42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0162 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0162  ImpA domain-containing protein  100 
 
 		 498 aa  947    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2813  hypothetical protein  30.25 
 
 		 508 aa  195  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  28.46 
 
 		 528 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  29.41 
 
 		 533 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  29 
 
 		 533 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  27.95 
 
 		 530 aa  126  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  28.69 
 
 		 533 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  29.2 
 
 		 534 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3656  type VI secretion-associated protein  27.59 
 
 		 527 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983598  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5272  ImpA, N-terminal  27.6 
 
 		 524 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0634  ImpA-like protein  27.75 
 
 		 523 aa  108  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  28.91 
 
 		 789 aa  103  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3616  hypothetical protein  26.27 
 
 		 518 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.432292  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  26.97 
 
 		 790 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  34.45 
 
 		 533 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  33.07 
 
 		 522 aa  70.1  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  24.7 
 
 		 520 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  33.52 
 
 		 518 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5596  ImpA-like  31.98 
 
 		 520 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2910  ImpA domain-containing protein  30.5 
 
 		 791 aa  65.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.401848 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43050  hypothetical protein  35.25 
 
 		 518 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33519  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1125  putative type VI secretion protein VasJ  20.67 
 
 		 513 aa  63.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3721  ImpA domain-containing protein  30.26 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2626  hypothetical protein  25.11 
 
 		 487 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0739443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2129  ImpA domain-containing protein  25.37 
 
 		 487 aa  57  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3222  type VI secretion-associated protein  31.25 
 
 		 487 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0056  ImpA domain-containing protein  26.89 
 
 		 480 aa  53.5  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0325  ImpA domain-containing protein  28.48 
 
 		 462 aa  52  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0398  type VI secretion-associated protein  28.48 
 
 		 462 aa  52  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0235  ImpA domain protein  26.67 
 
 		 470 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0327  ImpA domain-containing protein  26.39 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0400  ImpA domain-containing protein  26.39 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0227  ImpA domain-containing protein  27.74 
 
 		 470 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0229  ImpA domain-containing protein  27.74 
 
 		 470 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.865531  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  28.68 
 
 		 362 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4072  hypothetical protein  28.57 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00713132  unclonable  0.00000101691 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2795  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  34.25 
 
 		 479 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  31.67 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1219  ImpA domain-containing protein  23.74 
 
 		 470 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.192362 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23929  predicted protein  28.16 
 
 		 265 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1208  ImpA domain-containing protein  23.87 
 
 		 469 aa  45.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1082  type VI secretion-associated protein, VC_A0119 family  28.95 
 
 		 475 aa  44.3  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.424761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>