More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4930 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  100 
 
 
121 aa  241  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  69.42 
 
 
120 aa  159  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  61.48 
 
 
125 aa  157  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  63.64 
 
 
118 aa  148  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  62.81 
 
 
118 aa  147  5e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  61.16 
 
 
122 aa  146  1e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  59.66 
 
 
120 aa  145  2e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  5.04342e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  60.33 
 
 
121 aa  144  6e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.58089e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0490  50S ribosomal protein L18  60.33 
 
 
121 aa  143  7e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0467  50S ribosomal protein L18  60.33 
 
 
121 aa  143  7e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  7.81328e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  57.98 
 
 
124 aa  142  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  5.00708e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  58.82 
 
 
120 aa  141  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  58.68 
 
 
117 aa  140  7e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1169  50S ribosomal protein L18  66.67 
 
 
121 aa  139  1e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0336131  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  65.18 
 
 
127 aa  139  1e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  64.81 
 
 
128 aa  139  2e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  58.68 
 
 
118 aa  139  2e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  5.95755e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  58.68 
 
 
119 aa  138  2e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  66 
 
 
121 aa  138  2e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  7.37084e-06  hitchhiker  6.40833e-05 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  58.26 
 
 
122 aa  138  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  59.82 
 
 
118 aa  138  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  56.3 
 
 
120 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  56.3 
 
 
120 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  64.35 
 
 
121 aa  137  4e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  57.85 
 
 
120 aa  137  5e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  54.55 
 
 
122 aa  137  5e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.6259e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  57.85 
 
 
120 aa  137  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.40079e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  57.85 
 
 
120 aa  137  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  57.85 
 
 
120 aa  137  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.02498e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  57.85 
 
 
120 aa  137  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.09054e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  57.85 
 
 
120 aa  137  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.39258e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  57.85 
 
 
120 aa  137  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.09989e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  57.85 
 
 
120 aa  137  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  6.18216e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  59.35 
 
 
120 aa  136  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  67.68 
 
 
122 aa  136  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  57.85 
 
 
120 aa  135  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.11819e-09  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  67.68 
 
 
122 aa  136  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.99642e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  57.98 
 
 
120 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  57.02 
 
 
120 aa  135  3e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  5.38516e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  57.85 
 
 
120 aa  134  3e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  5.42863e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  57.02 
 
 
118 aa  134  6e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  62.61 
 
 
124 aa  134  6e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0598  50S ribosomal protein L18  61.74 
 
 
124 aa  133  7e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  52.94 
 
 
120 aa  133  9e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  58.93 
 
 
122 aa  132  1e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  57.02 
 
 
121 aa  132  1e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  56.2 
 
 
120 aa  132  1e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  55.37 
 
 
119 aa  131  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  55.37 
 
 
120 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  59.09 
 
 
128 aa  131  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4491  ribosomal protein L18  61.61 
 
 
136 aa  130  8e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  53.72 
 
 
119 aa  129  1e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  51.24 
 
 
120 aa  129  1e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  54.92 
 
 
122 aa  129  1e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  51.24 
 
 
122 aa  129  1e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  63.37 
 
 
120 aa  129  1e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  53.72 
 
 
119 aa  129  1e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2202  50S ribosomal protein L18  68.09 
 
 
120 aa  129  2e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0988305  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  54.92 
 
 
122 aa  129  2e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  50.41 
 
 
122 aa  128  2e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  52.1 
 
 
116 aa  128  3e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  57.39 
 
 
119 aa  128  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  55 
 
 
124 aa  127  7e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  54.7 
 
 
124 aa  127  7e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20710  LSU ribosomal protein L18P  60.71 
 
 
124 aa  127  7e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  52.94 
 
 
115 aa  126  9e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  56.1 
 
 
119 aa  126  1e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  48.76 
 
 
122 aa  126  1e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  4.55959e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  56.1 
 
 
119 aa  126  1e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1348  50S ribosomal protein L18  58.62 
 
 
120 aa  125  2e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  4.32903e-05  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  59.46 
 
 
119 aa  125  2e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04140  LSU ribosomal protein L18P  55.56 
 
 
134 aa  125  2e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1002  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 
120 aa  125  2e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.168724  hitchhiker  0.00975315 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3889  50S ribosomal protein L18P  56.56 
 
 
127 aa  125  2e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 
120 aa  125  2e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1446  50S ribosomal protein L18  58.62 
 
 
120 aa  125  2e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267488 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3690  ribosomal protein L18  57.8 
 
 
134 aa  124  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  2.55511e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0603  ribosomal protein L18  60.71 
 
 
123 aa  125  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.415443  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  59.82 
 
 
121 aa  124  4e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1723  50S ribosomal protein L18  60.91 
 
 
123 aa  124  4e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00474742  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3127  ribosomal protein L18  58.04 
 
 
125 aa  124  4e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2385  50S ribosomal protein L18  59.5 
 
 
115 aa  124  4e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00226335  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19881  50S ribosomal protein L18  51.64 
 
 
122 aa  124  4e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1114  50S ribosomal protein L18  51.64 
 
 
122 aa  124  4e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2672  50S ribosomal protein L18P  58.47 
 
 
120 aa  124  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1337  50S ribosomal protein L18  66.32 
 
 
118 aa  124  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  53.04 
 
 
122 aa  123  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3401  ribosomal protein L18  55.65 
 
 
134 aa  123  8e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  55.88 
 
 
122 aa  123  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1168  ribosomal protein L18  63.64 
 
 
113 aa  122  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.257071  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2463  50S ribosomal protein L18  63.16 
 
 
120 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2982  50S ribosomal protein L18  65.26 
 
 
120 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.864504  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2185  50S ribosomal protein L18  63.16 
 
 
120 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.954863  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0714  50S ribosomal protein L18  52.54 
 
 
120 aa  121  3e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0742927  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  54.62 
 
 
119 aa  121  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  55.36 
 
 
126 aa  121  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.642153 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  52.46 
 
 
122 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0210  LSU ribosomal protein L18P  54.55 
 
 
121 aa  121  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0545165  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  55.36 
 
 
117 aa  120  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  2.57389e-05  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29580  LSU ribosomal protein L18P  57.14 
 
 
123 aa  120  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100392  normal  0.753343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>