More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0053 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1263  FAD linked oxidase domain protein  39.34 
 
 
1202 aa  832    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00018481 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1605  FAD linked oxidase domain protein  38.19 
 
 
1218 aa  801    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4132  FAD linked oxidase domain protein  54.58 
 
 
1292 aa  1421    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48543  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1757  oxidoreductase, putative  55.8 
 
 
1308 aa  1407    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0454  putative oxidoreductase protein  54.01 
 
 
1345 aa  1417    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.306454 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0750  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.44 
 
 
1309 aa  1437    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.886785 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2738  putative oxidoreductase protein  55.47 
 
 
1308 aa  1402    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0789331 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0183  oxidoreductase, FAD-binding  54.52 
 
 
1342 aa  1444    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0329  FAD linked oxidase domain protein  54.1 
 
 
1345 aa  1429    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271253  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0564  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.46 
 
 
1344 aa  1438    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0864  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.75 
 
 
1307 aa  1395    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411484 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1899  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.06 
 
 
1279 aa  1426    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.967348  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4121  hypothetical protein  55.27 
 
 
1291 aa  1443    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0427  hypothetical protein  55.17 
 
 
1324 aa  1454    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0680  oxidoreductase, FAD-binding  54.37 
 
 
1342 aa  1443    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.837218  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0219  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  58.95 
 
 
1259 aa  1520    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.524228  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0778  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.93 
 
 
1265 aa  1360    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.756982 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0842  oxidoreductase, FAD-binding  54.52 
 
 
1342 aa  1446    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3117  FAD linked oxidase domain protein  37.33 
 
 
1212 aa  785    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1511  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.35 
 
 
1218 aa  788    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0793  FAD linked oxidase domain protein  53.75 
 
 
1307 aa  1395    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.147444  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2762  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.35 
 
 
1341 aa  1434    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6062  hypothetical protein  53.9 
 
 
1341 aa  1428    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0954  FAD linked oxidase domain protein  38.92 
 
 
1221 aa  838    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.798871 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1235  oxidoreductase, FAD-binding  37.46 
 
 
1217 aa  787    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0799  oxidoreductase, FAD-binding  37.88 
 
 
1214 aa  803    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.549534  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1652  FAD linked oxidase domain protein  37.75 
 
 
1210 aa  782    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154476  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5464  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.39 
 
 
1304 aa  1420    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279541  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0371  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.09 
 
 
1371 aa  1417    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.717387 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0664  oxidoreductase, FAD-binding  54.52 
 
 
1342 aa  1446    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0690  FAD linked oxidase domain protein  57.21 
 
 
1292 aa  1458    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0550  oxidoreductase, FAD-binding  54.82 
 
 
1359 aa  1446    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2763  oxidoreductase, FAD-binding  54.52 
 
 
1342 aa  1444    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197737  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3018  FAD linked oxidase-like  37.33 
 
 
1213 aa  788    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1288  FAD linked oxidase-like  54.57 
 
 
1307 aa  1416    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0476  FAD linked oxidase-like protein  60.33 
 
 
1271 aa  1581    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0858  FAD linked oxidase-like  54.44 
 
 
1300 aa  1413    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.106319 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2395  oxidoreductase, FAD-binding  54.52 
 
 
1342 aa  1444    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4053  putative oxidoreductase  53.7 
 
 
1349 aa  1455    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0367  FAD linked oxidase-like protein  54.79 
 
 
1324 aa  1454    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985716  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1769  oxidoreductase, FAD-binding, putative  60.06 
 
 
1277 aa  1559    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1445  FAD linked oxidase domain protein  60.06 
 
 
1277 aa  1559    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1604  FAD linked oxidase domain protein  54.8 
 
 
1279 aa  1420    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2123  FAD linked oxidase-like  54.35 
 
 
1341 aa  1434    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2778  FAD linked oxidase domain-containing protein  68.85 
 
 
1289 aa  1816    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.826538  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0545  FAD linked oxidase domain protein  65.18 
 
 
1280 aa  1769    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.650585  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1638  FAD linked oxidase domain-containing protein  67.32 
 
 
1288 aa  1772    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3218  FAD linked oxidase domain protein  37.33 
 
 
1212 aa  786    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2786  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.45 
 
 
1340 aa  1434    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.616835  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0646  FAD linked oxidase domain protein  53.49 
 
 
1364 aa  1458    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.801662  normal  0.70972 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0344  FAD linked oxidase domain protein  54.1 
 
 
1345 aa  1429    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.30676 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2653  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.52 
 
 
1340 aa  1436    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.35 
 
 
1341 aa  1434    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.330233  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0053  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
1286 aa  2643    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2315  oxidoreductase, FAD-binding  54.52 
 
 
1342 aa  1444    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401308  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1309  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.78 
 
 
1292 aa  1344    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1918  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.69 
 
 
1282 aa  1392    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3648  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.94 
 
 
1304 aa  1425    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1789  FAD linked oxidase domain protein  31.56 
 
 
1183 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0377487  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0312  oxidoreductase  30.96 
 
 
1188 aa  513  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0044  FAD linked oxidase domain protein  30.32 
 
 
1183 aa  506  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.559839  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1131  FAD linked oxidase domain protein  29.8 
 
 
1197 aa  486  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2999  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.35 
 
 
1227 aa  419  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0306  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.16 
 
 
1187 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2353  FAD linked oxidase domain protein  34.03 
 
 
1204 aa  252  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251166 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.16 
 
 
469 aa  124  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  26.45 
 
 
987 aa  114  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  25.37 
 
 
456 aa  112  4.0000000000000004e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.5 
 
 
460 aa  108  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.5 
 
 
460 aa  108  7e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.5 
 
 
460 aa  108  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3260  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.94 
 
 
512 aa  107  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.440454 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  26.12 
 
 
485 aa  108  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0140  oxidase, FAD-binding  28.02 
 
 
461 aa  106  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0313  FAD linked oxidase domain protein  28.02 
 
 
461 aa  106  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.28 
 
 
460 aa  105  7e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0425  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.65 
 
 
494 aa  105  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0959  putative glycolate oxidase (FAD-linked subunit) oxidoreductase protein  25.76 
 
 
501 aa  103  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.967814  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1012  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  24.79 
 
 
430 aa  103  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0843  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  21.02 
 
 
418 aa  103  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000303103  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.68 
 
 
459 aa  103  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  23.6 
 
 
500 aa  102  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3638  putative glycolate oxidase (FAD-linked subunit) oxidoreductase protein  24.6 
 
 
504 aa  102  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147047  normal  0.472178 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.63 
 
 
459 aa  102  5e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0650  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.92 
 
 
497 aa  101  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0624  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.92 
 
 
497 aa  101  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.864789  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.76 
 
 
470 aa  101  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  24.76 
 
 
470 aa  101  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  24.76 
 
 
470 aa  101  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  24.76 
 
 
470 aa  101  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.52 
 
 
470 aa  100  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0494  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.16 
 
 
479 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.159289 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  25.94 
 
 
499 aa  101  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  25 
 
 
470 aa  100  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.52 
 
 
470 aa  100  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  24.52 
 
 
470 aa  100  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.66 
 
 
481 aa  99.8  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  24.52 
 
 
460 aa  99.8  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0450  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.62 
 
 
479 aa  100  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  24.58 
 
 
952 aa  100  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>