More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4247 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4247  ammonium transporter  100 
 
 
495 aa  963    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0572561  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3023  ammonium transporter  51.88 
 
 
525 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0919  ammonium transporter  49.36 
 
 
481 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.546186  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  43.54 
 
 
446 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  42.83 
 
 
468 aa  318  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  43.22 
 
 
471 aa  316  6e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2528  ammonium transporter  42.74 
 
 
461 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  39.96 
 
 
478 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  41.54 
 
 
445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  42.86 
 
 
444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2955  ammonium transporter  42.73 
 
 
518 aa  303  5.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  42.92 
 
 
460 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  39.96 
 
 
478 aa  302  9e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  42.29 
 
 
435 aa  302  1e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0782  ammonium transporter  41.65 
 
 
511 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  42.29 
 
 
435 aa  302  1e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  40.04 
 
 
525 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  39.36 
 
 
469 aa  293  4e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  41.41 
 
 
515 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  41.41 
 
 
515 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1499  ammonium transporter  39.91 
 
 
584 aa  290  5.0000000000000004e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907074  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  42.83 
 
 
449 aa  289  7e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  40.34 
 
 
461 aa  289  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3636  ammonium transporter  40.45 
 
 
509 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.348655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4446  ammonium transporter  38.13 
 
 
541 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  40.86 
 
 
483 aa  281  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  40.13 
 
 
441 aa  280  3e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4312  ammonium transporter  36.57 
 
 
506 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3305  ammonium transporter  39.22 
 
 
408 aa  277  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  38.86 
 
 
458 aa  276  5e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  39.78 
 
 
497 aa  276  7e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2218  ammonium transporter  40.12 
 
 
506 aa  272  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1729  ammonium transporter  40.6 
 
 
507 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.427726  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1530  ammonium transporter  39.14 
 
 
512 aa  269  8e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1656  ammonium transporter  40.13 
 
 
507 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0646033  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2248  ammonium transporter  38.92 
 
 
433 aa  266  8e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  40.44 
 
 
441 aa  266  8e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2018  ammonium transporter  37.81 
 
 
478 aa  264  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.678584  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3599  ammonium transporter  38.97 
 
 
417 aa  262  1e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1341  ammonium transporter  40.77 
 
 
442 aa  259  8e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000498095  unclonable  0.00000143333 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  36.77 
 
 
433 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  37.95 
 
 
1209 aa  256  5e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.55 
 
 
1262 aa  256  6e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2650  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  38.75 
 
 
1016 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0326651 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28535  Amt family transporter: ammonium  37.53 
 
 
433 aa  252  9.000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0766  ammonium transporter  35.03 
 
 
644 aa  250  4e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1138  ammonium transporter  39.48 
 
 
442 aa  250  5e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0276  ammonium transporter  37.97 
 
 
489 aa  249  6e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1163  ammonium transporter  39.33 
 
 
441 aa  246  6.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000433758  normal  0.156813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4745  ammonium transporter  39.65 
 
 
514 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955224 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  35.24 
 
 
414 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1639  ammonium transporter  37.79 
 
 
489 aa  240  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.294546  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02851  ammonium transporter  36.96 
 
 
486 aa  240  5e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.64492  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02861  ammonium transporter  36.96 
 
 
486 aa  240  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1303  ammonium transporter  38.77 
 
 
447 aa  239  5.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.863538  normal  0.392639 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02961  ammonium transporter  36.74 
 
 
486 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0187  ammonium transporter  38.98 
 
 
452 aa  239  8e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
717 aa  239  9e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03411  ammonium transporter  36.82 
 
 
496 aa  239  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  37.94 
 
 
482 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1629  ammonium transporter  36.82 
 
 
496 aa  239  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0247  ammonium transporter  37.13 
 
 
490 aa  237  4e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  36.76 
 
 
476 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4477  ammonium transporter  35.71 
 
 
488 aa  236  7e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341446  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0144  ammonium transporter  38.39 
 
 
437 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  36.72 
 
 
1322 aa  233  6e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54981  predicted protein  35.37 
 
 
539 aa  232  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4057  ammonium transporter  38.49 
 
 
435 aa  232  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.211238 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3657  ammonium transporter  37.12 
 
 
421 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0916  ammonium transporter  37.5 
 
 
462 aa  231  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685309  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3988  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.06 
 
 
1018 aa  231  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0642  putative ammonium transporter  36.54 
 
 
426 aa  230  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2630  ammonium transporter  38.55 
 
 
440 aa  230  4e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10881  predicted protein  37.04 
 
 
434 aa  230  5e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0264746  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13418  predicted protein  36.93 
 
 
437 aa  230  5e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0663  ammonium transporter  33.89 
 
 
407 aa  227  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11128  predicted protein  34.32 
 
 
441 aa  226  6e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.40985  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3571  ammonium transporter  35.64 
 
 
446 aa  226  8e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0265  ammonium transporter  35.67 
 
 
487 aa  223  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_1813  predicted protein  34.83 
 
 
433 aa  222  9.999999999999999e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229105  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3162  Rh-like protein/ammonium transporter  36.11 
 
 
416 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0234598  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2892  ammonium transporter  38.33 
 
 
404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0140736  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.06 
 
 
1264 aa  213  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.354443 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2151  ammonium transporter  33.33 
 
 
611 aa  212  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3089  ammonium transporter  35.64 
 
 
441 aa  211  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  34.63 
 
 
409 aa  210  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1757  ammonium transporter  34.48 
 
 
437 aa  210  5e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3831  ammonium transporter  34.32 
 
 
416 aa  210  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0618394  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27877  predicted protein  39.54 
 
 
521 aa  209  6e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2954  ammonium transporter  33.54 
 
 
488 aa  209  7e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0196  putative ammonium transporter, marine subtype  35.18 
 
 
417 aa  209  8e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0210  ammonium transporter  34.33 
 
 
439 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1788  Rh-like protein/ammonium transporter  34.94 
 
 
496 aa  206  5e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0293  Rh family protein/ammonium transporter  36.21 
 
 
449 aa  207  5e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.825675  normal  0.151871 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3649  ammonium transporter  33.69 
 
 
416 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243704  hitchhiker  0.000385246 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0798  ammonium transporter  33.69 
 
 
416 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0469975  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3707  ammonium transporter  33.69 
 
 
416 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00259002  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0760  ammonium transporter  34.13 
 
 
408 aa  204  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  34.78 
 
 
457 aa  204  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00480  putative ammonium transporter  36.92 
 
 
415 aa  204  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>