More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4997 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4997  SAM-dependent methyltransferase-like  100 
 
 
334 aa  691    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4306  hypothetical protein  31.88 
 
 
318 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3633  hypothetical protein  32.67 
 
 
321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1561  hypothetical protein  31.52 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207063  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02689  methyltransferase  30.2 
 
 
310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3872  hypothetical protein  32.27 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1709  hypothetical protein  27.87 
 
 
396 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.44914  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3577  SAM-dependent methyltransferase-like protein  32.1 
 
 
308 aa  110  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.586441 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0070  hypothetical protein  30.95 
 
 
338 aa  109  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  27.07 
 
 
389 aa  108  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1143  hypothetical protein  37.58 
 
 
321 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1918  hypothetical protein  30.45 
 
 
318 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003801  methyltransferase  29.39 
 
 
310 aa  107  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46250  hypothetical protein  34.15 
 
 
313 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0321722  normal  0.0483373 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  28 
 
 
397 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0968  hypothetical protein  28.19 
 
 
418 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000850762  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3932  hypothetical protein  39.1 
 
 
313 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3530  hypothetical protein  30.2 
 
 
313 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.524505  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  26.92 
 
 
400 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  27.61 
 
 
397 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0196  SAM-dependent methyltransferase  27.48 
 
 
396 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2337  hypothetical protein  29.92 
 
 
320 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.623791 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2527  hypothetical protein  35.9 
 
 
320 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3598  hypothetical protein  27.54 
 
 
338 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3799  SAM-dependent methyltransferase  24.6 
 
 
395 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  25.08 
 
 
396 aa  98.2  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3144  hypothetical protein  28.88 
 
 
402 aa  96.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  25.24 
 
 
396 aa  96.3  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1149  SAM-dependent methyltransferase  25.24 
 
 
396 aa  96.3  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  25.24 
 
 
396 aa  96.3  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.64 
 
 
708 aa  95.9  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3685  SAM-dependent methyltransferase  26.79 
 
 
395 aa  95.1  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  30.54 
 
 
397 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3279  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.27 
 
 
715 aa  95.9  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0766  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.65 
 
 
768 aa  95.1  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.1454 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0772  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.97 
 
 
776 aa  95.1  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.829763 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02391  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase activity and a PUA domain  25 
 
 
397 aa  95.1  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.907564  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  24.92 
 
 
396 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3155  SAM-dependent methyltransferase  24.57 
 
 
411 aa  94.7  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0805  SAM-dependent methyltransferase  27.44 
 
 
395 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.969032 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3432  PUA domain-containing protein  30.58 
 
 
394 aa  94  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1701  hypothetical protein  29.91 
 
 
302 aa  94.4  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000328328  normal  0.027964 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  23.41 
 
 
396 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1368  PUA domain containing protein  26.6 
 
 
397 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  27.92 
 
 
397 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2228  hypothetical protein  29.15 
 
 
306 aa  93.2  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.581502  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00978  hypothetical protein  23.9 
 
 
367 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.536136  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00971  predicted methyltransferase  23.9 
 
 
367 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.406744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  23.9 
 
 
391 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  23.9 
 
 
396 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  23.9 
 
 
396 aa  93.2  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  26.49 
 
 
399 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2777  hypothetical protein  29.51 
 
 
305 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00142049  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  25.79 
 
 
396 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  25.79 
 
 
396 aa  92.8  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2932  PUA domain-containing protein  24.27 
 
 
396 aa  92.8  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  25.79 
 
 
396 aa  92.8  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3390  PUA domain-containing protein  24.27 
 
 
396 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1062  SAM-dependent methyltransferase  27.59 
 
 
422 aa  92.8  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  26.49 
 
 
399 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  29.96 
 
 
400 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4435  hypothetical protein  26.24 
 
 
399 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1686  hypothetical protein  29.51 
 
 
305 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000452263  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4260  hypothetical protein  26.85 
 
 
335 aa  92.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00951955 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  26.24 
 
 
399 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  25.79 
 
 
403 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3313  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  29.68 
 
 
314 aa  92.4  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4368  PUA domain-containing protein  25.86 
 
 
399 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1063  PUA domain containing protein  24.27 
 
 
396 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3515  PUA domain-containing protein  24.27 
 
 
396 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.498444 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4274  methyltransferase  26.49 
 
 
399 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.314948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0587  hypothetical protein  26.49 
 
 
399 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  24.58 
 
 
396 aa  91.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3294  PUA domain-containing protein  24.27 
 
 
396 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4666  hypothetical protein  26.49 
 
 
399 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2680  hypothetical protein  29.51 
 
 
305 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00757466  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4653  hypothetical protein  26.49 
 
 
399 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2995  SAM-dependent methyltransferase  26.07 
 
 
395 aa  91.3  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  24.82 
 
 
396 aa  90.9  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  25.79 
 
 
403 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02010  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.74 
 
 
699 aa  90.9  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.347097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3385  putative RNA methylase  27.97 
 
 
412 aa  90.5  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  25.79 
 
 
403 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  25.79 
 
 
403 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  30.4 
 
 
712 aa  90.9  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  25.79 
 
 
403 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4285  methyltransferase  26.12 
 
 
399 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3236  PUA domain-containing protein  26.12 
 
 
399 aa  90.5  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.553903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  27.6 
 
 
318 aa  90.5  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.94 
 
 
711 aa  90.1  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  28.43 
 
 
404 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  28.43 
 
 
404 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  28.43 
 
 
404 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1161  hypothetical protein  34.87 
 
 
320 aa  89.7  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2881  SAM-dependent methyltransferases  30.99 
 
 
305 aa  89.7  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4037  PUA domain-containing protein  23.55 
 
 
397 aa  89.4  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663766  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3930  protein of unknown function Met10  25.58 
 
 
479 aa  89.7  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2890  hypothetical protein  32.7 
 
 
302 aa  89.4  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0038147  hitchhiker  0.00000713173 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4172  hypothetical protein  29.7 
 
 
338 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  27.52 
 
 
404 aa  89.4  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>