More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4921 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4921  ribosomal protein S3  100 
 
 		 230 aa  472  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0969238  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  79.02 
 
 		 260 aa  340  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  74.11 
 
 		 262 aa  338  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3018  ribosomal protein S3  69.51 
 
 		 241 aa  319  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0195481  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0721  ribosomal protein S3  62.1 
 
 		 226 aa  276  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  60.95 
 
 		 219 aa  273  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  60.98 
 
 		 219 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  58.64 
 
 		 226 aa  268  5e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0568  30S ribosomal protein S3  59.8 
 
 		 278 aa  267  8.999999999999999e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3429  ribosomal protein S3  57.53 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  59.02 
 
 		 229 aa  262  3e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  56.07 
 
 		 221 aa  261  8e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1046  30S ribosomal protein S3  56.96 
 
 		 287 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6608  ribosomal protein S3  55.26 
 
 		 275 aa  260  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1019  30S ribosomal protein S3  56.96 
 
 		 287 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1036  30S ribosomal protein S3  56.96 
 
 		 287 aa  260  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10721  30S ribosomal protein S3  59.42 
 
 		 274 aa  259  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.680794  normal  0.235718 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  52.47 
 
 		 224 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  52.47 
 
 		 224 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4315  ribosomal protein S3  58.62 
 
 		 272 aa  258  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1092  SSU ribosomal protein S3P  58.62 
 
 		 288 aa  258  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6043  30S ribosomal protein S3  55.56 
 
 		 325 aa  258  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3752  ribosomal protein S3  59.33 
 
 		 272 aa  258  5.0000000000000005e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5043  30S ribosomal protein S3  59.42 
 
 		 278 aa  258  6e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.084323  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  55.98 
 
 		 211 aa  257  8e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0694  ribosomal protein S3  53.48 
 
 		 282 aa  258  8e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  52.02 
 
 		 224 aa  258  8e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  57.34 
 
 		 220 aa  257  8e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  55.61 
 
 		 220 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3899  30S ribosomal protein S3  58.25 
 
 		 278 aa  257  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  56.31 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0588  30S ribosomal protein S3  55.56 
 
 		 315 aa  256  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3999  ribosomal protein S3  54.13 
 
 		 223 aa  256  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  56.31 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  57.42 
 
 		 217 aa  256  2e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0312  30S ribosomal protein S3  54.38 
 
 		 341 aa  256  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243469 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  57.89 
 
 		 217 aa  255  3e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  55.56 
 
 		 210 aa  255  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  57.14 
 
 		 222 aa  255  5e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1311  30S ribosomal protein S3  58.94 
 
 		 280 aa  255  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119681 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4501  ribosomal protein S3  56.22 
 
 		 308 aa  254  6e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04040  SSU ribosomal protein S3P  57 
 
 		 286 aa  254  8e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1129  ribosomal protein S3  57 
 
 		 279 aa  254  9e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5130  ribosomal protein S3  55.17 
 
 		 268 aa  253  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.805435 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  51.35 
 
 		 224 aa  253  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2640  30S ribosomal protein S3  57.14 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.659159  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  54.46 
 
 		 222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  57.62 
 
 		 218 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0326  30S ribosomal protein S3  54.35 
 
 		 232 aa  252  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364603  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  55.02 
 
 		 211 aa  252  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2681  ribosomal protein S3  53.85 
 
 		 276 aa  252  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  55.12 
 
 		 210 aa  252  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  54.07 
 
 		 211 aa  252  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20810  SSU ribosomal protein S3P  55.31 
 
 		 276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  56.67 
 
 		 218 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  54.07 
 
 		 211 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  55.86 
 
 		 228 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  55.12 
 
 		 223 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0427  30S ribosomal protein S3  55.56 
 
 		 232 aa  251  5.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159032  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  54.02 
 
 		 233 aa  251  6e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3917  ribosomal protein S3  54.42 
 
 		 288 aa  250  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  56.6 
 
 		 219 aa  250  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4309  ribosomal protein S3  54.42 
 
 		 288 aa  250  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395435  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0937  30S ribosomal protein S3  54.91 
 
 		 292 aa  250  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  58.05 
 
 		 245 aa  250  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  54.95 
 
 		 228 aa  250  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  53.1 
 
 		 230 aa  250  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  58.25 
 
 		 229 aa  249  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0065  30S ribosomal protein S3  54.01 
 
 		 235 aa  249  2e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0358705  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3137  ribosomal protein S3  53.42 
 
 		 258 aa  250  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  56.59 
 
 		 217 aa  249  2e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  56.13 
 
 		 219 aa  249  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0237  30S ribosomal protein S3  53.98 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  56.13 
 
 		 219 aa  249  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  56.13 
 
 		 219 aa  249  3e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  56.13 
 
 		 219 aa  249  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  56.13 
 
 		 219 aa  249  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  56.13 
 
 		 219 aa  249  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  56.13 
 
 		 219 aa  249  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0176  30S ribosomal protein S3  57.28 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  56.13 
 
 		 219 aa  249  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0205  30S ribosomal protein S3  53.98 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000415064  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0200  30S ribosomal protein S3  53.98 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00835555  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  56.13 
 
 		 219 aa  249  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0205  30S ribosomal protein S3  53.98 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  hitchhiker  0.00000000149632 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  55.19 
 
 		 219 aa  248  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2969  SSU ribosomal protein S3P  55.2 
 
 		 277 aa  248  5e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.530475  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5781  ribosomal protein S3  53.42 
 
 		 302 aa  248  5e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.336905 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  54.95 
 
 		 228 aa  248  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  54.95 
 
 		 228 aa  248  8e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  54.95 
 
 		 228 aa  248  8e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4684  30S ribosomal protein S3  58.25 
 
 		 229 aa  248  8e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000205507  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3518  ribosomal protein S3  52.65 
 
 		 230 aa  247  9e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000668296  hitchhiker  0.00000107065 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  53.33 
 
 		 214 aa  247  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2318  30S ribosomal protein S3  53.21 
 
 		 223 aa  247  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000695636  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  53.17 
 
 		 210 aa  247  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  52.68 
 
 		 210 aa  247  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0190  30S ribosomal protein S3  57.77 
 
 		 229 aa  246  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000304143  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  55.61 
 
 		 221 aa  246  2e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29680  SSU ribosomal protein S3P  51.72 
 
 		 276 aa  246  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.778759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>