75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0081 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0081  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 226 aa  454  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.299222  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1738  phosphate uptake regulator, PhoU  59.56 
 
 		 230 aa  268  4e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359006 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1360  transcriptional regulator PhoU  33.33 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1432  phosphate uptake regulator, PhoU  24.04 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  31.48 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2815  transcriptional regulator PhoU  26.15 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1569  transcriptional regulator PhoU  26.15 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289815  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1536  transcriptional regulator PhoU  26.15 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.726746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1437  transcriptional regulator PhoU  26.15 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  32.69 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  32.69 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  26.92 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0265  phosphate uptake regulator, PhoU  39.19 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1307  phosphate uptake regulator, PhoU  29.9 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  31.25 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3165  transcriptional regulator PhoU  27.91 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  27.59 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1224  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.76 
 
 		 240 aa  45.8  0.0006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.123271  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  28 
 
 		 236 aa  45.4  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1504  transcriptional regulator PhoU  28.45 
 
 		 236 aa  45.4  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.682781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1541  transcriptional regulator PhoU  25.78 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1701  transcriptional regulator PhoU  26.83 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2731  transcriptional regulator PhoU  26.56 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0482  phosphate uptake regulator, PhoU  26.24 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.102781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2624  transcriptional regulator PhoU  26.56 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2557  transcriptional regulator PhoU  26.56 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2451  transcriptional regulator PhoU  26.53 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509556  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1912  phosphate uptake regulator, PhoU  25.36 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  35.06 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1726  transcriptional regulator PhoU  26.56 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  31.25 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1148  phosphate uptake regulator, PhoU  32.47 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0480407 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  31.25 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19340  phosphate uptake regulator, PhoU  22.45 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2742  transcriptional regulator PhoU  29.03 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.498773  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  29.69 
 
 		 243 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  29.57 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  31.25 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03148  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.67 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0953  phosphate uptake regulator, PhoU  27.96 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627486  normal  0.0660647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  32.88 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1350  phosphate regulon transcriptional regulator  26.57 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.026739  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1286  phosphate uptake regulator, PhoU  26.57 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  29.63 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  25.45 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  27 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  30.43 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2202  phosphate uptake regulator, PhoU  30 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1909  phosphate uptake regulator, PhoU  26.34 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.553702  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  25.45 
 
 		 232 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.78 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1598  phosphate uptake regulator, PhoU  31.17 
 
 		 235 aa  42.7  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1714  phosphate uptake regulator, PhoU  32.14 
 
 		 237 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0605857  normal  0.609426 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  24.66 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  29.69 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2022  phosphate uptake regulator, PhoU  32.14 
 
 		 237 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0128  phosphate uptake regulator, PhoU  28.72 
 
 		 214 aa  42.4  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.244717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  29 
 
 		 229 aa  42.4  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  32.14 
 
 		 237 aa  42  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  34.38 
 
 		 237 aa  42  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2837  phosphate uptake regulator, PhoU  23.49 
 
 		 214 aa  42  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5153  transcriptional regulator PhoU  29.69 
 
 		 241 aa  42  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.543817 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4088  transcriptional regulator PhoU  29.69 
 
 		 241 aa  42  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1560  phosphate uptake regulator, PhoU  26.42 
 
 		 232 aa  42  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.38 
 
 		 237 aa  42  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4204  transcriptional regulator PhoU  29.69 
 
 		 241 aa  42  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4270  transcriptional regulator PhoU  29.69 
 
 		 241 aa  42  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03552  hypothetical protein  29.69 
 
 		 241 aa  42  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4235  transcriptional regulator PhoU  29.69 
 
 		 241 aa  42  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3939  transcriptional regulator PhoU  29.69 
 
 		 241 aa  42  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1533  phosphate transporter PhoU  30.95 
 
 		 235 aa  41.6  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4243  phosphate uptake regulator, PhoU  29.69 
 
 		 241 aa  42  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03608  negative regulator of PhoR/PhoB two-component regulator  29.69 
 
 		 241 aa  42  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1193  phosphate uptake regulator, PhoU  32.5 
 
 		 234 aa  41.6  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.132592  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1181  phosphate uptake regulator, PhoU  32.5 
 
 		 234 aa  41.6  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>