More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4861 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4861  patatin  100 
 
 
332 aa  669    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  32.85 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  33.1 
 
 
312 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  36 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2085  patatin  35.06 
 
 
314 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  36.11 
 
 
306 aa  122  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0501  patatin  32.89 
 
 
293 aa  120  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6465  patatin  40.11 
 
 
286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0074  Patatin  30.74 
 
 
283 aa  119  7e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  30.85 
 
 
308 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2490  Patatin  33.21 
 
 
294 aa  113  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  30.36 
 
 
277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4059  patatin  31.92 
 
 
276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.447897  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  31.58 
 
 
303 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7395  patatin  31.09 
 
 
277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3682  patatin  30.77 
 
 
276 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  28.73 
 
 
294 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  29.92 
 
 
306 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  30.97 
 
 
306 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0014  patatin  32.73 
 
 
290 aa  93.2  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4848  patatin  27.27 
 
 
290 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  32.84 
 
 
399 aa  87  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4740  Patatin  27.24 
 
 
252 aa  87  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  27.6 
 
 
410 aa  85.9  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  29.33 
 
 
379 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  30.81 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  27.31 
 
 
389 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2824  Patatin  29.63 
 
 
357 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.701199  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  29.39 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  35.6 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  28.68 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  25.44 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  32.2 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  30.43 
 
 
387 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  27.87 
 
 
583 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  31.25 
 
 
382 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0621  patatin  32.47 
 
 
267 aa  78.6  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  33.68 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  31.75 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  32.14 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  30.32 
 
 
417 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  28.42 
 
 
429 aa  75.9  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  28.96 
 
 
442 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1281  patatin  31.8 
 
 
406 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000145199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  26.37 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  30.39 
 
 
386 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  23.98 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  27.23 
 
 
420 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  30.65 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  30.45 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  27.23 
 
 
420 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  30.1 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  27.78 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  23.98 
 
 
371 aa  73.2  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  25.63 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1888  hypothetical protein  29.96 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  26.29 
 
 
387 aa  72.8  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3007  Patatin  30.66 
 
 
331 aa  72.8  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  31.41 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  25.99 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.09 
 
 
763 aa  72.4  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  28.87 
 
 
748 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  30.77 
 
 
379 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  31.07 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  29.38 
 
 
384 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  24.66 
 
 
412 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  31.07 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  26.03 
 
 
728 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  25.63 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02397  putative transmembrane protein  26.48 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104475  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  28.37 
 
 
760 aa  70.1  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  26.89 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  26.64 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  25.63 
 
 
320 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3155  transpatatin- like phospholipase domain-containing protein  24.66 
 
 
412 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382595 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  30.77 
 
 
735 aa  68.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  24.61 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  26.42 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  29.03 
 
 
427 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  24.61 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  26.42 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  24.77 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  25.91 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  28.52 
 
 
581 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  25.55 
 
 
377 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  24.61 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  24.61 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  24.61 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  24.61 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0958  patatin family protein  27.72 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  26.25 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  25.37 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0631  Patatin  30.05 
 
 
390 aa  68.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00952003 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  26.25 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  26.25 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  29.1 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  28.45 
 
 
421 aa  67.4  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  26 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4593  Patatin  28.52 
 
 
374 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717788  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  27.44 
 
 
405 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>