More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0267 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 306 aa  611  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 293 aa  250  3e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  39.66 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  38.38 
 
 		 300 aa  156  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  29.66 
 
 		 295 aa  142  9e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  34.36 
 
 		 294 aa  135  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  34.95 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  32.76 
 
 		 298 aa  122  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  31.03 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 289 aa  116  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  32.53 
 
 		 298 aa  115  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0396  hypothetical protein  33.22 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  30.49 
 
 		 320 aa  109  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  33.56 
 
 		 291 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  32.28 
 
 		 301 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  31.34 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  31.36 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  27.8 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  33.33 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  32.53 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  31.01 
 
 		 286 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  32.01 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  28.97 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 265 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  30.41 
 
 		 301 aa  93.2  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0418  universal stress protein uspA  31.39 
 
 		 297 aa  92.8  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  28.97 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7039  UspA domain protein  29.93 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  32.3 
 
 		 297 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  28.03 
 
 		 291 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  30.59 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6021  UspA domain protein  28.01 
 
 		 352 aa  87  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  28.12 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  26.65 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66460  hypothetical protein  30.45 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45150  universal stress protein  28.62 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5764  hypothetical protein  29.76 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  30.07 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5472  UspA domain protein  30.28 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.814559 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2918  UspA domain-containing protein  29.69 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519295 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1859  UspA domain-containing protein  24.75 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2148  hypothetical protein  27.57 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  30.84 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  28.38 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  28 
 
 		 415 aa  75.9  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  30.51 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  29.27 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  20.98 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  31.03 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  26.98 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  31.34 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1338  UspA domain protein  34.69 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0244136 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  35.23 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  30.23 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  35.94 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  33.06 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  35.94 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  27.8 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  35.94 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  26.56 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1265  hypothetical protein  21.2 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.995311  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  31.9 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  29.06 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  27.45 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  33.16 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  35.21 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  32.87 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0155  hypothetical protein  33.56 
 
 		 177 aa  68.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  27.65 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  31.78 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  31.86 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  25.9 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  32.43 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  27.64 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  28.71 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5859  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  26.1 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  28.18 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  20.13 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  28.46 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  34.55 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  34.55 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  32.52 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  31.97 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.51 
 
 		 153 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  28.57 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  32.11 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  20.82 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  32.64 
 
 		 141 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  25.66 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.01 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  35.37 
 
 		 170 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  35.37 
 
 		 170 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  29.51 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 		 157 aa  64.3  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  31.94 
 
 		 142 aa  64.7  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>