24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5240 on replicon NC_009974
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009974  Haur_5240  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like  100 
 
 		 779 aa  1610    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  28.1 
 
 		 629 aa  87.4  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.54 
 
 		 629 aa  79.7  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5109  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like  24.95 
 
 		 695 aa  79.3  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  25.81 
 
 		 608 aa  70.9  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  21.66 
 
 		 611 aa  64.7  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  31.78 
 
 		 631 aa  64.3  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  22.92 
 
 		 621 aa  63.9  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  23.68 
 
 		 569 aa  61.2  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  24.48 
 
 		 866 aa  57  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.73 
 
 		 595 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  28.57 
 
 		 630 aa  55.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23 
 
 		 1043 aa  55.1  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1617  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system, conserved region  24.28 
 
 		 819 aa  51.6  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1296  AAA ATPase  40 
 
 		 537 aa  50.4  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0819436 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  21.61 
 
 		 747 aa  49.7  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7298  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.8 
 
 		 696 aa  48.9  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  0.0433123 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0034  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  23.93 
 
 		 711 aa  47.8  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5435  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  26.94 
 
 		 515 aa  47  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0162  hypothetical protein  29.59 
 
 		 591 aa  46.2  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.222598  normal  0.0745617 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  30 
 
 		 616 aa  46.6  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1395  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  33.33 
 
 		 616 aa  45.8  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0290868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2211  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  34.83 
 
 		 618 aa  45.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0179  membrane bound ATPase, putative  23.17 
 
 		 955 aa  44.7  0.006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>