More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4981 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4981  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
250 aa  512  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000483357  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  71.63 
 
 
264 aa  328  4e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  69.81 
 
 
268 aa  324  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  70.28 
 
 
268 aa  323  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  62.42 
 
 
179 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.95 
 
 
179 aa  208  6e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.94 
 
 
200 aa  207  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.94 
 
 
200 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.94 
 
 
200 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  59.35 
 
 
173 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.16 
 
 
225 aa  206  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  63.27 
 
 
178 aa  205  6e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  56.8 
 
 
202 aa  204  7e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.18 
 
 
251 aa  204  9e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  60.93 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.72 
 
 
226 aa  199  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  58.17 
 
 
170 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  58.06 
 
 
172 aa  198  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  61.54 
 
 
166 aa  198  9e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  57.82 
 
 
213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.54 
 
 
170 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  57.42 
 
 
172 aa  196  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  58.11 
 
 
179 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  58.11 
 
 
179 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  58.11 
 
 
179 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  58.11 
 
 
172 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  58.11 
 
 
172 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  58.11 
 
 
172 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  59.6 
 
 
182 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  58.11 
 
 
172 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  58.11 
 
 
172 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  58.11 
 
 
172 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  56.25 
 
 
216 aa  195  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2157  NADH dehydrogenase subunit B  53.59 
 
 
193 aa  195  6e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00451511 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.84 
 
 
170 aa  195  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1606  NADH dehydrogenase subunit B  58.17 
 
 
190 aa  195  6e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  58.11 
 
 
170 aa  195  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0843  NADH dehydrogenase subunit B  58.17 
 
 
190 aa  195  7e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  56.41 
 
 
184 aa  195  7e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.14 
 
 
169 aa  195  7e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  47.8 
 
 
794 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.24 
 
 
167 aa  194  9e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  57.52 
 
 
190 aa  193  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1872  NADH dehydrogenase subunit B  57.52 
 
 
189 aa  193  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.26 
 
 
170 aa  192  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  59.86 
 
 
183 aa  192  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  58.33 
 
 
793 aa  192  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  63.04 
 
 
170 aa  192  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0845  NADH dehydrogenase subunit B  57.52 
 
 
189 aa  192  5e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0962  NADH dehydrogenase subunit B  56.86 
 
 
189 aa  191  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.662255  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1358  NADH dehydrogenase subunit B  55.63 
 
 
213 aa  191  8e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  55.1 
 
 
159 aa  191  9e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  57.64 
 
 
159 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  54 
 
 
792 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  46.31 
 
 
794 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  54.55 
 
 
199 aa  190  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02800  conserved hypothetical protein  56.95 
 
 
250 aa  190  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.71 
 
 
180 aa  190  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.27 
 
 
183 aa  190  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.18 
 
 
183 aa  189  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  58 
 
 
167 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  56.94 
 
 
159 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  53.61 
 
 
220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1370  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.61 
 
 
220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00721379  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2441  NADH dehydrogenase subunit B  53.61 
 
 
220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.675859  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5969  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  60.56 
 
 
188 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2580  NADH dehydrogenase subunit B  53.61 
 
 
220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02172  hypothetical protein  53.61 
 
 
220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0664  NADH dehydrogenase (quinone)  63.04 
 
 
173 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3426  NADH dehydrogenase subunit B  53.61 
 
 
220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101338  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  48 
 
 
791 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1365  NADH dehydrogenase subunit B  53.61 
 
 
220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  55.06 
 
 
167 aa  189  2.9999999999999997e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0787  NADH dehydrogenase subunit B  56.41 
 
 
179 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  53.61 
 
 
220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  59.18 
 
 
174 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2045  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.5 
 
 
196 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0111546  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2436  NADH dehydrogenase subunit B  53.61 
 
 
220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  56.25 
 
 
159 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  57.62 
 
 
182 aa  189  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1617  NADH dehydrogenase subunit B  54.55 
 
 
161 aa  189  4e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.025993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  63.5 
 
 
170 aa  189  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0546  NADH dehydrogenase subunit B  54.55 
 
 
161 aa  189  4e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  56.25 
 
 
159 aa  189  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0288  NADH dehydrogenase subunit B  54.27 
 
 
185 aa  189  5e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0629592  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  52.29 
 
 
168 aa  189  5e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1556  NADH dehydrogenase subunit B  54.97 
 
 
185 aa  188  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.632474  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1657  NADH dehydrogenase subunit B  59.31 
 
 
170 aa  188  7e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  57.24 
 
 
179 aa  188  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.24 
 
 
176 aa  188  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  60.27 
 
 
173 aa  188  8e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0744  NADH dehydrogenase subunit B  56.69 
 
 
189 aa  188  9e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2466  NADH dehydrogenase subunit B  53.01 
 
 
220 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000315164  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2555  NADH dehydrogenase subunit B  53.01 
 
 
220 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225165  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2673  NADH dehydrogenase subunit B  53.01 
 
 
220 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104558  normal  0.525556 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  59.71 
 
 
166 aa  187  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  59.86 
 
 
226 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2511  NADH dehydrogenase subunit B  53.01 
 
 
220 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0438233  normal  0.552577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2566  NADH dehydrogenase subunit B  53.01 
 
 
220 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112494  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>