa  249  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  31.23 
 
 
614 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  31.32 
 
 
701 aa  239  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  28.13 
 
 
641 aa  236  7e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  30.73 
 
 
607 aa  232  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  35.35 
 
 
650 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  29.61 
 
 
638 aa  218  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  33.24 
 
 
696 aa  212  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.74 
 
 
611 aa  200  7e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  30.06 
 
 
667 aa  200  7.999999999999999e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  34.62 
 
 
936 aa  198  3e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.66 
 
 
701 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.69 
 
 
652 aa  191  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.96 
 
 
761 aa  190  7e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  31.54 
 
 
735 aa  190  9e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.96 
 
 
757 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  33.05 
 
 
717 aa  182  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  23.43 
 
 
643 aa  179  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0097  putative Chase2 sensor protein  29.24 
 
 
635 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  29.09 
 
 
744 aa  174  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  36.23 
 
 
675 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  38.79 
 
 
861 aa  169  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.67 
 
 
597 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 
864 aa  169  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  38.99 
 
 
858 aa  168  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2510  putative Chase2 sensor protein  26.67 
 
 
753 aa  167  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0278578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  41.4 
 
 
903 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 
859 aa  167  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  37.85 
 
 
860 aa  167  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  26.34 
 
 
582 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  38.86 
 
 
701 aa  166  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  30.25 
 
 
641 aa  165  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  37.44 
 
 
701 aa  162  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  40.19 
 
 
702 aa  162  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  29.36 
 
 
825 aa  161  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  37.38 
 
 
911 aa  160  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0632  metal dependent phosphohydrolase  34.82 
 
 
654 aa  160  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000219793  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  39.19 
 
 
593 aa  160  7e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.77 
 
 
703 aa  159  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  37.33 
 
 
724 aa  158  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  37.31 
 
 
797 aa  155  2e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  37.04 
 
 
483 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  36.57 
 
 
483 aa  154  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  29.32 
 
 
645 aa  154  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  37.27 
 
 
699 aa  153  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  37.04 
 
 
637 aa  153  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  39.42 
 
 
648 aa  153  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  38.6 
 
 
523 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4597  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.26 
 
 
622 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.334368  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  33.42 
 
 
632 aa  151  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1897  metal-dependent phosphohydrolase  34.79 
 
 
671 aa  150  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  36.11 
 
 
643 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  36.4 
 
 
636 aa  149  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  32.91 
 
 
681 aa  148  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  27.75 
 
 
632 aa  146  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 
1805 aa  146  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  34.6 
 
 
284 aa  146  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  35.94 
 
 
431 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  41.95 
 
 
528 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  37.1 
 
 
713 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 
712 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  37.16 
 
 
487 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  36.41 
 
 
441 aa  144  6e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  37.33 
 
 
483 aa  144  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  39.56 
 
 
518 aa  143  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>