217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4659 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 
476 aa  964    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  51.5 
 
 
488 aa  488  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  51.16 
 
 
490 aa  484  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  36.98 
 
 
491 aa  292  8e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  36.59 
 
 
509 aa  283  5.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  33.68 
 
 
473 aa  265  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  37.9 
 
 
460 aa  261  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  34.65 
 
 
469 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  32.84 
 
 
473 aa  251  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  33.26 
 
 
474 aa  252  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  32.57 
 
 
473 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  32.77 
 
 
479 aa  250  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  32.37 
 
 
473 aa  249  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  32.37 
 
 
473 aa  249  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  32.37 
 
 
473 aa  249  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  31.51 
 
 
473 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  32.1 
 
 
473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  31.94 
 
 
473 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  31.22 
 
 
473 aa  240  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0522  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 
470 aa  240  5e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0126038  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  33.4 
 
 
495 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  35.24 
 
 
459 aa  236  7e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  36.5 
 
 
473 aa  236  9e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  32.63 
 
 
471 aa  233  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  33.97 
 
 
467 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  33.12 
 
 
469 aa  232  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  32 
 
 
456 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  31.66 
 
 
466 aa  230  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  31.66 
 
 
466 aa  230  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  30.74 
 
 
482 aa  228  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  33.26 
 
 
470 aa  229  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  32.12 
 
 
471 aa  220  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  33.83 
 
 
470 aa  218  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  33.55 
 
 
470 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  32.77 
 
 
488 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  35.73 
 
 
463 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6719  Protoporphyrinogen oxidase  35.02 
 
 
479 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.278597 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  32.41 
 
 
469 aa  209  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  33.48 
 
 
482 aa  205  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  32.54 
 
 
477 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  31.4 
 
 
463 aa  196  6e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  31.36 
 
 
472 aa  195  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  31.35 
 
 
446 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  31.35 
 
 
446 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  29.61 
 
 
467 aa  182  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0796  protoporphyrinogen oxidase  32.37 
 
 
476 aa  179  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  30.58 
 
 
488 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15660  protoporphyrinogen oxidase  31.39 
 
 
475 aa  176  6e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517129  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6103  protoporphyrinogen oxidase  29.76 
 
 
454 aa  170  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507474  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  29 
 
 
435 aa  169  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1765  protoporphyrinogen oxidase  34.08 
 
 
493 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000124321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  25.37 
 
 
466 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  25.16 
 
 
463 aa  167  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  24.89 
 
 
463 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  24.15 
 
 
466 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  31.72 
 
 
473 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  25.11 
 
 
466 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  24.31 
 
 
466 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  27.13 
 
 
442 aa  163  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  24.89 
 
 
466 aa  162  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  24.89 
 
 
466 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  24.89 
 
 
466 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  24.89 
 
 
466 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  30.12 
 
 
488 aa  161  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  29.49 
 
 
454 aa  160  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  24.89 
 
 
466 aa  160  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  28.98 
 
 
475 aa  159  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1533  protoporphyrinogen oxidase  30.45 
 
 
469 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  27.52 
 
 
482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24080  protoporphyrinogen oxidase  30.87 
 
 
482 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143554  normal  0.0261132 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  32.02 
 
 
460 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  29.03 
 
 
447 aa  147  3e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  29.23 
 
 
421 aa  146  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1475  protoporphyrinogen oxidase  31.19 
 
 
469 aa  143  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000274844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  30.13 
 
 
452 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  28.87 
 
 
482 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  24.02 
 
 
441 aa  137  6.0000000000000005e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1986  protoporphyrinogen oxidase  31.34 
 
 
463 aa  136  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0102446  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  29.51 
 
 
475 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  26.51 
 
 
465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3928  protoporphyrinogen oxidase  27.56 
 
 
477 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32279  predicted protein  26.11 
 
 
472 aa  120  6e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0286997 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  28.26 
 
 
451 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  28.26 
 
 
451 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  28.04 
 
 
451 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3918  protoporphyrinogen oxidase  28.57 
 
 
454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475237  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2482  protoporphyrinogen oxidase  28.26 
 
 
453 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  27.45 
 
 
479 aa  95.1  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2486  protoporphyrinogen oxidase  23.79 
 
 
462 aa  92.8  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31109  protoporphyrinogen oxidase  24.22 
 
 
520 aa  93.2  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  30.58 
 
 
491 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2131  protoporphyrinogen oxidase  29.09 
 
 
444 aa  87.4  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3250  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 
499 aa  87  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.211185  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  24.46 
 
 
419 aa  86.3  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36040  protoporphyrinogen oxidase  29.76 
 
 
531 aa  84  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0717647  normal  0.753343 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4343  protoporphyrinogen oxidase  23.66 
 
 
423 aa  83.6  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708266  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55152  mitochondrial protoporphyrinogen oxidase  23.1 
 
 
553 aa  82.4  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  25.93 
 
 
476 aa  81.3  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03820  protoporphyrinogen oxidase, putative  32.75 
 
 
589 aa  80.1  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0121  protoporphyrinogen oxidase  26.56 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.138132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>