290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4068 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 
164 aa  322  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  51.83 
 
 
164 aa  162  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0516  F0F1 ATP synthase subunit B  49.39 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188958  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1269  F0F1 ATP synthase subunit B  46.95 
 
 
163 aa  120  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  29.45 
 
 
164 aa  93.6  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  34 
 
 
166 aa  90.5  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  30.77 
 
 
181 aa  90.1  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  31.33 
 
 
156 aa  84  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  30 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  34.48 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  34.48 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0560  ATP synthase F0, B subunit  35.76 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0558474  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_499  ATP synthase F0, B subunit  35.76 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000743335  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  33.79 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  33.79 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0534  ATP synthase F0, B subunit  35.1 
 
 
169 aa  82  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0141265  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  33.79 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  33.79 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  34.48 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  34.48 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  33.79 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  34.48 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  34.48 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  34.48 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  34.48 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  34.48 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  34.48 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  33.79 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  33.79 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  33.1 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  30.49 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  33.97 
 
 
157 aa  77  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  29.41 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  26.38 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  31.72 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  31.29 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  30.5 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  32.93 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  29.22 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  30.87 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  31.72 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  29.41 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  30.46 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  31.03 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  29.7 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  27.78 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  31.72 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  31.37 
 
 
168 aa  71.2  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0022  ATP synthase F0, B subunit  29.66 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0311887  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3078  F0F1 ATP synthase subunit B  30 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0404416  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4134  F0F1 ATP synthase subunit B  29.33 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000412529  hitchhiker  0.00502547 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  27.5 
 
 
168 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  31.03 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  29.66 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2614  F0F1 ATP synthase subunit B'  36.49 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434819  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  30.49 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3929  F0F1 ATP synthase subunit B  29.33 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00620185 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4021  F0F1 ATP synthase subunit B  29.33 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165729  normal  0.907421 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0601  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  35.07 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  29.66 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  31.33 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1502  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  35.82 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.661479  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3530  F0F1 ATP synthase subunit B  30.34 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.037276 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  26.88 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  26.88 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  26.88 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2748  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000265032  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  28.97 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  28.97 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  26.88 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  27.92 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  25.83 
 
 
238 aa  67.4  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  26.88 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  26.88 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  26.88 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  28.12 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  27.33 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  26.88 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  26.25 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3175  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.17 
 
 
141 aa  67  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  28.12 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  26.88 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  28.38 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  27.08 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  28.76 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  28.99 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  28 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3879  ATP synthase F0, B subunit  27.52 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000993244  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  29.66 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  27.33 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0063  ATP synthase F0 subunit B  28.66 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  29.66 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3740  ATP synthase F0, B subunit  22.36 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  29.66 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>