More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4934 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4934  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 		 439 aa  865    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000290796  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1165  preprotein translocase, SecY subunit  60.84 
 
 		 450 aa  528  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000330141  normal  0.11389 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4006  preprotein translocase, SecY subunit  60.18 
 
 		 450 aa  518  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000605815  hitchhiker  0.000026914 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3004  preprotein translocase, SecY subunit  59.96 
 
 		 450 aa  487  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.339766  normal  0.010011 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0735  preprotein translocase, SecY subunit  56.18 
 
 		 433 aa  455  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  47.38 
 
 		 418 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0494  preprotein translocase subunit SecY  48.55 
 
 		 438 aa  380  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.443171  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_436  preprotein translocase subunit SecY  48.33 
 
 		 438 aa  378  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0195945  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0471  preprotein translocase subunit SecY  47.66 
 
 		 438 aa  376  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00922913  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  44.44 
 
 		 420 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  46.08 
 
 		 424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  45.23 
 
 		 421 aa  352  5e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  43.64 
 
 		 419 aa  348  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  42.73 
 
 		 421 aa  347  3e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  44.09 
 
 		 429 aa  345  8e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  44.67 
 
 		 430 aa  344  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  44.2 
 
 		 435 aa  344  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  43.86 
 
 		 419 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  42.53 
 
 		 429 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  43.92 
 
 		 419 aa  338  9.999999999999999e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1374  preprotein translocase subunit SecY  41.67 
 
 		 431 aa  335  1e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0289241  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1312  preprotein translocase subunit SecY  42.79 
 
 		 431 aa  334  2e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000457849  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  42.73 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  40.44 
 
 		 428 aa  334  2e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  41.76 
 
 		 422 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  42.02 
 
 		 423 aa  326  6e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  41.69 
 
 		 447 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0125  preprotein translocase subunit SecY  41.81 
 
 		 433 aa  323  5e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00395698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0151  preprotein translocase subunit SecY  42.04 
 
 		 433 aa  322  6e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  43.08 
 
 		 430 aa  322  7e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  41.46 
 
 		 447 aa  322  7e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5175  preprotein translocase subunit SecY  41.59 
 
 		 433 aa  322  8e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000485174  unclonable  4.1263e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0130  preprotein translocase subunit SecY  41.81 
 
 		 433 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0130  preprotein translocase subunit SecY  41.81 
 
 		 433 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00164171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0126  preprotein translocase subunit SecY  41.81 
 
 		 433 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0265701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0124  preprotein translocase subunit SecY  41.81 
 
 		 433 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64549  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  41.46 
 
 		 435 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0130  preprotein translocase subunit SecY  41.81 
 
 		 433 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00952483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0161  preprotein translocase subunit SecY  41.81 
 
 		 433 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1554  preprotein translocase, SecY subunit  43.34 
 
 		 424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0492066  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  39.95 
 
 		 437 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  40.85 
 
 		 435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  40.89 
 
 		 441 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1118  preprotein translocase subunit SecY  40.99 
 
 		 428 aa  319  5e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.348488  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  40.18 
 
 		 438 aa  319  7e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  40.3 
 
 		 445 aa  318  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  41.63 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  40.72 
 
 		 419 aa  318  1e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2694  preprotein translocase subunit SecY  40.23 
 
 		 425 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  41.7 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  39.82 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  42.12 
 
 		 430 aa  318  2e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2379  preprotein translocase subunit SecY  39.91 
 
 		 425 aa  318  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  41.4 
 
 		 448 aa  317  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  41.27 
 
 		 431 aa  317  3e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  40.09 
 
 		 435 aa  317  4e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  41.46 
 
 		 447 aa  316  6e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  37.98 
 
 		 435 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  40.48 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  40.48 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  40.48 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  39.59 
 
 		 435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  40 
 
 		 426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  40.66 
 
 		 439 aa  312  6.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  38.79 
 
 		 435 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  38.79 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2766  preprotein translocase subunit SecY  40.13 
 
 		 434 aa  311  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00224272  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  38.69 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  41.69 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  40.49 
 
 		 430 aa  310  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2503  preprotein translocase subunit SecY  40.13 
 
 		 434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2747  preprotein translocase subunit SecY  40.35 
 
 		 434 aa  310  4e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.787541  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  38.84 
 
 		 444 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  38.84 
 
 		 444 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2887  preprotein translocase, SecY subunit  40.41 
 
 		 441 aa  310  4e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0626195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  41.27 
 
 		 428 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  41.93 
 
 		 432 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2412  preprotein translocase subunit SecY  39.91 
 
 		 434 aa  308  8e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00625491  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  40.23 
 
 		 442 aa  308  8e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2469  preprotein translocase subunit SecY  40.13 
 
 		 434 aa  308  9e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0545369  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2742  preprotein translocase subunit SecY  39.91 
 
 		 434 aa  308  9e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53667e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2545  preprotein translocase subunit SecY  40.13 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778926 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  39 
 
 		 442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  39 
 
 		 442 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  40.13 
 
 		 436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  38.32 
 
 		 442 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  38.37 
 
 		 443 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  38.37 
 
 		 443 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  38.1 
 
 		 443 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1147  preprotein translocase, SecY subunit  40.31 
 
 		 445 aa  307  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  39.68 
 
 		 443 aa  307  3e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0780  preprotein translocase subunit SecY  40.97 
 
 		 457 aa  307  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  38.6 
 
 		 443 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  39.37 
 
 		 441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3647  preprotein translocase, SecY subunit  39.78 
 
 		 442 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00118801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2547  preprotein translocase subunit SecY  39.69 
 
 		 434 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673869  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  39.82 
 
 		 443 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2734  preprotein translocase subunit SecY  39.69 
 
 		 434 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.356112  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  39.82 
 
 		 443 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2599  preprotein translocase subunit SecY  42.89 
 
 		 440 aa  306  6e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0785292  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>