More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4916 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  100 
 
 		 209 aa  422  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  66.04 
 
 		 222 aa  295  4e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  64.42 
 
 		 223 aa  281  6.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  64.42 
 
 		 221 aa  280  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  54.23 
 
 		 206 aa  231  6e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  53.4 
 
 		 223 aa  225  4e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  53.96 
 
 		 207 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  52.97 
 
 		 207 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  52.48 
 
 		 207 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  52.48 
 
 		 207 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  52.48 
 
 		 207 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  52.48 
 
 		 207 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  52.48 
 
 		 207 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  52.48 
 
 		 207 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  52.48 
 
 		 207 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  52.48 
 
 		 207 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  52.48 
 
 		 207 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  51.98 
 
 		 207 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  50.99 
 
 		 207 aa  209  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  50.24 
 
 		 207 aa  206  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  50.99 
 
 		 206 aa  204  7e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  48.51 
 
 		 206 aa  203  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  51.49 
 
 		 206 aa  202  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  49.5 
 
 		 207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  49.25 
 
 		 208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  51.49 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  47.22 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  46.77 
 
 		 208 aa  195  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  47.03 
 
 		 207 aa  193  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  47.78 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  46.77 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  49.02 
 
 		 207 aa  192  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  47.29 
 
 		 207 aa  191  6e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  48.77 
 
 		 205 aa  190  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  49.26 
 
 		 209 aa  186  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  48.31 
 
 		 207 aa  186  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  47.03 
 
 		 207 aa  186  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  45.54 
 
 		 207 aa  185  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1293  50S ribosomal protein L4  46.9 
 
 		 235 aa  185  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000803665  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1393  50S ribosomal protein L4  46.9 
 
 		 235 aa  185  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000162338  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  45.37 
 
 		 208 aa  185  4e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  47.29 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  49.24 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  45.67 
 
 		 214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  47.98 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  47.98 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  43.06 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0475  50S ribosomal protein L4  43.54 
 
 		 210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00700158  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_418  ribosomal protein L4  43.06 
 
 		 210 aa  181  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00538527  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  44.78 
 
 		 204 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  44.78 
 
 		 204 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1148  50S ribosomal protein L4  43.54 
 
 		 209 aa  178  4e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000671055  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  42.08 
 
 		 223 aa  177  8e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1616  ribosomal protein L4/L1e  44.61 
 
 		 212 aa  174  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  43.75 
 
 		 208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  42.13 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  44.06 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  44.39 
 
 		 207 aa  171  5e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  44.55 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  42.72 
 
 		 208 aa  171  7.999999999999999e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3434  ribosomal protein L4/L1e  47.94 
 
 		 217 aa  171  7.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3994  ribosomal protein L4/L1e  46.6 
 
 		 212 aa  171  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  44.33 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1160  ribosomal protein L4/L1e  45.03 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000738717  hitchhiker  0.000000590673 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  42.23 
 
 		 208 aa  168  7e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1124  ribosomal protein L4/L1e  47.47 
 
 		 248 aa  167  8e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  42.86 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  43.84 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  44.33 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  45 
 
 		 216 aa  165  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20860  LSU ribosomal protein L4P  47.15 
 
 		 223 aa  164  5.9999999999999996e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03990  LSU ribosomal protein L4P  45.18 
 
 		 228 aa  164  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05720  50S ribosomal protein L4  39.61 
 
 		 208 aa  164  8e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316206  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0396  50S ribosomal protein L4  41.15 
 
 		 209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  43.2 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  41.18 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  40.67 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  44.33 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  44.39 
 
 		 222 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3142  ribosomal protein L4/L1e  43.08 
 
 		 221 aa  161  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.083105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6048  50S ribosomal protein L4  44.44 
 
 		 247 aa  161  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4344  50S ribosomal protein L4  42.11 
 
 		 209 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000409516  normal  0.126717 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  45.32 
 
 		 207 aa  161  6e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1306  50S ribosomal protein L4  46.43 
 
 		 219 aa  161  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265076  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_002950  PG1937  50S ribosomal protein L4  43.48 
 
 		 209 aa  161  8.000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  41.21 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  45.96 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17150  LSU ribosomal protein L4P  46.49 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  42.57 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1850  50S ribosomal protein L4  43.75 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264817  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2658  ribosomal protein L4/L1e  42.93 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0399  ribosomal protein L4/L1e  43.72 
 
 		 214 aa  158  5e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29730  LSU ribosomal protein L4P  44.79 
 
 		 234 aa  158  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  46.73 
 
 		 210 aa  157  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  43.14 
 
 		 211 aa  157  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  43.14 
 
 		 211 aa  157  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0932  ribosomal protein L4/L1e  44.62 
 
 		 217 aa  157  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4506  ribosomal protein L4/L1e  44.67 
 
 		 292 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3161  50S ribosomal protein L4  41.06 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5786  ribosomal protein L4/L1e  39.23 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.116422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>