More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4944 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4944  ribosomal protein S9  100 
 
 
132 aa  263  8e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1154  ribosomal protein S9  64.39 
 
 
132 aa  174  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.252489  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2993  ribosomal protein S9  61.36 
 
 
132 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.113743  hitchhiker  0.00813341 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3995  ribosomal protein S9  62.12 
 
 
132 aa  169  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.850021  hitchhiker  0.000512267 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0746  ribosomal protein S9  60.94 
 
 
134 aa  153  9e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  55.3 
 
 
130 aa  141  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  58.27 
 
 
131 aa  140  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  59.68 
 
 
130 aa  140  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  55.3 
 
 
132 aa  140  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  55.3 
 
 
130 aa  140  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  58.27 
 
 
130 aa  140  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000147442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  53.03 
 
 
130 aa  139  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  53.79 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  52.27 
 
 
131 aa  137  4.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  55.81 
 
 
130 aa  137  6e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  56.82 
 
 
130 aa  137  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  53.49 
 
 
130 aa  137  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  54.33 
 
 
130 aa  136  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  53.79 
 
 
130 aa  135  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  53.79 
 
 
130 aa  135  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  53.03 
 
 
130 aa  135  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2613  30S ribosomal protein S9  56 
 
 
169 aa  135  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4677  ribosomal protein S9  52.76 
 
 
130 aa  135  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.278967  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  53.03 
 
 
130 aa  135  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  53.54 
 
 
130 aa  133  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0722  ribosomal protein S9  52.76 
 
 
130 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0382  30S ribosomal protein S9  53.54 
 
 
130 aa  133  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0184231  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0367  30S ribosomal protein S9  53.54 
 
 
130 aa  133  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000448381  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  51.52 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0454  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 
130 aa  133  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0255963  normal  0.796217 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0056  SSU ribosomal protein S9P  53.12 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128063  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  51.52 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2726  ribosomal protein S9  49.24 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000561308  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3451  30S ribosomal protein S9  51.52 
 
 
130 aa  131  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0078135 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  52.71 
 
 
130 aa  131  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0650  SSU ribosomal protein S9P  52.71 
 
 
130 aa  131  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.4124e-16  normal  0.0939463 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0014  ribosomal protein S9  53.79 
 
 
130 aa  131  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  52.71 
 
 
130 aa  130  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  52.71 
 
 
130 aa  130  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  53.23 
 
 
130 aa  130  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  51.94 
 
 
130 aa  130  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5913  30S ribosomal protein S9  51.18 
 
 
130 aa  130  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.208895  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2342  30S ribosomal protein S9  52.76 
 
 
130 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1116  30S ribosomal protein S9  52.76 
 
 
130 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3420  30S ribosomal protein S9  52.76 
 
 
130 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000202027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3377  30S ribosomal protein S9  52.76 
 
 
130 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000325455  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2520  30S ribosomal protein S9  52.76 
 
 
130 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0254  30S ribosomal protein S9  52.76 
 
 
130 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3413  30S ribosomal protein S9  52.76 
 
 
130 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0107857  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  54.26 
 
 
130 aa  130  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  54.84 
 
 
170 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2703  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490029  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0870  ribosomal protein S9  51.94 
 
 
167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1234  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000854245  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  53.49 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  50.76 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0605  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0491  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0372353  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0626  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2639  30S ribosomal protein S9  50.78 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17438  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3766  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658387  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0197  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202545  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  50.76 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2241  SSU ribosomal protein S9P  53.79 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201316  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0647  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00285977  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0680  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000222538  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0104  30S ribosomal protein S9  49.24 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000569691  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 
130 aa  128  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0719  30S ribosomal protein S9  51.59 
 
 
138 aa  128  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000482758  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4112  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 
130 aa  128  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  50 
 
 
130 aa  128  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0501  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 
130 aa  128  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0600  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 
130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000648007  normal  0.790405 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  53.03 
 
 
130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0574  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 
130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443027  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0141  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 
130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  50 
 
 
130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  49.61 
 
 
174 aa  127  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0483  30S ribosomal protein S9  50 
 
 
132 aa  127  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4052  30S ribosomal protein S9  48.82 
 
 
130 aa  126  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.809908  normal  0.564948 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  52.8 
 
 
162 aa  126  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  47.73 
 
 
130 aa  126  9.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  46.03 
 
 
130 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5159  ribosomal protein S9  52 
 
 
169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623801  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_448  ribosomal protein S9  49.24 
 
 
132 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000184365  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  49.21 
 
 
129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0662  30S ribosomal protein S9  54.76 
 
 
132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.219101  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44376  Putative mitochondrial ribosomal protein S9  51.61 
 
 
137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.272268  normal  0.0615746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0890  30S ribosomal protein S9  53.97 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>