28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5274 on replicon NC_009974
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009974  Haur_5274  hypothetical protein  100 
 
 
519 aa  1068    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  35.34 
 
 
506 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0737  hypothetical protein  35.58 
 
 
509 aa  274  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0391  hypothetical protein  24.05 
 
 
571 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000199178 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  28.57 
 
 
588 aa  68.6  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4944  AAA ATPase  31.37 
 
 
540 aa  63.9  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.051172  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  26.29 
 
 
461 aa  60.1  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  31.78 
 
 
530 aa  60.1  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  28.47 
 
 
601 aa  57  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  32.47 
 
 
228 aa  50.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  23.33 
 
 
482 aa  50.1  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  22.33 
 
 
455 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0855  SMC domain-containing protein  28.57 
 
 
556 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0223965  normal  0.062418 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1004  hypothetical protein  25.9 
 
 
567 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0319616 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  25.93 
 
 
176 aa  48.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  29.63 
 
 
540 aa  48.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  27.51 
 
 
454 aa  48.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  34.85 
 
 
619 aa  47  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  21.43 
 
 
582 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  24.51 
 
 
452 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  28.57 
 
 
533 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1204  hypothetical protein  32.22 
 
 
567 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530833  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1522  hypothetical protein  30.77 
 
 
709 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.541364  hitchhiker  0.00000000000000176755 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  24.7 
 
 
440 aa  45.4  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  30.99 
 
 
484 aa  44.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  30.23 
 
 
437 aa  44.3  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  24.84 
 
 
457 aa  43.9  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  25.27 
 
 
562 aa  43.5  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>