More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4460 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4460  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 
453 aa  924    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311483  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0351  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.87 
 
 
455 aa  335  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.350619 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0551  phosphoribosylamine--glycine ligase  40.48 
 
 
455 aa  323  3e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0061  Phosphoribosylamine--glycine ligase  40.53 
 
 
433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.490327 
 
 
-
 
NC_002936  DET0838  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.63 
 
 
425 aa  200  6e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2180  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.19 
 
 
419 aa  195  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.900628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.63 
 
 
419 aa  186  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1775  phosphoribosylamine/glycine ligase  29.04 
 
 
433 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2323  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.16 
 
 
429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.125717  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3997  phosphoribosylamine/glycine ligase  27.61 
 
 
423 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2361  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.04 
 
 
422 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4039  phosphoribosylamine/glycine ligase  27.61 
 
 
423 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.324775  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1532  phosphoribosylamine/glycine ligase  30.42 
 
 
423 aa  177  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.612843  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0526  phosphoribosylamine--glycine ligase  27.47 
 
 
419 aa  176  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0231  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.63 
 
 
425 aa  176  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.595549  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.87 
 
 
433 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1722  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.76 
 
 
425 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0266  phosphoribosylamine/glycine ligase  29.13 
 
 
424 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2684  phosphoribosylamine/glycine ligase  28.48 
 
 
432 aa  172  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0337126  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00440  purine nucleotide biosynthesis-related protein, putative  29.66 
 
 
802 aa  170  4e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1444  phosphoribosylamine/glycine ligase  25.16 
 
 
420 aa  170  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  27.35 
 
 
425 aa  170  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.48 
 
 
430 aa  170  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0286  phosphoribosylamine--glycine ligase  27.85 
 
 
423 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0299  phosphoribosylamine--glycine ligase  27.85 
 
 
423 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0331  phosphoribosylamine--glycine ligase  26.97 
 
 
423 aa  170  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0779  phosphoribosylamine/glycine ligase  27.25 
 
 
428 aa  169  7e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00193673  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  30.24 
 
 
426 aa  169  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0627  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.16 
 
 
425 aa  169  8e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154285 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4975  phosphoribosylamine--glycine ligase  27.19 
 
 
423 aa  169  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2453  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.61 
 
 
424 aa  169  9e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.386914  normal  0.350843 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0274  phosphoribosylamine--glycine ligase  26.87 
 
 
423 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0465  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.23 
 
 
435 aa  169  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0271  phosphoribosylamine--glycine ligase  26.97 
 
 
423 aa  168  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3458  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.63 
 
 
423 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0471  phosphoribosylamine--glycine ligase  27.73 
 
 
423 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.91 
 
 
428 aa  168  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.91 
 
 
428 aa  168  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  29.04 
 
 
428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0278  phosphoribosylamine--glycine ligase  26.91 
 
 
423 aa  167  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.54 
 
 
430 aa  167  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3379  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.7 
 
 
414 aa  167  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3467  phosphoribosylamine--glycine ligase  26.8 
 
 
423 aa  167  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0345  phosphoribosylamine--glycine ligase  26.75 
 
 
423 aa  167  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15011  phosphoribosylglycinamide synthetase  25.38 
 
 
445 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3227  phosphoribosylamine--glycine ligase  27.71 
 
 
425 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  30.47 
 
 
433 aa  166  8e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1983  phosphoribosylamine/glycine ligase  27.02 
 
 
423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.853313 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0280  phosphoribosylamine--glycine ligase  26.54 
 
 
423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0401  phosphoribosylamine/glycine ligase  28.91 
 
 
428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000120381  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0127  phosphoribosylamine/glycine ligase  28.48 
 
 
413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1774  phosphoribosylamine--glycine ligase  26.01 
 
 
428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000323466  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0328  phosphoribosylamine--glycine ligase  26.75 
 
 
423 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4180  phosphoribosylamine/glycine ligase  29.59 
 
 
435 aa  164  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  0.510323 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0519  phosphoribosylamine/glycine ligase  25.11 
 
 
415 aa  164  3e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.941545  normal  0.807449 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0925  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.48 
 
 
433 aa  164  4.0000000000000004e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  26.25 
 
 
429 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  26.46 
 
 
429 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0264  phosphoribosylamine--glycine ligase  26.93 
 
 
430 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46971  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.36 
 
 
427 aa  163  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3871  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.12 
 
 
435 aa  163  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.0530756 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.27 
 
 
422 aa  163  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3149  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.88 
 
 
433 aa  163  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.868678  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1119  phosphoribosylamine--glycine ligase  25.66 
 
 
421 aa  162  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0372  phosphoribosylamine--glycine ligase  26.54 
 
 
423 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1412  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.16 
 
 
422 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.8215  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0529  phosphoribosylamine--glycine ligase  27.83 
 
 
429 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.863272  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  26.2 
 
 
430 aa  161  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  28.66 
 
 
809 aa  160  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.39 
 
 
437 aa  161  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.03 
 
 
426 aa  161  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.636159  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1140  phosphoribosylamine--glycine ligase  26.52 
 
 
430 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.73 
 
 
591 aa  160  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.06 
 
 
422 aa  160  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0036  phosphoribosylamine--glycine ligase  26.26 
 
 
424 aa  160  5e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.413084  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  28.01 
 
 
425 aa  160  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2863  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.17 
 
 
426 aa  160  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0385682  normal  0.548732 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  27.19 
 
 
422 aa  159  8e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0392  phosphoribosylamine--glycine ligase  27.68 
 
 
424 aa  159  8e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.423575  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.51 
 
 
422 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0026  phosphoribosylamine/glycine ligase  27.59 
 
 
704 aa  158  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3219  phosphoribosylamine--glycine ligase  26.09 
 
 
429 aa  158  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.708681 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4327  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.6 
 
 
431 aa  157  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101605  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  25.11 
 
 
424 aa  157  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.6 
 
 
432 aa  157  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35150  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.01 
 
 
429 aa  157  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0360  Phosphoribosylamine--glycine ligase  28.2 
 
 
430 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1189  phosphoribosylamine/glycine ligase  28.23 
 
 
417 aa  156  8e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000704507  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1999  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.04 
 
 
429 aa  155  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00638776  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  25.33 
 
 
424 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1330  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.06 
 
 
421 aa  155  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.152836  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0054  phosphoribosylamine/glycine ligase  24.34 
 
 
403 aa  155  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2591  phosphoribosylamine--glycine ligase  24.45 
 
 
423 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0487  phosphoribosylamine--glycine ligase  27.06 
 
 
427 aa  155  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.493201  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0171  phosphoribosylamine--glycine ligase  26.65 
 
 
428 aa  155  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1775  phosphoribosylamine--glycine ligase  25.11 
 
 
412 aa  155  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0960  phosphoribosylamine--glycine ligase  27.06 
 
 
426 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3522  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.07 
 
 
427 aa  155  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366295  normal  0.0471361 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1628  phosphoribosylamine--glycine ligase  29.78 
 
 
425 aa  155  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  28.17 
 
 
430 aa  154  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000692344  hitchhiker  0.00000110971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>