More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4797 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  100 
 
 
336 aa  677    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0163  transcriptional regulator, LacI family  42.47 
 
 
330 aa  245  8e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000297035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5761  transcriptional regulator, LacI family  39.58 
 
 
363 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.079116 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  40.36 
 
 
337 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  39.16 
 
 
368 aa  216  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  42.26 
 
 
353 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  37.09 
 
 
335 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  34.73 
 
 
341 aa  207  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.96 
 
 
336 aa  206  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1333  transcriptional regulator, LacI family  36.58 
 
 
347 aa  206  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00834702  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  36.39 
 
 
351 aa  206  7e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.14 
 
 
337 aa  205  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  37.95 
 
 
348 aa  202  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3918  LacI family transcription regulator  36.89 
 
 
351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  37.72 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.34 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  34.23 
 
 
330 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  36.28 
 
 
339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  34.02 
 
 
336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  35.31 
 
 
347 aa  196  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  37.62 
 
 
342 aa  196  6e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  33.83 
 
 
332 aa  195  9e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  35.91 
 
 
332 aa  193  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  35.91 
 
 
332 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  35.91 
 
 
332 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  35.91 
 
 
332 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.04 
 
 
331 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3970  LacI family transcription regulator  38.19 
 
 
348 aa  192  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  35.91 
 
 
332 aa  192  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  34.5 
 
 
336 aa  192  7e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  36.83 
 
 
344 aa  192  7e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  34.62 
 
 
342 aa  192  9e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  35.61 
 
 
332 aa  192  9e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  35.31 
 
 
332 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  34.52 
 
 
332 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  34.23 
 
 
332 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  34.12 
 
 
332 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  35.31 
 
 
332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  33.13 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  37.24 
 
 
334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  35.31 
 
 
332 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.9 
 
 
336 aa  189  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  39.53 
 
 
338 aa  189  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  35.01 
 
 
337 aa  189  8e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  35.96 
 
 
332 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.89 
 
 
348 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  36.04 
 
 
386 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0129  transcriptional regulator, LacI family  36.09 
 
 
332 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  34.21 
 
 
340 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1769  LacI family transcription regulator  36.66 
 
 
339 aa  186  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  37.05 
 
 
339 aa  186  6e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.1 
 
 
335 aa  186  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0417  LacI family transcription regulator  33.84 
 
 
354 aa  185  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  37.91 
 
 
335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  35.45 
 
 
333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 
341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  37.35 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1005  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0187  transcriptional regulator, LacI family  36.8 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3955  transcriptional regulator, LacI family  35.54 
 
 
364 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.337972  normal  0.11028 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0779  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.6 
 
 
342 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.561354  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  37.09 
 
 
344 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  37.84 
 
 
353 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  34.62 
 
 
338 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2164  LacI family transcription regulator  37.97 
 
 
347 aa  182  7e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  36.94 
 
 
359 aa  182  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2503  transcriptional regulator  32.1 
 
 
339 aa  182  7e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117668  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  32.15 
 
 
337 aa  182  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  34.22 
 
 
337 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  32.1 
 
 
339 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  35.22 
 
 
335 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  36.28 
 
 
331 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  36.84 
 
 
340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  36.73 
 
 
330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2720  transcriptional regulator, LacI family  37.16 
 
 
337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.687845  normal  0.476409 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  36.94 
 
 
333 aa  180  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0306  LacI family transcription regulator  32.94 
 
 
342 aa  179  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  35.99 
 
 
382 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  36.42 
 
 
346 aa  179  7e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  32.54 
 
 
334 aa  179  8e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  34.89 
 
 
347 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1069  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  34.52 
 
 
328 aa  178  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.209088 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1332  transcriptional regulator, LacI family  35.56 
 
 
377 aa  177  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  36.45 
 
 
334 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.38 
 
 
352 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  37.8 
 
 
339 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2456  LacI family transcription regulator  38.22 
 
 
352 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  36.78 
 
 
323 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2046  LacI family transcription regulator  34.82 
 
 
344 aa  177  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  37.01 
 
 
342 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1277  LacI family transcription regulator  37.5 
 
 
344 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0780915  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  34.53 
 
 
336 aa  176  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  34.1 
 
 
332 aa  176  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  35.16 
 
 
341 aa  176  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  35.94 
 
 
341 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0304  degradation activator  32.84 
 
 
332 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0588  LacI family transcription regulator  34.52 
 
 
328 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.979882  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20530  transcriptional regulator, LacI family  34.06 
 
 
341 aa  176  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0527  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  34.52 
 
 
328 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5149  transcriptional regulator, LacI family  35.42 
 
 
346 aa  176  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>