More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4805 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 628 aa  1279    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  51.04 
 
 		 347 aa  375  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  50.75 
 
 		 347 aa  374  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  49.69 
 
 		 423 aa  342  8e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  44.69 
 
 		 474 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  45.71 
 
 		 837 aa  296  7e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  48.26 
 
 		 491 aa  293  7e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  49.52 
 
 		 543 aa  289  8e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  49.46 
 
 		 477 aa  289  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  44.24 
 
 		 371 aa  281  4e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  42.61 
 
 		 394 aa  274  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  42.94 
 
 		 399 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  41.69 
 
 		 488 aa  268  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  41.67 
 
 		 383 aa  262  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  41.19 
 
 		 487 aa  262  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  42.96 
 
 		 503 aa  261  4e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  39.88 
 
 		 490 aa  259  9e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  40.63 
 
 		 678 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  42.72 
 
 		 451 aa  252  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  39.45 
 
 		 778 aa  250  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  39.47 
 
 		 398 aa  250  6e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  43.31 
 
 		 333 aa  249  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  42.12 
 
 		 376 aa  240  4e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  37 
 
 		 373 aa  236  7e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  41.01 
 
 		 389 aa  228  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  37.73 
 
 		 328 aa  228  3e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  39.69 
 
 		 457 aa  221  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  39.37 
 
 		 495 aa  204  5e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  38.44 
 
 		 375 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  35.65 
 
 		 309 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  39.79 
 
 		 820 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  38.65 
 
 		 497 aa  198  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  39.31 
 
 		 457 aa  197  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  35.85 
 
 		 317 aa  196  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  36.97 
 
 		 756 aa  196  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  38.68 
 
 		 829 aa  194  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  37.42 
 
 		 474 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  34.3 
 
 		 321 aa  190  7e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  37.04 
 
 		 815 aa  188  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07401  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  38.33 
 
 		 355 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  33.56 
 
 		 323 aa  179  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  34.04 
 
 		 338 aa  179  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  35.62 
 
 		 454 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  37.24 
 
 		 1001 aa  178  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  34.24 
 
 		 1041 aa  175  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  35.52 
 
 		 370 aa  172  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.86 
 
 		 697 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  33.44 
 
 		 689 aa  172  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  34.29 
 
 		 472 aa  172  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  35.76 
 
 		 366 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  34.58 
 
 		 331 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  36.49 
 
 		 451 aa  167  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  31.7 
 
 		 423 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  32.76 
 
 		 1037 aa  165  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  31.21 
 
 		 357 aa  164  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  31.6 
 
 		 486 aa  162  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2715  hypothetical protein  61.54 
 
 		 562 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  31.52 
 
 		 465 aa  162  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  33.03 
 
 		 337 aa  160  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  31.52 
 
 		 373 aa  160  7e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  31.95 
 
 		 374 aa  160  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  32.13 
 
 		 359 aa  158  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  33.22 
 
 		 1478 aa  158  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  32.03 
 
 		 1018 aa  157  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  30.36 
 
 		 364 aa  157  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  33.55 
 
 		 1050 aa  155  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  32.45 
 
 		 1059 aa  152  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  32.45 
 
 		 1059 aa  152  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  29.09 
 
 		 369 aa  151  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  30.52 
 
 		 370 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  32.63 
 
 		 1019 aa  150  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  31.27 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  33.77 
 
 		 324 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  33.33 
 
 		 401 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  30.7 
 
 		 321 aa  148  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  34.67 
 
 		 370 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  32.27 
 
 		 382 aa  147  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  34.52 
 
 		 387 aa  147  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  33.55 
 
 		 690 aa  145  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  36.51 
 
 		 619 aa  145  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2253  glycoside hydrolase family 10  32.37 
 
 		 381 aa  144  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  52.52 
 
 		 609 aa  142  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2716  hypothetical protein  56.15 
 
 		 545 aa  139  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  55.47 
 
 		 846 aa  137  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  29.18 
 
 		 770 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  30.84 
 
 		 1780 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  30.9 
 
 		 1020 aa  134  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  31.35 
 
 		 388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  31.19 
 
 		 368 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26810  beta-1,4-xylanase  29.08 
 
 		 566 aa  128  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.94 
 
 		 1146 aa  128  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  29.61 
 
 		 463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  28.94 
 
 		 392 aa  127  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  30 
 
 		 1495 aa  127  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  28.68 
 
 		 619 aa  126  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  28.1 
 
 		 357 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  31.56 
 
 		 1331 aa  125  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  30.86 
 
 		 912 aa  125  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  55.34 
 
 		 590 aa  124  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  52.31 
 
 		 942 aa  124  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>