More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4061 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
885 aa  1783    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 
2153 aa  355  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 
2161 aa  350  6e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
3470 aa  348  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
905 aa  338  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
2783 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
911 aa  328  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
880 aa  325  3e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
884 aa  322  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
701 aa  262  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
815 aa  249  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
899 aa  239  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
899 aa  234  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 
725 aa  233  9e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.26 
 
 
718 aa  233  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
695 aa  230  7e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
958 aa  226  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
492 aa  226  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0351302  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.72 
 
 
1042 aa  221  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
893 aa  220  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.68 
 
 
1039 aa  220  8.999999999999998e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.57 
 
 
944 aa  219  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 
581 aa  219  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
546 aa  211  5e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
584 aa  211  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
585 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 
453 aa  210  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
754 aa  209  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  33.24 
 
 
762 aa  208  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 
827 aa  208  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 
594 aa  208  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
584 aa  207  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
489 aa  207  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 
677 aa  207  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
612 aa  207  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 
458 aa  206  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
758 aa  206  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
556 aa  205  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
556 aa  204  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 
460 aa  204  8e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 
755 aa  203  9e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
590 aa  203  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 
722 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
596 aa  201  5e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
599 aa  201  6e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
444 aa  200  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
587 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4649  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
533 aa  199  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
582 aa  198  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  32.33 
 
 
587 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  32.33 
 
 
587 aa  197  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  32.33 
 
 
587 aa  197  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  32.33 
 
 
608 aa  196  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
608 aa  196  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  32.33 
 
 
587 aa  196  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  32.33 
 
 
587 aa  196  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 
608 aa  195  3e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
752 aa  195  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  32.32 
 
 
537 aa  194  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  32.05 
 
 
587 aa  194  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  32.05 
 
 
587 aa  194  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  32.05 
 
 
587 aa  194  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.53 
 
 
1021 aa  195  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 
1010 aa  194  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  32.05 
 
 
587 aa  194  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 
634 aa  193  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.98 
 
 
1002 aa  193  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 
600 aa  192  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
597 aa  192  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
597 aa  192  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
590 aa  192  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 
637 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 
589 aa  191  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 
1043 aa  191  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
592 aa  191  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
585 aa  191  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.46 
 
 
711 aa  190  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 
608 aa  190  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 
719 aa  189  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.688425  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 
1207 aa  189  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1678  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 
726 aa  189  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.62189  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 
371 aa  188  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 
587 aa  188  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4463  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 
839 aa  188  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
763 aa  187  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.508031  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
874 aa  187  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 
612 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 
608 aa  187  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
709 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
592 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  31.16 
 
 
470 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
456 aa  185  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  31.9 
 
 
613 aa  185  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 
377 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 
718 aa  184  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.149473  decreased coverage  0.00105308 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
619 aa  184  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2533  sensory box histidine kinase YycG  30.98 
 
 
610 aa  184  8.000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0147  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
588 aa  183  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.22 
 
 
754 aa  183  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
609 aa  183  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>