131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4299 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  100 
 
 
662 aa  1361    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  28.24 
 
 
1276 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  30.96 
 
 
602 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.09 
 
 
597 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  31.74 
 
 
604 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4120  hypothetical protein  44.86 
 
 
374 aa  139  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.897659  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.39 
 
 
688 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1305  hypothetical protein  43.09 
 
 
374 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.30538  normal  0.428296 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4214  hypothetical protein  42.44 
 
 
376 aa  134  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  40.11 
 
 
801 aa  133  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  39.57 
 
 
803 aa  131  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.33 
 
 
689 aa  130  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4116  Allergen V5/Tpx-1 family protein  42.41 
 
 
455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0028  hypothetical protein  39.55 
 
 
376 aa  127  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0340  hypothetical protein  41.15 
 
 
492 aa  127  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00130161  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  41.34 
 
 
480 aa  121  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0889  hypothetical protein  39.02 
 
 
421 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465797  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  39.89 
 
 
354 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3736  hypothetical protein  33.58 
 
 
400 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00729537  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  41.05 
 
 
384 aa  115  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.63 
 
 
638 aa  115  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.43 
 
 
396 aa  114  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  39.51 
 
 
375 aa  114  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1159  hypothetical protein  43.78 
 
 
665 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.36 
 
 
413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0383  hypothetical protein  43.78 
 
 
656 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.677432  normal  0.0348791 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  28.7 
 
 
534 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  40.91 
 
 
350 aa  108  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  36.79 
 
 
347 aa  107  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1454  hypothetical protein  41.04 
 
 
459 aa  107  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000963301  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3485  SCP-like extracellular  39.15 
 
 
457 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0975  hypothetical protein  37.57 
 
 
340 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  normal  0.0135476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  38.67 
 
 
654 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0780  hypothetical protein  42.07 
 
 
283 aa  103  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1394  hypothetical protein  35.5 
 
 
415 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3744  hypothetical protein  39.01 
 
 
362 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  27.16 
 
 
584 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  28.19 
 
 
554 aa  102  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.89 
 
 
374 aa  100  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  27.06 
 
 
891 aa  99.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  36.32 
 
 
586 aa  98.6  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  28.65 
 
 
596 aa  98.2  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  27.71 
 
 
1141 aa  96.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.65 
 
 
370 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4678  hypothetical protein  37.63 
 
 
338 aa  96.3  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  37.43 
 
 
600 aa  94.4  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0533  hypothetical protein  26.59 
 
 
481 aa  93.6  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  27.9 
 
 
564 aa  93.6  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.46 
 
 
398 aa  90.9  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  28.97 
 
 
1086 aa  90.5  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4294  hypothetical protein  31.94 
 
 
653 aa  89.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134506  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  26.48 
 
 
596 aa  89.7  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.89 
 
 
722 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0894  hypothetical protein  41.94 
 
 
281 aa  89  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000012433 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1171  hypothetical protein  32.8 
 
 
235 aa  88.6  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1312  hypothetical protein  32.98 
 
 
345 aa  88.2  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.175874  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  26.3 
 
 
597 aa  87.8  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.62 
 
 
376 aa  87.4  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  26.36 
 
 
415 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3541  hypothetical protein  33.16 
 
 
451 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000377942  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4296  hypothetical protein  33.16 
 
 
642 aa  87  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  26.65 
 
 
562 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3540  hypothetical protein  33.7 
 
 
334 aa  84  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4295  hypothetical protein  31.41 
 
 
635 aa  83.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  25.95 
 
 
605 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  33.7 
 
 
601 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4015  hypothetical protein  37.13 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  24.91 
 
 
1025 aa  77.8  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.09 
 
 
397 aa  77.8  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  32.61 
 
 
601 aa  77.8  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  27.24 
 
 
447 aa  77  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5546  hypothetical protein  28.21 
 
 
448 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  25 
 
 
550 aa  77  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2046  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  30.19 
 
 
862 aa  77  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000297905  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  26.37 
 
 
614 aa  75.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4994  hypothetical protein  30.63 
 
 
804 aa  74.3  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.158573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  26.76 
 
 
453 aa  73.9  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  23.26 
 
 
446 aa  73.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  24.84 
 
 
408 aa  72.8  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  27.69 
 
 
450 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0790  hypothetical protein  24.02 
 
 
460 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  27.55 
 
 
398 aa  69.7  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2723  hypothetical protein  25.38 
 
 
550 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  25.2 
 
 
873 aa  68.9  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  26.8 
 
 
436 aa  68.9  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  23.39 
 
 
544 aa  67.8  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  27.05 
 
 
425 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.62 
 
 
500 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  26.61 
 
 
442 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  26.61 
 
 
442 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  26.61 
 
 
442 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  26.61 
 
 
442 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  26.61 
 
 
442 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  26.61 
 
 
442 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  26.61 
 
 
442 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  26.22 
 
 
437 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3314  hypothetical protein  22.31 
 
 
500 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.275186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  25.32 
 
 
326 aa  64.3  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  23.85 
 
 
450 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  25.79 
 
 
444 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>