211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4682 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4682  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  100 
 
 
606 aa  1256    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1998  pepF/M3 family oligoendopeptidase  58.05 
 
 
603 aa  717    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3273  pepF/M3 family oligoendopeptidase  56.95 
 
 
603 aa  702    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.474589 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1167  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  47.72 
 
 
593 aa  587  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2647  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  45.95 
 
 
584 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00961781  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1211  oligoendopeptidase pepF/M3 family  46.32 
 
 
587 aa  498  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000802852  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1212  pepF/M3 family oligoendopeptidase  38.2 
 
 
586 aa  429  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0407734  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2001  oligoendopeptidase F, putative  35.95 
 
 
597 aa  406  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0875927  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3298  pepF/M3 family oligoendopeptidase  37.54 
 
 
582 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6864  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  38.61 
 
 
612 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176327 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0130  Oligopeptidase F  30.03 
 
 
593 aa  295  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1955  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  31.91 
 
 
607 aa  275  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1729  oligopeptidase F  29.25 
 
 
593 aa  258  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0341754  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0281  oligoendopeptidase F  27.51 
 
 
600 aa  257  4e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.651782  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0490  oligoendopeptidase F  29.79 
 
 
603 aa  256  6e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0856  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  31.88 
 
 
598 aa  253  8.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02130  oligopeptidase  28.2 
 
 
599 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003689  oligoendopeptidase F  27.88 
 
 
598 aa  231  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  29.02 
 
 
620 aa  210  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3296  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27.56 
 
 
617 aa  204  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.01 
 
 
622 aa  201  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27.96 
 
 
601 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4566  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  30.65 
 
 
607 aa  200  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0554379  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27.53 
 
 
617 aa  196  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.71 
 
 
616 aa  196  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.06 
 
 
625 aa  194  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.71 
 
 
623 aa  193  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2070  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.47 
 
 
634 aa  193  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.024965  normal  0.33011 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.9 
 
 
625 aa  192  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  27.45 
 
 
619 aa  190  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2192  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  28 
 
 
597 aa  186  9e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246068  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27.47 
 
 
603 aa  184  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  27.08 
 
 
620 aa  184  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  25.04 
 
 
592 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.49 
 
 
616 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.87 
 
 
620 aa  183  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  25.71 
 
 
632 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  27 
 
 
620 aa  182  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.69 
 
 
601 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2730  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.32 
 
 
616 aa  181  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797581  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  26.21 
 
 
625 aa  179  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  24.38 
 
 
590 aa  179  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  25.79 
 
 
664 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  29 
 
 
615 aa  177  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  26.05 
 
 
626 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2360  peptidase, family M3  27.71 
 
 
529 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.995178  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0882  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.95 
 
 
608 aa  175  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83984  normal  0.332504 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.9 
 
 
591 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  24.41 
 
 
578 aa  175  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  27.12 
 
 
596 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1832  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.92 
 
 
620 aa  173  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  25.63 
 
 
626 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  25.88 
 
 
584 aa  173  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  26.99 
 
 
612 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.93 
 
 
627 aa  170  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.63 
 
 
614 aa  170  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  0.00000309933 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2603  oligoendopeptidase  26.43 
 
 
611 aa  170  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0093862 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2599  oligoendopeptidase F  27.08 
 
 
527 aa  170  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.013987  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  25.13 
 
 
610 aa  170  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  22.15 
 
 
573 aa  167  5e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  22.86 
 
 
569 aa  167  5e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2902  oligoendopeptidase F, putative  26.83 
 
 
527 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000435555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2874  peptidase, family M3  26.44 
 
 
527 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000399677 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2885  peptidase, family M3  35.32 
 
 
527 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  27.12 
 
 
573 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.19 
 
 
573 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1570  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.44 
 
 
606 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713222  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0533  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.18 
 
 
589 aa  165  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18439  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  26.69 
 
 
573 aa  164  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2628  oligoendopeptidase F  26.21 
 
 
527 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000191518  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1117  oligoendopeptidase F  27.33 
 
 
572 aa  164  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.74 
 
 
588 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4665  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  25.3 
 
 
638 aa  164  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2917  peptidase, family M3  26.21 
 
 
527 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.496699  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2672  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  25.11 
 
 
539 aa  163  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0535944  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2299  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  27.12 
 
 
598 aa  163  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2674  oligoendopeptidase F, putative  27.12 
 
 
598 aa  163  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  22.7 
 
 
588 aa  161  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2676  peptidase  27.74 
 
 
394 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000426358  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3392  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  27.27 
 
 
607 aa  160  9e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.935472  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1382  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.94 
 
 
589 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000209164  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1075  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.82 
 
 
606 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  25.65 
 
 
606 aa  156  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  31.16 
 
 
606 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  22.47 
 
 
573 aa  149  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34179  predicted protein  27.32 
 
 
577 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137613  normal  0.109742 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0329  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.72 
 
 
615 aa  147  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1817  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  24.74 
 
 
597 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1105  peptidase  25.21 
 
 
566 aa  141  3e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4751  oligoendopeptidase F  26.72 
 
 
605 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0701  putative oligoendopeptidase F  23.91 
 
 
571 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08170  Oligoendopeptidase F  22 
 
 
598 aa  137  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2002  oligoendopeptidase F  23.49 
 
 
594 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000655164  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1306  oligoendopeptidase F  23.8 
 
 
596 aa  125  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479307  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D12  oligopeptidase F  22.93 
 
 
604 aa  123  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0489  oligopeptidase  25.75 
 
 
601 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2686  oligoendopeptidase F  24.29 
 
 
599 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0738  oligoendopeptidase F  24.58 
 
 
609 aa  120  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2169  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  26.15 
 
 
601 aa  117  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0130  oligoendopeptidase F  25.92 
 
 
604 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000121565  hitchhiker  0.000025846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>