More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4028 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4028  ABC-3 protein  100 
 
 		 306 aa  596  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1722  ABC-3 protein  60 
 
 		 293 aa  332  6e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0330  ATP-binding domain-containing protein  52.3 
 
 		 314 aa  308  6.999999999999999e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0623  ABC-3 protein  60.5 
 
 		 377 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00133285  normal  0.138429 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3068  ABC-3 protein  58.66 
 
 		 295 aa  303  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0170386  hitchhiker  0.00089056 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02045  zinc ABC transporter, permease protein  52.84 
 
 		 370 aa  291  8e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.976238  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3555  ABC-3 protein  55.1 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0032  ABC-3 protein  49.5 
 
 		 307 aa  276  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3284  ABC-3 protein  46.53 
 
 		 307 aa  271  7e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0690  ABC-3 protein  63.54 
 
 		 385 aa  266  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  0.0173595 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  48.25 
 
 		 351 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1031  hypothetical protein  47.62 
 
 		 415 aa  247  2e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1224  zinc ABC transporter, permease protein  52.7 
 
 		 304 aa  244  1.9999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5756  ABC-3 protein  51.09 
 
 		 421 aa  237  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382564  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0224  ABC-3 protein  39.86 
 
 		 299 aa  235  7e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1276  ABC-3 protein  53.79 
 
 		 355 aa  220  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2027  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  42.35 
 
 		 428 aa  220  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.23567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2147  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  39.29 
 
 		 466 aa  209  6e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03370  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  42.05 
 
 		 296 aa  195  8.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0703  ABC-3 protein  34.83 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000520849  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0100  hypothetical protein  38.29 
 
 		 400 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2851  hypothetical protein  39.25 
 
 		 409 aa  169  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2082  hypothetical protein  38.91 
 
 		 399 aa  165  6.9999999999999995e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.265611 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  33.79 
 
 		 288 aa  162  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  33.79 
 
 		 288 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  33.79 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  33.79 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  34.26 
 
 		 280 aa  157  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  36.03 
 
 		 304 aa  155  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  34.81 
 
 		 281 aa  152  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  36.19 
 
 		 280 aa  149  5e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  33.45 
 
 		 289 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  32.38 
 
 		 288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  35.56 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1993  ABC-3 protein  36.42 
 
 		 471 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  40.3 
 
 		 280 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  32.85 
 
 		 285 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  33.94 
 
 		 277 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  36.09 
 
 		 278 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  36.09 
 
 		 278 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 312 aa  139  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  33.68 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  38.81 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  33.92 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  32.53 
 
 		 282 aa  133  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  36.1 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  35.5 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  34.95 
 
 		 312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  30.94 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  34.81 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  34.81 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2028  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  31.54 
 
 		 293 aa  129  7.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  32.59 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  31.21 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  33.33 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1401  ABC-3 protein  31.54 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0344976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  35.92 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  31.19 
 
 		 297 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  35.86 
 
 		 278 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  31.19 
 
 		 297 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  31.19 
 
 		 297 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  32.32 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  32.1 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1992  ABC-3 protein  35.77 
 
 		 458 aa  122  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  31.94 
 
 		 285 aa  122  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2617  ABC-3 protein  33.12 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.60645 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  32.41 
 
 		 290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  31.34 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  31.2 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  33.46 
 
 		 304 aa  119  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  30.29 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  30.29 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  35.43 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  31.65 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  29.97 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  29.97 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  29.97 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  29.97 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  29.97 
 
 		 286 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02050  zinc ABC transporter, permease protein  29.58 
 
 		 386 aa  116  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2052  hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  116  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.146645  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3556  ABC-3 protein  31.51 
 
 		 366 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  31.73 
 
 		 287 aa  115  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0341  ABC transporter, permease protein, putative  29.8 
 
 		 447 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  31.87 
 
 		 303 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  28.67 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  28.67 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  33.72 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0033  ABC-3 protein  30.23 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.042942  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  34.73 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  31.83 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  29.07 
 
 		 285 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000869047 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  27.68 
 
 		 272 aa  114  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1721  MarR family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 370 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5660  hypothetical protein  30.99 
 
 		 288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.721685  normal  0.0964649 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0331  ATP-binding domain-containing protein  30.26 
 
 		 368 aa  113  5e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  31 
 
 		 287 aa  112  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1813  ABC-3 protein  30.31 
 
 		 294 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00569074  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1703  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeC  30.31 
 
 		 294 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  32.61 
 
 		 285 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>