More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0079 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
545 aa  1075  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  54.3 
 
 
556 aa  532  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  52.44 
 
 
543 aa  520  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  45.64 
 
 
536 aa  435  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  4.73208e-05 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  48.78 
 
 
550 aa  431  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  47.63 
 
 
551 aa  403  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  46.08 
 
 
552 aa  402  1e-110  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  38.07 
 
 
547 aa  306  9e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  36.58 
 
 
576 aa  303  4e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  38.99 
 
 
567 aa  302  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  37.89 
 
 
574 aa  256  1e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.69 
 
 
554 aa  243  8e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.62 
 
 
516 aa  242  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5316  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.16 
 
 
581 aa  241  3e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.4 
 
 
585 aa  239  8e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  34.67 
 
 
543 aa  239  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  37.43 
 
 
574 aa  239  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3077  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 
582 aa  238  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.725388  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  35.76 
 
 
578 aa  233  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.63 
 
 
573 aa  233  8e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  2.54105e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.63 
 
 
557 aa  233  8e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  33.77 
 
 
546 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  34.11 
 
 
582 aa  230  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  35.2 
 
 
575 aa  229  8e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.67 
 
 
495 aa  229  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3608  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
562 aa  229  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  36.59 
 
 
573 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
582 aa  227  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.13 
 
 
557 aa  227  5e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.53 
 
 
502 aa  226  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2918  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 
566 aa  226  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.27 
 
 
591 aa  225  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5159  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.44 
 
 
582 aa  225  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1336  FAD dependent oxidoreductase  36.74 
 
 
545 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3397  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.01 
 
 
557 aa  225  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505029  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2156  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.11 
 
 
517 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  33.7 
 
 
546 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 
569 aa  224  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 
579 aa  223  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  32.85 
 
 
545 aa  222  1e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1368  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.54 
 
 
506 aa  222  1e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1364  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.54 
 
 
506 aa  223  1e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.63 
 
 
502 aa  221  2e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.95 
 
 
605 aa  221  2e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3664  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.25 
 
 
526 aa  220  4e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0488098  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 
554 aa  220  4e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.04 
 
 
502 aa  220  6e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 
525 aa  219  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  34.03 
 
 
603 aa  219  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 
557 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.06 
 
 
514 aa  216  6e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0185895 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  33.79 
 
 
576 aa  216  1e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.02 
 
 
587 aa  216  1e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0228  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.19 
 
 
499 aa  215  1e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.279587  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 
579 aa  215  2e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6538e-07 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  32.89 
 
 
583 aa  215  2e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 
542 aa  214  2e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5335  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.93 
 
 
504 aa  214  3e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  35.58 
 
 
552 aa  213  5e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.52 
 
 
525 aa  213  6e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2106  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.48 
 
 
501 aa  213  6e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  34.18 
 
 
582 aa  213  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2179  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.24 
 
 
510 aa  213  8e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0029  FAD dependent oxidoreductase  36.35 
 
 
555 aa  212  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4642  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.4 
 
 
502 aa  212  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  35.54 
 
 
548 aa  212  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.38 
 
 
567 aa  212  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2576  FAD dependent oxidoreductase  36.13 
 
 
508 aa  212  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  34.15 
 
 
572 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  33.01 
 
 
582 aa  211  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2532  FAD dependent oxidoreductase  35.05 
 
 
545 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.941625  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 
552 aa  209  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2699  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.52 
 
 
511 aa  209  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 
527 aa  209  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 
577 aa  209  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3932  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36 
 
 
500 aa  208  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002673  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.25 
 
 
502 aa  208  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813039  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  34.22 
 
 
531 aa  208  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3651  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
522 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.993987 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4129  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.81 
 
 
500 aa  207  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.95 
 
 
530 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  1.66291e-05 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 
600 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2133  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.11 
 
 
526 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1345  FAD dependent oxidoreductase  33.91 
 
 
532 aa  207  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.12 
 
 
510 aa  206  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.399565  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 
562 aa  206  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 
639 aa  206  6e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5324  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.16 
 
 
503 aa  206  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575956  normal  0.50041 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  34.39 
 
 
595 aa  206  7e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0420  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.27 
 
 
511 aa  206  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.738036 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4217  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.2 
 
 
513 aa  206  8e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1659  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.67 
 
 
491 aa  205  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0674401  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3733  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.87 
 
 
500 aa  205  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  35.3 
 
 
603 aa  205  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 
519 aa  204  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1361  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.25 
 
 
516 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  33.14 
 
 
585 aa  205  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  33.46 
 
 
584 aa  204  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2385  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.48 
 
 
513 aa  204  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.462359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4000  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.36 
 
 
504 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>