More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4359 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  100 
 
 
356 aa  715    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.21 
 
 
361 aa  325  8.000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  49.3 
 
 
361 aa  323  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 
363 aa  322  5e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  50 
 
 
360 aa  319  5e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.17 
 
 
361 aa  318  1e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  47.73 
 
 
367 aa  317  3e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  46.99 
 
 
339 aa  315  8e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.7 
 
 
367 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.21 
 
 
344 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.06 
 
 
348 aa  304  1.0000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  47.73 
 
 
340 aa  303  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.9 
 
 
340 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.5 
 
 
352 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  48.19 
 
 
360 aa  301  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  49 
 
 
364 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0786  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.07 
 
 
352 aa  299  6e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.41 
 
 
344 aa  296  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.74 
 
 
343 aa  296  3e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.74 
 
 
352 aa  296  3e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  45.96 
 
 
357 aa  296  4e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  44.54 
 
 
356 aa  295  9e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.43 
 
 
364 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.72 
 
 
376 aa  294  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.62 
 
 
377 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.54 
 
 
377 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  47.48 
 
 
349 aa  293  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  48.75 
 
 
363 aa  293  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  48.75 
 
 
363 aa  293  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  42.7 
 
 
356 aa  292  6e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.96 
 
 
354 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.96 
 
 
354 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.71 
 
 
355 aa  289  6e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1140  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.85 
 
 
357 aa  289  6e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.336473  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  47.8 
 
 
344 aa  288  8e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.69 
 
 
378 aa  287  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.51 
 
 
355 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.79 
 
 
353 aa  286  5e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.79 
 
 
350 aa  285  5.999999999999999e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2611  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.45 
 
 
354 aa  285  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2665  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.45 
 
 
354 aa  285  7e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  47.62 
 
 
348 aa  285  8e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0581  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.78 
 
 
351 aa  285  9e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  45.6 
 
 
377 aa  285  1.0000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  47.84 
 
 
384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.79 
 
 
356 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1080  Dihydroorotate oxidase  48.36 
 
 
344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.106041  normal  0.333003 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  46.41 
 
 
336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.86 
 
 
352 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  47.66 
 
 
370 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  45.35 
 
 
363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.76 
 
 
340 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.86 
 
 
364 aa  282  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0895  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.2 
 
 
352 aa  281  1e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.934158  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0825  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.2 
 
 
352 aa  281  1e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.454847  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  44.16 
 
 
355 aa  281  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.07 
 
 
348 aa  279  5e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3268  Dihydroorotate oxidase  46.29 
 
 
366 aa  279  7e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.07 
 
 
357 aa  278  7e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.38 
 
 
377 aa  278  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.06 
 
 
356 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1206  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.2 
 
 
352 aa  278  1e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.06 
 
 
356 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.06 
 
 
356 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.94 
 
 
353 aa  278  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0211  dihydroorotate oxidase  46.87 
 
 
342 aa  277  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.69 
 
 
351 aa  277  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.69 
 
 
351 aa  277  2e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.12 
 
 
357 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1788  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.81 
 
 
336 aa  276  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0427694  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0645  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.72 
 
 
337 aa  276  4e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.82 
 
 
377 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  47.2 
 
 
375 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0118  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.34 
 
 
357 aa  275  8e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.469691  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.11 
 
 
339 aa  275  9e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.72 
 
 
352 aa  275  9e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  44.29 
 
 
377 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.41 
 
 
336 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1646  dihydroorotate dehydrogenase  45.51 
 
 
335 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.353277  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.26 
 
 
356 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2061  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.81 
 
 
336 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.16 
 
 
347 aa  273  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.03 
 
 
349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.38 
 
 
349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  46.46 
 
 
352 aa  273  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.53 
 
 
339 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  46.56 
 
 
348 aa  273  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3011  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.16 
 
 
340 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000990874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  45.64 
 
 
361 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00949  dihydroorotate dehydrogenase  46.11 
 
 
336 aa  272  7e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000020271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2698  Dihydroorotate oxidase  46.11 
 
 
336 aa  272  7e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00956  hypothetical protein  46.11 
 
 
336 aa  272  7e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2651  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.11 
 
 
336 aa  272  7e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000533982  hitchhiker  0.00158114 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.29 
 
 
362 aa  272  7e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1054  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.11 
 
 
336 aa  272  7e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000778438  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2372  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.11 
 
 
336 aa  272  7e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000164605  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1060  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.11 
 
 
336 aa  272  7e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116654  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1109  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.11 
 
 
336 aa  272  7e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000226851  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.05 
 
 
354 aa  272  7e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.88 
 
 
344 aa  272  8.000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>