More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4915 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 212 aa  425  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  66.99 
 
 		 210 aa  298  3e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  65.71 
 
 		 210 aa  293  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  65.24 
 
 		 210 aa  290  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  56.73 
 
 		 222 aa  246  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  60.19 
 
 		 204 aa  244  8e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0474  50S ribosomal protein L3  56.25 
 
 		 205 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00148542  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  54.81 
 
 		 218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  56.4 
 
 		 216 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_417  ribosomal protein L3  55.77 
 
 		 205 aa  241  5e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000036263  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  55.02 
 
 		 210 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0451  50S ribosomal protein L3  54.81 
 
 		 205 aa  238  4e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000154888  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  54.29 
 
 		 216 aa  238  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  56.19 
 
 		 219 aa  234  6e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  54.76 
 
 		 209 aa  234  7e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  53.37 
 
 		 217 aa  234  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  55.29 
 
 		 213 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  56.04 
 
 		 206 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  54.33 
 
 		 216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  52.83 
 
 		 226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  54.03 
 
 		 209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  54.5 
 
 		 216 aa  231  6e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  51.92 
 
 		 209 aa  230  1e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  54.76 
 
 		 210 aa  229  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  55.24 
 
 		 210 aa  230  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  54.81 
 
 		 218 aa  228  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  53.37 
 
 		 215 aa  228  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  52.88 
 
 		 219 aa  228  6e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  55.87 
 
 		 217 aa  228  6e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  54.37 
 
 		 205 aa  228  7e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  54.33 
 
 		 221 aa  227  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  50.94 
 
 		 211 aa  226  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  55.5 
 
 		 209 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  52.43 
 
 		 208 aa  224  9e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  54.72 
 
 		 211 aa  223  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  53.77 
 
 		 210 aa  223  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  54.46 
 
 		 218 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0289  50S ribosomal protein L3  53.92 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  51.42 
 
 		 211 aa  223  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  53.74 
 
 		 218 aa  222  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 205 aa  221  4.9999999999999996e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  54.72 
 
 		 210 aa  221  6e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  54.72 
 
 		 210 aa  221  6e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  54.72 
 
 		 210 aa  221  6e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  54.72 
 
 		 210 aa  221  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  54.72 
 
 		 210 aa  221  6e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  54.72 
 
 		 210 aa  221  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  54.72 
 
 		 210 aa  221  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  54.72 
 
 		 210 aa  221  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0602  ribosomal protein L3  54.37 
 
 		 205 aa  220  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  53.77 
 
 		 211 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  52.4 
 
 		 216 aa  220  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  54.25 
 
 		 210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  53.05 
 
 		 217 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  52.86 
 
 		 210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  53.05 
 
 		 217 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2229  50S ribosomal protein L3  52.45 
 
 		 209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000790762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  54.25 
 
 		 210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  53.05 
 
 		 217 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  51.42 
 
 		 211 aa  219  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  57.75 
 
 		 207 aa  219  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2064  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 		 209 aa  219  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000717701  normal  0.401636 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  51.92 
 
 		 236 aa  218  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  52.91 
 
 		 205 aa  218  3.9999999999999997e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  52.11 
 
 		 220 aa  218  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  53.81 
 
 		 223 aa  218  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  50.96 
 
 		 216 aa  218  5e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  50.95 
 
 		 209 aa  218  7e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  51.44 
 
 		 219 aa  218  7.999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  53.52 
 
 		 211 aa  217  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  51.42 
 
 		 213 aa  216  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0180  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 209 aa  217  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00021825  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  56.13 
 
 		 212 aa  216  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  51.43 
 
 		 209 aa  217  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 205 aa  217  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  47.14 
 
 		 210 aa  217  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  50.97 
 
 		 219 aa  217  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2257  50S ribosomal protein L3  54.19 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000117498  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  50.95 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 216 aa  215  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1185  50S ribosomal protein L3  54.25 
 
 		 220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  53.49 
 
 		 218 aa  215  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  48.36 
 
 		 218 aa  214  5.9999999999999996e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1851  50S ribosomal protein L3  51.67 
 
 		 209 aa  214  5.9999999999999996e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.132189  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  51.67 
 
 		 218 aa  214  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  51.2 
 
 		 218 aa  214  7e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  48.1 
 
 		 210 aa  214  7e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  51.69 
 
 		 206 aa  214  8e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  51.96 
 
 		 211 aa  213  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0376  50S ribosomal protein L3  48.83 
 
 		 218 aa  213  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 217 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  51.46 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  50.71 
 
 		 213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17491  50S ribosomal protein L3  48.53 
 
 		 217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  54.25 
 
 		 208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  53.11 
 
 		 207 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  53.11 
 
 		 207 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  54.25 
 
 		 208 aa  211  4.9999999999999996e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4343  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 		 206 aa  211  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0239943  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  52.71 
 
 		 219 aa  211  7.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>