More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4919 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4919  ribosomal protein S19  100 
 
 
80 aa  166  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0706755  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1181  30S ribosomal protein S19  87.5 
 
 
95 aa  153  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4022  30S ribosomal protein S19  86.25 
 
 
95 aa  149  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717988  hitchhiker  0.00000485262 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3020  30S ribosomal protein S19  82.5 
 
 
95 aa  147  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00609436  hitchhiker  0.00770845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0426  30S ribosomal protein S19  76.39 
 
 
93 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0022508  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  74.29 
 
 
93 aa  124  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000324039  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  75.71 
 
 
94 aa  123  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  72.37 
 
 
91 aa  122  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0290  ribosomal protein S19  76.81 
 
 
94 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00533936  normal  0.0406093 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  77.14 
 
 
94 aa  121  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  76.81 
 
 
94 aa  120  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745132  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0229  30S ribosomal protein S19  75.36 
 
 
94 aa  120  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23430  SSU ribosomal protein S19P  73.61 
 
 
85 aa  119  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000187491  hitchhiker  0.0000000975507 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09960  SSU ribosomal protein S19P  76.06 
 
 
86 aa  119  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.328032  hitchhiker  0.00000140006 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  67.95 
 
 
93 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  72.86 
 
 
94 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1570  ribosomal protein S19  63.75 
 
 
95 aa  118  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000162931  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  66.67 
 
 
94 aa  118  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2456  30S ribosomal protein S19  74.29 
 
 
94 aa  117  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0781906 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  74.29 
 
 
92 aa  117  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2151  SSU ribosomal protein S19P  70.51 
 
 
93 aa  117  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152821  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  67.11 
 
 
91 aa  117  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  74.29 
 
 
92 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  71.83 
 
 
94 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  72.86 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0695  30S ribosomal protein S19  68.83 
 
 
92 aa  115  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208226  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  73.91 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0871  30S ribosomal protein S19  67.5 
 
 
93 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000215821  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1157  ribosomal protein S19  73.24 
 
 
86 aa  116  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000321544  hitchhiker  0.000000515171 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1344  ribosomal protein S19  75 
 
 
90 aa  116  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2563  30S ribosomal protein S19  68.42 
 
 
92 aa  115  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.61073  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  70.67 
 
 
92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2329  ribosomal protein S19  66.2 
 
 
94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000239943  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  64.1 
 
 
92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  64.1 
 
 
92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2710  30S ribosomal protein S19  69.12 
 
 
93 aa  113  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2395  30S ribosomal protein S19  69.12 
 
 
93 aa  113  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  65.79 
 
 
91 aa  113  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  64.1 
 
 
92 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0402  ribosomal protein S19  65.79 
 
 
93 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0108  30S ribosomal protein S19  68.57 
 
 
92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  72.06 
 
 
91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2292  30S ribosomal protein S19  64 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00274383  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3663  30S ribosomal protein S19  72.46 
 
 
92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230775  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0114  30S ribosomal protein S19  67.14 
 
 
92 aa  111  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0114  30S ribosomal protein S19  67.14 
 
 
92 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000383993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0110  30S ribosomal protein S19  67.14 
 
 
92 aa  111  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16547e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0108  30S ribosomal protein S19  67.14 
 
 
92 aa  111  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0114  30S ribosomal protein S19  67.14 
 
 
92 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000118397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  67.14 
 
 
92 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000029175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  67.14 
 
 
92 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0135  30S ribosomal protein S19  70.59 
 
 
92 aa  110  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000777644  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0185  30S ribosomal protein S19  68 
 
 
98 aa  110  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000106246  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2419  30S ribosomal protein S19  69.33 
 
 
98 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000264449  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  65.79 
 
 
91 aa  110  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2225  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
98 aa  110  9e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000482989  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  68.12 
 
 
92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  68.06 
 
 
93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3015  30S ribosomal protein S19  64.47 
 
 
91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000505191  decreased coverage  0.00185866 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  69.12 
 
 
94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2060  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
98 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000251364  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0109  30S ribosomal protein S19  69.12 
 
 
92 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000185939  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  64.47 
 
 
91 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0332  ribosomal protein S19  60.26 
 
 
92 aa  108  3e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.203927  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  61.25 
 
 
95 aa  108  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0854  ribosomal protein S19  64.47 
 
 
91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3313  30S ribosomal protein S19  64.47 
 
 
91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000716821  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  63.16 
 
 
91 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  63.16 
 
 
91 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0771  30S ribosomal protein S19  63.89 
 
 
93 aa  107  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18349  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1127  ribosomal protein S19  64.1 
 
 
93 aa  107  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.831563  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0462  SSU ribosomal protein S19P  65.33 
 
 
90 aa  107  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1827  30S ribosomal protein S19  65.71 
 
 
92 aa  107  7.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  60.53 
 
 
91 aa  107  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3997  30S ribosomal protein S19  63.64 
 
 
92 aa  107  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000877043  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  62.82 
 
 
91 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3818  30S ribosomal protein S19  63.64 
 
 
92 aa  107  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000535385  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  62.82 
 
 
91 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  62.82 
 
 
91 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  69.12 
 
 
93 aa  106  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  62.82 
 
 
91 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  62.82 
 
 
91 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  62.82 
 
 
91 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  62.82 
 
 
91 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  62.82 
 
 
91 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  62.82 
 
 
91 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1646  30S ribosomal protein S19  66.18 
 
 
92 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  62.82 
 
 
91 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  63.64 
 
 
92 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17451  30S ribosomal protein S19  66.18 
 
 
92 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  62.82 
 
 
91 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  62.82 
 
 
91 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  62.82 
 
 
91 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000407777  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  62.82 
 
 
91 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  62.82 
 
 
91 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0295  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
95 aa  106  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.07171e-28 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  62.82 
 
 
91 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  62.82 
 
 
91 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403295  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  62.82 
 
 
91 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17611  30S ribosomal protein S19  66.18 
 
 
92 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>