193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4422 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4422  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 492 aa  969    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0409  putative PAS/PAC sensor protein  25.7 
 
 		 492 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1708  putative PAS/PAC sensor protein  26.61 
 
 		 444 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1037  putative PAS/PAC sensor protein  25.1 
 
 		 484 aa  118  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 		 361 aa  110  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  37.75 
 
 		 357 aa  108  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2210  anti-sigma-factor antagonist  41.01 
 
 		 580 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  37.32 
 
 		 361 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0179  anti-sigma-factor antagonist  41.06 
 
 		 359 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00135922 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5196  anti-sigma-factor antagonist  35.12 
 
 		 365 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  38.16 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  39.87 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  30.42 
 
 		 653 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 559 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3649  anti-sigma-factor antagonist  38.73 
 
 		 361 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0221  anti-sigma-factor antagonist  40.41 
 
 		 366 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  39.33 
 
 		 568 aa  99  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  34.87 
 
 		 689 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  40.37 
 
 		 388 aa  97.1  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2206  anti-sigma-factor antagonist  38.41 
 
 		 367 aa  97.1  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  33.73 
 
 		 306 aa  97.1  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1485  anti-sigma-factor antagonist  36.77 
 
 		 367 aa  96.7  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  40.32 
 
 		 556 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  32.82 
 
 		 638 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1856  anti-sigma-factor antagonist  39.74 
 
 		 365 aa  94.7  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.616563 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  37.58 
 
 		 372 aa  93.2  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  43.2 
 
 		 275 aa  92.8  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  34.5 
 
 		 315 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  35.33 
 
 		 653 aa  90.9  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4325  anti-sigma-factor antagonist  36.6 
 
 		 359 aa  90.1  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0978917  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0577  anti-sigma-factor antagonist  33.13 
 
 		 385 aa  90.1  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 385 aa  90.1  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0052  anti-sigma-factor antagonist  28.97 
 
 		 350 aa  90.1  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4698  anti-sigma-factor antagonist  33.47 
 
 		 363 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  41.07 
 
 		 549 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  33.5 
 
 		 509 aa  89  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  35.81 
 
 		 286 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1894  anti-sigma-factor antagonist  33.97 
 
 		 344 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2296  anti-sigma-factor antagonist  32.5 
 
 		 342 aa  87.8  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0948081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4421  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 		 271 aa  87.8  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2660  anti-sigma-factor antagonist  44.44 
 
 		 359 aa  87.8  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  37.97 
 
 		 377 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  32.72 
 
 		 371 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3476  anti-sigma-factor antagonist  36.18 
 
 		 380 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.837777  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  29.7 
 
 		 424 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 		 388 aa  87.4  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0373  anti-sigma-factor antagonist  37.23 
 
 		 365 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0116  anti-sigma-factor antagonist  32.68 
 
 		 357 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00357246  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.71 
 
 		 272 aa  85.5  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  30.73 
 
 		 562 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  27.68 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  29.84 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  36.11 
 
 		 667 aa  83.6  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4420  anti-sigma-factor antagonist  39.06 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0268  anti-sigma-factor antagonist  32.69 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0598617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  38.52 
 
 		 281 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  37.3 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0604  putative PAS/PAC sensor protein  32.97 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0938215  hitchhiker  0.000133748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3473  anti-sigma-factor antagonist  38.1 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.551903  normal  0.0822697 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  28.19 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  37.12 
 
 		 521 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2937  anti-sigma-factor antagonist  38.21 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000434706  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  30.77 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  40.34 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  0.0000024656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  36.5 
 
 		 439 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  30.04 
 
 		 538 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  39.68 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4153  anti-sigma-factor antagonist  36.48 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.893474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  31.93 
 
 		 653 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3857  anti-sigma-factor antagonist  31.43 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1316  anti-sigma-factor antagonist  27.99 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  29.34 
 
 		 549 aa  76.6  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  32.24 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0148  putative PAS/PAC sensor protein  27.73 
 
 		 299 aa  76.3  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2416  anti-sigma-factor antagonist  40.15 
 
 		 288 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5779  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 288 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  35.16 
 
 		 445 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1219  positive regulator of sigma-B  37.82 
 
 		 286 aa  75.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4192  anti-sigma-factor antagonist  35.38 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  33.56 
 
 		 523 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  29.57 
 
 		 694 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  32.46 
 
 		 655 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3016  anti-sigma-factor antagonist  38.69 
 
 		 510 aa  75.1  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000586353  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3609  anti-sigma-factor antagonist  31.79 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.196503  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1270  anti-sigma-factor antagonist  32.89 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1393  anti-sigma-factor antagonist  33.87 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.632841  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2118  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  34.71 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.333632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1936  anti-sigma-factor antagonist  33.09 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.729747  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3442  anti-sigma-factor antagonist  34.42 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3133  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  40.48 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4970  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  33.57 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3437  anti-sigma-factor antagonist  35.16 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0129  anti-sigma-factor antagonist  40.71 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3744  anti-sigma-factor antagonist  33.06 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4411  anti-sigma-factor antagonist  33.11 
 
 		 280 aa  73.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1810  anti-sigma-factor antagonist  33.57 
 
 		 252 aa  72.8  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>