58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4436 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  767    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  48.94 
 
 
378 aa  334  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  49.46 
 
 
370 aa  329  6e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  50 
 
 
351 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  39.18 
 
 
334 aa  212  7e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  36 
 
 
320 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  31.55 
 
 
316 aa  152  7e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  29.57 
 
 
321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
586 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  24.53 
 
 
360 aa  97.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  24.38 
 
 
346 aa  94  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  26.17 
 
 
350 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  25.93 
 
 
328 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  25.18 
 
 
318 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  24.46 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  24.2 
 
 
574 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  26.91 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  23.99 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  26.06 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  21.76 
 
 
340 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  27.4 
 
 
341 aa  64.7  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  24.29 
 
 
339 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  22.4 
 
 
606 aa  63.5  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  25.78 
 
 
319 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  27.72 
 
 
327 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  25.19 
 
 
325 aa  61.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  26.22 
 
 
309 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  22.84 
 
 
340 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  26.46 
 
 
326 aa  60.5  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  21.18 
 
 
340 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  24.92 
 
 
338 aa  59.7  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  24.09 
 
 
304 aa  58.9  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  21.52 
 
 
342 aa  59.3  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0481  hypothetical protein  28.21 
 
 
325 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1791  hypothetical protein  26.86 
 
 
346 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  24.84 
 
 
346 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  20.59 
 
 
340 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1965  hypothetical protein  28.63 
 
 
320 aa  57.4  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  28.33 
 
 
326 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6876  hypothetical protein  23.1 
 
 
344 aa  56.2  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  24.12 
 
 
613 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  23.76 
 
 
334 aa  55.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0981  hypothetical protein  27.86 
 
 
344 aa  53.1  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01440  putative transmembrane protein  21.82 
 
 
298 aa  50.8  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  25.71 
 
 
347 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3465  hypothetical protein  24.32 
 
 
350 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3135  hypothetical protein  27.69 
 
 
338 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  27.86 
 
 
795 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  27.56 
 
 
281 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4203  hypothetical protein  35.21 
 
 
374 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  23.72 
 
 
775 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1692  hypothetical protein  24.17 
 
 
385 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0136  hypothetical protein  23.97 
 
 
349 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.437883 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  21.17 
 
 
339 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0692  hypothetical protein  22.53 
 
 
326 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101924  normal  0.0824925 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  29.09 
 
 
803 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3446  hypothetical protein  25 
 
 
378 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  21.11 
 
 
322 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>