16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0016 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0016  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  325  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1375  hypothetical protein  60.23 
 
 
168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.48826  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2828  hypothetical protein  37.38 
 
 
129 aa  77  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0023  hypothetical protein  35.34 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0996823  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1035  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0540  hypothetical protein  34.57 
 
 
175 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00507326  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2099  hypothetical protein  35.62 
 
 
139 aa  60.5  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4416  hypothetical protein  36.05 
 
 
147 aa  54.3  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.740709 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2332  hypothetical protein  34.23 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00672726  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1398  hypothetical protein  31.4 
 
 
158 aa  52  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2637  hypothetical protein  36.47 
 
 
163 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.813016  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1404  hypothetical protein  35.62 
 
 
131 aa  50.8  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4967  hypothetical protein  23.6 
 
 
132 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683441  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3164  hypothetical protein  27.55 
 
 
135 aa  47.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.147575  normal  0.188251 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4406  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  33.96 
 
 
1112 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000174858 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3445  hypothetical protein  24.19 
 
 
186 aa  41.6  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>