122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4065 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4065  Alpha-amylase  100 
 
 		 596 aa  1231    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540437  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  53.43 
 
 		 589 aa  589  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2478  alpha amylase catalytic region  53.68 
 
 		 612 aa  582  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0194919  normal  0.119382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2938  ATPase  51.45 
 
 		 563 aa  551  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2859  Alpha-amylase  55.33 
 
 		 661 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1130  alpha amylase catalytic region  50.98 
 
 		 566 aa  541  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0985  alpha amylase domain-containing protein  47.47 
 
 		 605 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0694969  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05290  glycosidase  51.24 
 
 		 479 aa  478  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4685  alpha amylase catalytic region  43.22 
 
 		 738 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1247  alpha amylase catalytic region  44.31 
 
 		 494 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2896  Alpha-amylase  40.48 
 
 		 722 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.578872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  43.8 
 
 		 679 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2686  alpha amylase, catalytic region  43.08 
 
 		 722 aa  395  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288393 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06910  glycosidase  44.01 
 
 		 470 aa  390  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0553945  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1927  alpha amylase catalytic region  45.49 
 
 		 914 aa  388  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1926  Alpha-amylase  45.6 
 
 		 688 aa  388  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0930  alpha amylase catalytic region  42.28 
 
 		 614 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  42.42 
 
 		 707 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  42.78 
 
 		 2156 aa  342  8e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4292  Alpha-amylase A precursor (1,4-alpha-D-glucan glucanohydrolase)  40.86 
 
 		 528 aa  317  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  35.08 
 
 		 1888 aa  301  3e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0609  alpha amylase, catalytic domain protein  37.93 
 
 		 551 aa  300  6e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3374  alpha amylase catalytic region  28.64 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2728  alpha amylase catalytic region  27.06 
 
 		 453 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2654  alpha amylase catalytic region  29.08 
 
 		 461 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.181273  normal  0.26185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4716  alpha amylase catalytic region  26.26 
 
 		 458 aa  114  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.79094 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  56.12 
 
 		 881 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001376  glycosidase  26.37 
 
 		 449 aa  110  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000319288  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05253  alpha-amylase  30.16 
 
 		 449 aa  110  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1658  putative amylase  54.08 
 
 		 881 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0289  glycosy hydrolase family protein  54.08 
 
 		 882 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0200  putative glucan 1,4-alpha-glucosidase  54.08 
 
 		 882 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3095  alpha amylase catalytic region  25.86 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3370  alpha-amylase  26.9 
 
 		 470 aa  104  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1289  alkaline-resistant alpha-amylase precursor  29.73 
 
 		 458 aa  101  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07402  glucoamylase (Eurofung)  50 
 
 		 661 aa  99.8  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1800  alpha amylase, catalytic region  24.26 
 
 		 627 aa  96.7  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.847837  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05463  conserved hypothetical protein  47.57 
 
 		 385 aa  94.7  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  48.35 
 
 		 767 aa  91.3  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0979  alpha-amylase  25.49 
 
 		 466 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  22.65 
 
 		 649 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0210  alpha amylase catalytic region  25.09 
 
 		 741 aa  82.8  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0538024  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  43.21 
 
 		 623 aa  78.6  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11143  glucoamylase (Eurofung)  31.17 
 
 		 619 aa  78.6  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  21.44 
 
 		 642 aa  78.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0314  hypothetical protein  40.78 
 
 		 644 aa  78.6  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0822878 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2110  alpha amylase catalytic region  27.55 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  25.61 
 
 		 742 aa  67.8  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1319  hypothetical protein  33.93 
 
 		 218 aa  67  0.0000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0191338  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  35 
 
 		 703 aa  65.5  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  26.4 
 
 		 532 aa  64.3  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  24.62 
 
 		 490 aa  62  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3136  glucan 1,4-alpha-maltotetraohydrolase  38.04 
 
 		 555 aa  62  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.815174  hitchhiker  0.00720592 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  24 
 
 		 559 aa  60.5  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  23.91 
 
 		 521 aa  58.2  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26014  predicted protein  34 
 
 		 249 aa  56.6  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0647  glycosidase  26.01 
 
 		 427 aa  56.2  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.701769  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  28.28 
 
 		 739 aa  55.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2778  alpha amylase family protein  22.55 
 
 		 750 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859165  normal  0.73378 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18240  cytoplasmic alpha-amylase  25.19 
 
 		 623 aa  54.3  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.54152  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  23.1 
 
 		 572 aa  53.9  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3153  glycogen branching enzyme  25.86 
 
 		 732 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.252202  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 524 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  28.41 
 
 		 509 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  28.89 
 
 		 526 aa  53.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  26.19 
 
 		 552 aa  52  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36710  glycogen branching enzyme  26.01 
 
 		 732 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.633943 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  22.95 
 
 		 484 aa  50.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1331  hypothetical protein  32.93 
 
 		 753 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3273  cytoplasmic alpha-amylase  22.22 
 
 		 549 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  29.29 
 
 		 555 aa  48.5  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2793  alpha amylase family protein  21.69 
 
 		 750 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00275664  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2293  glycogen branching enzyme  24.72 
 
 		 712 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.467117  hitchhiker  0.000028583 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1048  alpha amylase catalytic region  22.31 
 
 		 613 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3291  cytoplasmic alpha-amylase  22.14 
 
 		 513 aa  47.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000922062  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3551  cytoplasmic alpha-amylase  22.14 
 
 		 513 aa  47.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1785  glycogen branching enzyme  24.43 
 
 		 736 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146996  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2937  alpha amylase domain-containing protein  22.31 
 
 		 613 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3657  glycogen branching enzyme  24.43 
 
 		 736 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0888692  normal  0.0129978 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3508  cytoplasmic alpha-amylase  22.14 
 
 		 513 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4058  glycogen branching enzyme  24.43 
 
 		 736 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  26.06 
 
 		 575 aa  47.8  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  24.74 
 
 		 462 aa  47.4  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3261  cytoplasmic alpha-amylase  22.14 
 
 		 513 aa  47.4  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0208363  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1139  cytoplasmic alpha-amylase  20.88 
 
 		 516 aa  47.4  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  31.82 
 
 		 528 aa  47.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  23.44 
 
 		 561 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3861  glycogen branching enzyme  33.33 
 
 		 759 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3935  glycogen branching enzyme  33.33 
 
 		 759 aa  47  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.277318 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  21.72 
 
 		 620 aa  46.6  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3847  glycogen branching enzyme  33.33 
 
 		 759 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0235209 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00080  alpha-amylase  24.1 
 
 		 456 aa  47  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.52316  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4165  glycogen branching enzyme  27.73 
 
 		 716 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  31.78 
 
 		 528 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3487  cytoplasmic alpha-amylase  22.14 
 
 		 513 aa  47  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  28.46 
 
 		 555 aa  46.2  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1817  glycogen branching enzyme  24.44 
 
 		 736 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.297047 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1758  cytoplasmic alpha-amylase  21.64 
 
 		 513 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.591182  normal  0.938186 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  25.19 
 
 		 1021 aa  45.4  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  22.07 
 
 		 836 aa  45.1  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>