More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0006 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  100 
 
 		 215 aa  425  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  53.66 
 
 		 205 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  51.2 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  52.36 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  54.74 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  53.4 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  52.43 
 
 		 210 aa  188  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  53.4 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  52.38 
 
 		 206 aa  185  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  52.91 
 
 		 210 aa  184  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  49.04 
 
 		 205 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  48.56 
 
 		 205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  55.61 
 
 		 219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  51.46 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  52.94 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  51.44 
 
 		 211 aa  182  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  51.21 
 
 		 200 aa  181  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  51.67 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  51.67 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  51.67 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  50.24 
 
 		 205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  54.97 
 
 		 203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  51.2 
 
 		 206 aa  178  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  51.2 
 
 		 206 aa  178  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  50.97 
 
 		 210 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  48.33 
 
 		 206 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  51.94 
 
 		 210 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 210 aa  178  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  50.72 
 
 		 206 aa  177  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  47 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  48.34 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  49.76 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  51.2 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  47.57 
 
 		 203 aa  174  8e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  51.46 
 
 		 212 aa  174  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  46.8 
 
 		 204 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  49.52 
 
 		 206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  49.52 
 
 		 206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  49.52 
 
 		 206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  49.52 
 
 		 206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  49.52 
 
 		 206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  47.37 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  49.52 
 
 		 206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  49.52 
 
 		 206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 223 aa  168  5e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  44.13 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  48.33 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  41.26 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  45.19 
 
 		 212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  43.28 
 
 		 217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  45.88 
 
 		 214 aa  161  8.000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1487  thymidylate kinase  43.2 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.396843  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  40.87 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1276  thymidylate kinase  47.52 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.823229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1986  thymidylate kinase  47.52 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000464686  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1299  thymidylate kinase  47.52 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.160764  hitchhiker  0.0000000000000573213 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2169  thymidylate kinase  47.52 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000154462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1314  thymidylate kinase  47.52 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000054513 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  44.78 
 
 		 211 aa  159  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  44.44 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  40.78 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  40.78 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0877  dTMP kinase  50 
 
 		 221 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  46.34 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2029  thymidylate kinase  44.93 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000357383  hitchhiker  0.00000127305 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  49.75 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1613  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 213 aa  154  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000848369  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01094  thymidylate kinase  45.37 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00390554  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2549  dTMP kinase  45.37 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000242114  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2226  thymidylate kinase  45.37 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000221684  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1219  thymidylate kinase  45.37 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000291901  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01102  hypothetical protein  45.37 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00374424  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2503  thymidylate kinase  45.37 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  unclonable  0.0000000113108 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1477  thymidylate kinase  45.15 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000124035  hitchhiker  0.000000000959374 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1220  thymidylate kinase  45.37 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000082141  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  44.29 
 
 		 705 aa  153  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  44.23 
 
 		 671 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  39.22 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  46.67 
 
 		 217 aa  151  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  44.88 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  43.48 
 
 		 686 aa  150  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3493  thymidylate kinase  43.69 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000071243  normal  0.0320777 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1583  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000489849  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1691  thymidylate kinase  43.69 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0210927  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0330  thymidylate kinase  38.83 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2503  thymidylate kinase  51.32 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33464  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  42.92 
 
 		 703 aa  150  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  46.19 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl676  thymidylate kinase  38.61 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  44.6 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  45.67 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2245  thymidylate kinase  41.63 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0597865  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  38.65 
 
 		 213 aa  148  5e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  42.72 
 
 		 213 aa  148  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  42.72 
 
 		 688 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2043  thymidylate kinase  41.71 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.745773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  41.83 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1628  thymidylate kinase  44.39 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>