229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4109 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4109  PucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 477 aa  944    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.222567  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0141  transcriptional regulator, CdaR  35.71 
 
 		 525 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  34.38 
 
 		 518 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0390  transcriptional regulator, CdaR  35.58 
 
 		 525 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292319 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 537 aa  113  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2125  CdaR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 553 aa  87  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  29.3 
 
 		 520 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2969  transcriptional regulator, CdaR  29.43 
 
 		 538 aa  86.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00320725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  23.3 
 
 		 555 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  32.64 
 
 		 520 aa  79  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  24.07 
 
 		 739 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  30.25 
 
 		 553 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  34.72 
 
 		 558 aa  74.7  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  40.83 
 
 		 609 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0645  transcriptional regulator, CdaR  39.71 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  29.24 
 
 		 616 aa  70.9  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  32.12 
 
 		 665 aa  70.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3051  hypothetical protein  32.17 
 
 		 740 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  37.5 
 
 		 705 aa  70.9  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3379  putative transcriptional regulator, PucR family  24.04 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.670117  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  34.68 
 
 		 505 aa  70.5  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 563 aa  70.1  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  36.51 
 
 		 404 aa  69.7  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2528  PucR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0819646  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3188  hypothetical protein  30.65 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  26.86 
 
 		 618 aa  67.4  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 564 aa  67  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7915  putative phytochrome sensor protein  34.81 
 
 		 647 aa  67  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2209  PucR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.75848 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 403 aa  66.6  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 305 aa  66.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  31.37 
 
 		 645 aa  66.6  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4325  hypothetical protein  31.54 
 
 		 602 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0842061 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  21.24 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  33.45 
 
 		 614 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  36.9 
 
 		 561 aa  65.1  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  34.74 
 
 		 558 aa  65.1  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3511  putative transcriptional regulator, PucR family  24.04 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  39.42 
 
 		 515 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4407  putative GAF sensor protein  26.61 
 
 		 562 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1641  transcriptional regulator, CdaR  34.55 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1633  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.88 
 
 		 601 aa  63.2  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20880  purine catabolism regulator-like protein  25.69 
 
 		 585 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0170372 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0753  hypothetical protein  30.95 
 
 		 399 aa  63.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0562185  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  36.23 
 
 		 619 aa  63.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0602  DNA-binding protein  29.84 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.386136  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  28.52 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5254  putative transcriptional regulator, PucR family  31.13 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  35.59 
 
 		 501 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0865  DNA-binding protein  29.84 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  29.84 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  28.52 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1832  putative purine catabolism transcriptional regulator  29.84 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00249141  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  29.84 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  22.51 
 
 		 518 aa  61.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0740  hypothetical protein  30.16 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000706323  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0778  transcriptional regulator, PucR family  34.53 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0658648  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  27.41 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 514 aa  60.1  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  36.51 
 
 		 644 aa  60.1  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  32.31 
 
 		 407 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  39.17 
 
 		 637 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 552 aa  59.3  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  29.94 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0844  putative carbohydrate diacid regulator  26.39 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171192  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1512  transcriptional regulator CdaR  34.38 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.428477  normal  0.947433 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2555  PucR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 524 aa  57.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13215  normal  0.819457 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0388  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.33 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701457  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4405  transcriptional regulator, CdaR  33.11 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  39.19 
 
 		 493 aa  57.8  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5503  putative transcriptional regulator, PucR family  24.16 
 
 		 600 aa  57.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160149 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 597 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  40.51 
 
 		 648 aa  56.6  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0851  putative carbohydrate diacid regulator  25.69 
 
 		 353 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  29.25 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  46.88 
 
 		 486 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4625  CdaR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 535 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  29.57 
 
 		 403 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  39.39 
 
 		 399 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1388  transcriptional regulator, PucR family  33.96 
 
 		 543 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3483  transcriptional regulator, PucR family  36.14 
 
 		 543 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0571772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  32.99 
 
 		 514 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1029  transcriptional regulator CdaR  32.26 
 
 		 536 aa  55.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133296 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2522  hypothetical protein  24.59 
 
 		 616 aa  54.7  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0150  transcriptional regulator, CdaR  32.4 
 
 		 384 aa  54.7  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2687  transcriptional regulator, CdaR  45.07 
 
 		 387 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2639  transcriptional regulator, CdaR  45.07 
 
 		 387 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1801  transcriptional regulator, PucR family  28.7 
 
 		 562 aa  54.7  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2860  transcriptional regulator CdaR  45.07 
 
 		 387 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2592  carbohydrate diacid regulator (sugar diacid regulator)  41.89 
 
 		 381 aa  54.3  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  31.15 
 
 		 371 aa  54.7  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  35.8 
 
 		 478 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2728  transcriptional regulator, CdaR  45.07 
 
 		 393 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7095  transcriptional regulator, CdaR  42.25 
 
 		 575 aa  54.3  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.108569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0531  transcriptional regulator, PucR family  35.71 
 
 		 512 aa  53.5  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3443  transcriptional regulator, CdaR  30.07 
 
 		 741 aa  53.5  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  37.36 
 
 		 515 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1140  transcriptional regulator, CdaR  39.13 
 
 		 377 aa  53.5  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000252697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  33.33 
 
 		 480 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>