36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0266 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0266  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  338  2e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1514  hypothetical protein  50.63 
 
 
155 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1232  nitrogen fixation protein  50.63 
 
 
155 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000318988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01490  hypothetical protein  51.01 
 
 
160 aa  166  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1352  nitrogen fixation protein  50.32 
 
 
159 aa  166  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0236  hypothetical protein  51.06 
 
 
152 aa  165  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4457  hypothetical protein  50.68 
 
 
155 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1473  hypothetical protein  49.38 
 
 
165 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554599  decreased coverage  0.000104665 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3626  nitrogen fixation protein  46.5 
 
 
155 aa  160  9e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136981 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2283  hypothetical protein  51.02 
 
 
157 aa  160  9e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1508  hypothetical protein  47.22 
 
 
153 aa  159  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.689838  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5919  hypothetical protein  48.32 
 
 
156 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29421  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0975  hypothetical protein  47.22 
 
 
154 aa  157  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1079  hypothetical protein  46.79 
 
 
155 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2322  hypothetical protein  45 
 
 
170 aa  153  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0454045  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3540  nitrogen fixation protein  47.97 
 
 
158 aa  151  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.859638  hitchhiker  0.00968593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5095  nitrogen fixation protein  45.83 
 
 
154 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1564  nitrogen fixation protein  47.62 
 
 
153 aa  149  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0479  nitrogen fixation protein  46.75 
 
 
156 aa  147  9e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0094  hypothetical protein  46.48 
 
 
156 aa  145  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.123891  normal  0.916048 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2187  hypothetical protein  47.14 
 
 
156 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0900342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0535  hypothetical protein  47.14 
 
 
156 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385601  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1252  hypothetical protein  46.43 
 
 
156 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4482  hypothetical protein  50.35 
 
 
147 aa  142  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.995501  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3990  nitrogen fixation protein  46.1 
 
 
160 aa  142  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186093  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1192  hypothetical protein  42.86 
 
 
149 aa  140  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000719142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4253  hypothetical protein  41.1 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1791  nitrogen fixation protein  43.26 
 
 
156 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1819  nitrogen fixation protein  42.55 
 
 
156 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2113  nitrogen fixation protein  43.57 
 
 
159 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00558029 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1347  nitrogen fixation protein  40.97 
 
 
158 aa  134  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.629038  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6875  hypothetical protein  49.28 
 
 
155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4799  nitrogen fixation protein  41.03 
 
 
157 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3935  hypothetical protein  41.43 
 
 
158 aa  130  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0255327 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4141  hypothetical protein  38.13 
 
 
156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2115  hypothetical protein  37.76 
 
 
154 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00818252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>