13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0089 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0089  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  889    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.678836  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3838  hypothetical protein  22.63 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1253  hypothetical protein  23.82 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.325224 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1941  hypothetical protein  22.75 
 
 		 428 aa  57  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1771  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  20 
 
 		 740 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0433  hypothetical protein  25.19 
 
 		 426 aa  53.5  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1497  hypothetical protein  26.03 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1610  hypothetical protein  25.17 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000640568  unclonable  5.93437e-23 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1112  hypothetical protein  22.48 
 
 		 433 aa  47  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1720  hypothetical protein  24.46 
 
 		 432 aa  46.6  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26756  normal  0.377885 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  27.84 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42572  Carbamoyl-phosphate synthase L chain  28.68 
 
 		 1105 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0674343 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81265  Phosphoribosylamidoimidazole-succinocarboxamide synthase  23.21 
 
 		 567 aa  43.9  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.630881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>