More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4078 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  40.43 
 
 		 863 aa  645    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  44.02 
 
 		 870 aa  746    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  44.65 
 
 		 858 aa  748    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  44.28 
 
 		 871 aa  690    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  42.21 
 
 		 869 aa  696    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  43.23 
 
 		 856 aa  647    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  44.71 
 
 		 858 aa  762    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  43.3 
 
 		 854 aa  652    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  42.52 
 
 		 856 aa  639    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  42.81 
 
 		 872 aa  672    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  40.32 
 
 		 872 aa  636    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  41.21 
 
 		 867 aa  702    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  42.95 
 
 		 856 aa  640    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  41.02 
 
 		 855 aa  643    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  42.56 
 
 		 850 aa  644    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  40.43 
 
 		 858 aa  648    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  53.71 
 
 		 968 aa  932    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  42.76 
 
 		 856 aa  654    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  41.36 
 
 		 853 aa  639    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  41.35 
 
 		 859 aa  645    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  47.36 
 
 		 862 aa  829    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  41.44 
 
 		 853 aa  645    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  41.75 
 
 		 900 aa  705    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  44.95 
 
 		 898 aa  675    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  42.95 
 
 		 874 aa  657    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  43.51 
 
 		 863 aa  667    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  41.54 
 
 		 860 aa  636    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  44.04 
 
 		 870 aa  712    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  41.78 
 
 		 872 aa  654    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  43.16 
 
 		 872 aa  648    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  44.35 
 
 		 872 aa  700    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  39.7 
 
 		 863 aa  647    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  44.73 
 
 		 873 aa  724    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  42.87 
 
 		 932 aa  706    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  42.99 
 
 		 865 aa  644    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  39.81 
 
 		 863 aa  650    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  43.88 
 
 		 863 aa  637    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  43.66 
 
 		 856 aa  655    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  50.42 
 
 		 1088 aa  974    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  42.15 
 
 		 862 aa  652    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  42.1 
 
 		 854 aa  637    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 928 aa  1903    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  44.6 
 
 		 858 aa  733    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  49.43 
 
 		 1085 aa  960    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0191943 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  40.91 
 
 		 828 aa  639    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  42.02 
 
 		 862 aa  645    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  42.48 
 
 		 887 aa  734    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  40.07 
 
 		 871 aa  637    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  42.46 
 
 		 859 aa  652    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  41.61 
 
 		 897 aa  664    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  42.26 
 
 		 869 aa  668    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  42.65 
 
 		 896 aa  710    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  41.95 
 
 		 881 aa  644    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  45.05 
 
 		 882 aa  677    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  40.71 
 
 		 868 aa  660    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  40.28 
 
 		 886 aa  638    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  38.89 
 
 		 910 aa  640    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  39.1 
 
 		 910 aa  642    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  42.84 
 
 		 861 aa  652    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  42.84 
 
 		 861 aa  651    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  41.62 
 
 		 861 aa  643    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  42.87 
 
 		 859 aa  692    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  41.79 
 
 		 854 aa  639    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  43.33 
 
 		 856 aa  651    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  41.96 
 
 		 857 aa  660    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  42.92 
 
 		 889 aa  660    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  41.89 
 
 		 868 aa  652    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  42.95 
 
 		 861 aa  654    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  42.71 
 
 		 870 aa  665    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  41.79 
 
 		 854 aa  645    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  41.92 
 
 		 855 aa  635    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  41.68 
 
 		 854 aa  635  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  40.94 
 
 		 891 aa  635  1e-180  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  40.74 
 
 		 855 aa  634  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  40.65 
 
 		 855 aa  632  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  40.77 
 
 		 874 aa  632  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  39.85 
 
 		 859 aa  633  1e-180  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  42.48 
 
 		 823 aa  633  1e-180  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  40.74 
 
 		 855 aa  635  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  40.19 
 
 		 892 aa  629  1e-179  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  41.43 
 
 		 852 aa  630  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  42.96 
 
 		 930 aa  630  1e-179  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  40.37 
 
 		 857 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  41.32 
 
 		 855 aa  628  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3059  DNA mismatch repair protein MutS  41.21 
 
 		 855 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725135 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  41.32 
 
 		 855 aa  628  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  40.37 
 
 		 857 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  41.32 
 
 		 855 aa  628  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  40.86 
 
 		 857 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  40.67 
 
 		 889 aa  626  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  41.42 
 
 		 855 aa  628  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  40.26 
 
 		 880 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  39.29 
 
 		 875 aa  624  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  41 
 
 		 859 aa  624  1e-177  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  41.77 
 
 		 882 aa  622  1e-177  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  40.39 
 
 		 856 aa  622  1e-177  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  41.77 
 
 		 878 aa  622  1e-177  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  40.22 
 
 		 837 aa  617  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  39.74 
 
 		 856 aa  618  1e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  40.8 
 
 		 851 aa  618  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>