86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0059 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0059  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 
866 aa  1753    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1865  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  47.36 
 
 
866 aa  774    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3158  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  45.85 
 
 
868 aa  662    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2903  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  46.24 
 
 
859 aa  657    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603522 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2962  hypothetical protein  45.72 
 
 
869 aa  658    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0301  phosphoenolpyruvate synthase  58.53 
 
 
862 aa  1019    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0321  phosphoenolpyruvate synthase  46.13 
 
 
892 aa  652    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2122  phosphoenolpyruvate synthase  69.69 
 
 
879 aa  1230    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.948545 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3050  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  45.54 
 
 
868 aa  662    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1046  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  42.43 
 
 
864 aa  730    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1253  phosphoenolpyruvate synthase  39.98 
 
 
860 aa  632  1e-179  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3264  phosphoenolpyruvate synthase  41.49 
 
 
896 aa  595  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.882195  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0819  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  41.45 
 
 
878 aa  586  1e-166  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2024  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  42.45 
 
 
881 aa  569  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20058  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0105  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  28.97 
 
 
567 aa  241  5e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0798  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.51 
 
 
585 aa  189  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1678  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.86 
 
 
588 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0280  response regulator receiver protein  29.91 
 
 
995 aa  158  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.979989  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3444  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.44 
 
 
1016 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0467  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.53 
 
 
998 aa  132  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.390764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  23.61 
 
 
432 aa  65.1  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  27.92 
 
 
334 aa  59.3  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  29.31 
 
 
884 aa  58.9  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  21.7 
 
 
891 aa  58.9  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3011  phosphoenolpyruvate synthase  32.92 
 
 
726 aa  58.9  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000544209  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1010  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  37.37 
 
 
725 aa  58.5  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0583662 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  32.7 
 
 
804 aa  57.4  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.24 
 
 
835 aa  57.4  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0708  Pyruvate, water dikinase  29.47 
 
 
923 aa  56.6  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.473538 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4522  phosphoenolpyruvate synthase  29.22 
 
 
799 aa  55.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.364539  normal  0.31692 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2265  XRE family transcriptional regulator  22.91 
 
 
433 aa  55.1  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.796244  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4390  phosphoenolpyruvate synthase  29.22 
 
 
799 aa  55.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2731  pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding  25.96 
 
 
859 aa  54.7  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.19402 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0649  pyruvate, water dikinase  25.72 
 
 
893 aa  52.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  23.4 
 
 
874 aa  52.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  32.76 
 
 
414 aa  52.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  31.11 
 
 
826 aa  51.6  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  26.87 
 
 
873 aa  51.6  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0339  phosphoenolpyruvate synthase  28.92 
 
 
793 aa  51.2  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  26.29 
 
 
779 aa  51.2  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.56 
 
 
821 aa  50.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  26.62 
 
 
795 aa  49.7  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1446  phosphoenolpyruvate synthase  31.91 
 
 
794 aa  49.7  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.529194  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2187  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.6 
 
 
861 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  20.45 
 
 
758 aa  50.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  27.27 
 
 
803 aa  49.7  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1162  phosphoenolpyruvate synthase  27.27 
 
 
799 aa  49.3  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  21.59 
 
 
758 aa  49.3  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.86 
 
 
884 aa  49.3  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  24.19 
 
 
762 aa  49.3  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  26.29 
 
 
885 aa  48.9  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  21.02 
 
 
758 aa  48.9  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3593  PEP-utilising enzyme, mobile region  31.25 
 
 
1097 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1946  pyruvate, water dikinase  33.65 
 
 
1115 aa  48.9  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  21.68 
 
 
761 aa  48.9  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  22.22 
 
 
769 aa  48.5  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  24.24 
 
 
794 aa  48.1  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1565  Pyruvate, water dikinase  27.93 
 
 
871 aa  48.5  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.747222  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  26.29 
 
 
885 aa  47.8  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  24.69 
 
 
865 aa  47.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  21.33 
 
 
868 aa  48.1  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2081  phosphoenolpyruvate synthase  33.67 
 
 
821 aa  47.8  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217364 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  27.67 
 
 
790 aa  47.8  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  24.25 
 
 
810 aa  47.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0098  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  29.6 
 
 
811 aa  47.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  29.7 
 
 
760 aa  47  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  24.36 
 
 
805 aa  47.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  25.64 
 
 
793 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.17 
 
 
950 aa  46.6  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.08 
 
 
840 aa  46.2  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  22.86 
 
 
866 aa  45.8  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1099  phosphoenolpyruvate synthase  26.72 
 
 
814 aa  45.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666444  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28 
 
 
302 aa  45.8  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2164  phosphoenolpyruvate synthase  28.41 
 
 
812 aa  45.4  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.573318 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  27.45 
 
 
801 aa  45.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  28.78 
 
 
788 aa  45.1  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  21.2 
 
 
869 aa  45.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  20.86 
 
 
869 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  25.16 
 
 
812 aa  44.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3918  Pyruvate, water dikinase  27.14 
 
 
842 aa  44.7  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3805  Pyruvate, water dikinase  27.14 
 
 
842 aa  44.7  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  22.12 
 
 
887 aa  44.3  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.58 
 
 
891 aa  44.3  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.22 
 
 
889 aa  44.3  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  25.69 
 
 
906 aa  44.7  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.83 
 
 
887 aa  44.3  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>