More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0052 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0052  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 903 aa  1783    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1601  AMP-dependent synthetase and ligase  53.41 
 
 		 887 aa  825    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0145  AMP-dependent synthetase and ligase  29.29 
 
 		 812 aa  410  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00701888  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0785  AMP-dependent synthetase and ligase  29.65 
 
 		 824 aa  395  1e-108  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3746  AMP-dependent synthetase and ligase  27.68 
 
 		 819 aa  334  4e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00175337  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  29.25 
 
 		 918 aa  333  6e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  25.48 
 
 		 829 aa  332  2e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1212  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 		 1557 aa  327  5e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.97717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2216  AMP-dependent synthetase and ligase  30.55 
 
 		 825 aa  320  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108926  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1449  AMP-dependent synthetase and ligase  26.4 
 
 		 826 aa  319  1e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2011  AMP-dependent synthetase and ligase  30.67 
 
 		 825 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64009e-16 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3248  AMP-dependent synthetase and ligase  30.04 
 
 		 1542 aa  313  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.151013 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1677  AMP-binding enzyme/acyltransferase  30.98 
 
 		 824 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1613  AMP-dependent synthetase and ligase:phospholipid/glycerol acyltransferase  30.14 
 
 		 824 aa  305  4.0000000000000003e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000011138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1165  long-chain-fatty-acid CoA ligase  30.1 
 
 		 1537 aa  296  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 		 1538 aa  296  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  30.37 
 
 		 1538 aa  295  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  30.74 
 
 		 811 aa  290  7e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  35.44 
 
 		 612 aa  242  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0942  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  29.06 
 
 		 575 aa  241  5e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236629  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0193  AMP-binding enzyme family protein  32.91 
 
 		 564 aa  239  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  35.26 
 
 		 592 aa  239  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2243  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 		 562 aa  238  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.868297 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0220  AMP-binding protein  32.14 
 
 		 580 aa  228  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  31.27 
 
 		 633 aa  226  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0397  AMP-dependent synthetase and ligase  32.13 
 
 		 580 aa  226  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2969  AMP-dependent synthetase and ligase  27.49 
 
 		 854 aa  224  7e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2472  AMP-dependent synthetase and ligase  27.5 
 
 		 570 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0263  AMP-dependent synthetase and ligase  30.98 
 
 		 564 aa  218  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 		 609 aa  218  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.11 
 
 		 610 aa  217  9e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2191  AMP-dependent synthetase and ligase  31.56 
 
 		 605 aa  217  9e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  29.01 
 
 		 607 aa  214  5.999999999999999e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  29.44 
 
 		 598 aa  214  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  31.51 
 
 		 510 aa  209  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  25.85 
 
 		 662 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 		 633 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.36 
 
 		 610 aa  209  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  28.85 
 
 		 610 aa  209  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  29.91 
 
 		 610 aa  208  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  32.55 
 
 		 504 aa  206  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  31.04 
 
 		 652 aa  204  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1205  AMP-dependent synthetase and ligase  24.44 
 
 		 553 aa  204  5e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1369  AMP-dependent synthetase and ligase  25.9 
 
 		 572 aa  204  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.580064  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.62 
 
 		 598 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  31.09 
 
 		 504 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 		 599 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  30.67 
 
 		 504 aa  201  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  33.19 
 
 		 602 aa  200  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  31.84 
 
 		 602 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3572  AMP-dependent synthetase and ligase  32.38 
 
 		 604 aa  200  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0299599  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  29.1 
 
 		 592 aa  199  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1232  AMP-dependent synthetase and ligase  26.98 
 
 		 576 aa  198  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  32.12 
 
 		 599 aa  198  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0896  AMP-dependent synthetase and ligase  27.03 
 
 		 606 aa  198  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119854  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  29.1 
 
 		 672 aa  196  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  28.98 
 
 		 490 aa  196  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  29.91 
 
 		 504 aa  196  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  31.16 
 
 		 612 aa  196  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  32.54 
 
 		 605 aa  196  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 		 541 aa  196  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  29.46 
 
 		 660 aa  196  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 		 620 aa  195  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0042  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 		 630 aa  195  4e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  33.26 
 
 		 619 aa  194  8e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 603 aa  194  9e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 		 604 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  32.83 
 
 		 507 aa  193  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  28.05 
 
 		 610 aa  193  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  33.04 
 
 		 604 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1619  long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming)  31.77 
 
 		 624 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.19 
 
 		 503 aa  191  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  28.94 
 
 		 669 aa  191  5e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  33.26 
 
 		 599 aa  191  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1362  AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 		 542 aa  191  5.999999999999999e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00632075  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  32.82 
 
 		 604 aa  191  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  31.76 
 
 		 600 aa  190  9e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  29.62 
 
 		 601 aa  190  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.75 
 
 		 514 aa  188  4e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 		 605 aa  188  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4979  AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 		 684 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  28.83 
 
 		 607 aa  187  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  27.51 
 
 		 553 aa  187  8e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  28.31 
 
 		 495 aa  187  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 		 509 aa  187  9e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.429001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 		 603 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  29.61 
 
 		 605 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  33.12 
 
 		 608 aa  187  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  27.74 
 
 		 603 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  30.19 
 
 		 506 aa  187  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  28.48 
 
 		 587 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2186  AMP-binding enzyme family protein  30.96 
 
 		 551 aa  186  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  29.74 
 
 		 597 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  29.74 
 
 		 597 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1274  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 609 aa  185  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000455356 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2556  AMP-dependent synthetase and ligase  29.83 
 
 		 660 aa  185  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  29.74 
 
 		 597 aa  185  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  28.81 
 
 		 596 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  30.98 
 
 		 492 aa  184  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1204  AMP-dependent synthetase and ligase  32.04 
 
 		 609 aa  184  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>