More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0211 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0211  dihydroorotate oxidase  100 
 
 		 342 aa  678    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1463  dihydroorotate oxidase  55.92 
 
 		 340 aa  360  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0318461 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1613  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.12 
 
 		 341 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000426002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.68 
 
 		 340 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.68 
 
 		 343 aa  349  4e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.02785  decreased coverage  0.00223675 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3645  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.38 
 
 		 369 aa  348  8e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2309  dihydroorotate dehydrogenase  51.19 
 
 		 343 aa  345  8e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.08 
 
 		 339 aa  344  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1606  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.79 
 
 		 341 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.806586  normal  0.155671 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.55 
 
 		 340 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2087  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.51 
 
 		 342 aa  342  5e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24640  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.51 
 
 		 342 aa  341  8e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.49 
 
 		 347 aa  342  8e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.65 
 
 		 349 aa  341  1e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.88 
 
 		 345 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.46 
 
 		 344 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1619  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.79 
 
 		 344 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.04 
 
 		 353 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3011  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.6 
 
 		 340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000990874 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.59 
 
 		 356 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.59 
 
 		 356 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  49.1 
 
 		 340 aa  334  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.92 
 
 		 344 aa  333  3e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1750  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.78 
 
 		 339 aa  333  3e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.85 
 
 		 345 aa  332  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.15 
 
 		 353 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1928  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.03 
 
 		 365 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0930584  normal  0.0310876 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4696  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.18 
 
 		 356 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226545  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0768  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.88 
 
 		 345 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0837713  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1253  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.88 
 
 		 345 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1978  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.88 
 
 		 345 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1825  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.88 
 
 		 342 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.833484  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0394  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.88 
 
 		 345 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1736  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.88 
 
 		 345 aa  329  4e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.575545  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1809  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.88 
 
 		 342 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.505366  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.66 
 
 		 337 aa  328  6e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1074  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.88 
 
 		 356 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1554  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.88 
 
 		 356 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1724  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.29 
 
 		 351 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.15 
 
 		 335 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1600  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.44 
 
 		 365 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.306495 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  46.55 
 
 		 336 aa  323  2e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1101  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.08 
 
 		 344 aa  323  2e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.423507 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.49 
 
 		 347 aa  322  5e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.49 
 
 		 347 aa  322  5e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1284  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.08 
 
 		 344 aa  322  7e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.718117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.11 
 
 		 351 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.11 
 
 		 351 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0645  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.45 
 
 		 337 aa  318  6e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.31 
 
 		 339 aa  318  6e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1530  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.37 
 
 		 330 aa  318  6e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.95205 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.42 
 
 		 351 aa  317  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  48.81 
 
 		 344 aa  316  3e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1213  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.69 
 
 		 358 aa  316  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1317  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.53 
 
 		 344 aa  315  7e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  47.32 
 
 		 377 aa  315  8e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  49.26 
 
 		 346 aa  314  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1080  Dihydroorotate oxidase  48.35 
 
 		 344 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.106041  normal  0.333003 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.11 
 
 		 339 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.11 
 
 		 339 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.41 
 
 		 339 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1342  dihydroorotate oxidase A  51.16 
 
 		 371 aa  311  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.11 
 
 		 339 aa  311  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.97 
 
 		 339 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.97 
 
 		 339 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.97 
 
 		 339 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1810  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.71 
 
 		 341 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000129041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.67 
 
 		 339 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1943  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.81 
 
 		 339 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.31 
 
 		 339 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.67 
 
 		 339 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1164  dihydroorotate oxidase A  47.81 
 
 		 347 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.92 
 
 		 348 aa  304  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2003  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.01 
 
 		 335 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557118  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1646  dihydroorotate dehydrogenase  46.57 
 
 		 335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.353277  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1677  dihydroorotate dehydrogenase  48.36 
 
 		 335 aa  302  6.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  45.37 
 
 		 348 aa  302  7.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1784  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.35 
 
 		 333 aa  301  8.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1984  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.92 
 
 		 336 aa  301  8.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2644  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.92 
 
 		 336 aa  301  8.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2555  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.92 
 
 		 336 aa  301  8.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.982288  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1785  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.05 
 
 		 333 aa  301  1e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2475  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.97 
 
 		 339 aa  300  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00234751  hitchhiker  0.00462057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2141  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.45 
 
 		 340 aa  300  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.27 
 
 		 336 aa  300  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.51 
 
 		 336 aa  300  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1740  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.11 
 
 		 336 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0560923  normal  0.0257615 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  45.95 
 
 		 336 aa  300  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00949  dihydroorotate dehydrogenase  45.51 
 
 		 336 aa  299  4e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000020271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2698  Dihydroorotate oxidase  45.51 
 
 		 336 aa  299  4e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157783  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1060  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.51 
 
 		 336 aa  299  4e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116654  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2651  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.51 
 
 		 336 aa  299  4e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000533982  hitchhiker  0.00158114 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2372  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.51 
 
 		 336 aa  299  4e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000164605  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1054  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.51 
 
 		 336 aa  299  4e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000778438  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1109  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.51 
 
 		 336 aa  299  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000226851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00956  hypothetical protein  45.51 
 
 		 336 aa  299  4e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1788  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.97 
 
 		 336 aa  299  5e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0427694  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.65 
 
 		 336 aa  299  5e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1549  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.44 
 
 		 336 aa  298  7e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.38 
 
 		 350 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>