More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4165 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  100 
 
 
355 aa  724    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  75.77 
 
 
355 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  74.37 
 
 
355 aa  548  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  74.08 
 
 
355 aa  549  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  60.73 
 
 
355 aa  437  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  59.38 
 
 
356 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  58.76 
 
 
358 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  58.24 
 
 
355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  53.93 
 
 
358 aa  395  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  56.82 
 
 
355 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  53.11 
 
 
355 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.02 
 
 
357 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.74 
 
 
357 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.44 
 
 
357 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.14 
 
 
357 aa  359  4e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.15 
 
 
354 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.93 
 
 
364 aa  355  5e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.91 
 
 
355 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50 
 
 
356 aa  342  8e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  47.9 
 
 
358 aa  341  9e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.02 
 
 
355 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.07 
 
 
359 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.63 
 
 
357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.18 
 
 
355 aa  335  9e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.37 
 
 
357 aa  333  2e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.09 
 
 
357 aa  329  5.0000000000000004e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.9 
 
 
356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.45 
 
 
376 aa  319  3.9999999999999996e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.75 
 
 
357 aa  318  6e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.79 
 
 
355 aa  304  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.45 
 
 
355 aa  301  9e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.05 
 
 
344 aa  275  6e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  40.79 
 
 
353 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.18 
 
 
358 aa  271  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.53 
 
 
354 aa  270  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  40.56 
 
 
355 aa  263  4e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.03 
 
 
354 aa  260  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  40.34 
 
 
349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.83 
 
 
351 aa  250  2e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.33 
 
 
397 aa  192  9e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  35.22 
 
 
396 aa  191  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  33.43 
 
 
365 aa  189  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  35.96 
 
 
411 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  34.82 
 
 
400 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  35.67 
 
 
411 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.96 
 
 
353 aa  179  4.999999999999999e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  34.62 
 
 
400 aa  179  7e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.95 
 
 
320 aa  178  1e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  35.38 
 
 
411 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.82 
 
 
400 aa  177  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0054  Nucleotidyl transferase  39.15 
 
 
243 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03410  Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.9 
 
 
293 aa  172  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0401967  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  33.43 
 
 
414 aa  171  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2458  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.82 
 
 
291 aa  170  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2763  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.84 
 
 
300 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010329  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  33.04 
 
 
400 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1335  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  35.04 
 
 
245 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.161343  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4180  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.71 
 
 
293 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.112992  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  33.24 
 
 
411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  38.4 
 
 
291 aa  166  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.771831 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  33.13 
 
 
399 aa  166  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1373  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.62 
 
 
245 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1267  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.62 
 
 
245 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1115  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.62 
 
 
245 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4074  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.62 
 
 
245 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  32.34 
 
 
399 aa  166  8e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  34.23 
 
 
400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.57 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1109  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.62 
 
 
245 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1296  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.62 
 
 
245 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  32.53 
 
 
401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1399  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.82 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  33.82 
 
 
405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2342  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.66 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2377  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.27 
 
 
299 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217402  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1135  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.19 
 
 
245 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1228  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.19 
 
 
245 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4141  Nucleotidyl transferase  36.29 
 
 
253 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020886 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
402 aa  162  6e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1194  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.95 
 
 
292 aa  162  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.55 
 
 
286 aa  162  7e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0826  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.13 
 
 
291 aa  162  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0797  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.13 
 
 
291 aa  162  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0208  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.11 
 
 
287 aa  162  8.000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01945  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.26 
 
 
292 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1786  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.45 
 
 
292 aa  161  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4022  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.83 
 
 
286 aa  161  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3121  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.97 
 
 
293 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2321  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.13 
 
 
294 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00736153 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0479  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.82 
 
 
293 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.778561  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0597  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.82 
 
 
293 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.290033  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1423  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.4 
 
 
291 aa  161  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1224  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  37.55 
 
 
289 aa  161  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6649  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.71 
 
 
298 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6247  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.71 
 
 
298 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0385422  normal  0.992107 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1603  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.6 
 
 
292 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.982513  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2411  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.13 
 
 
290 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000385967  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3308  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.13 
 
 
300 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0242939  normal  0.20305 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4018  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.13 
 
 
305 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6654  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.75 
 
 
292 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>