More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3934 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
280 aa  536  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  50.36 
 
 
279 aa  236  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  43.41 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  41.53 
 
 
280 aa  182  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  35 
 
 
267 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  34.29 
 
 
267 aa  159  7e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  34.64 
 
 
267 aa  158  8e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  41.9 
 
 
281 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  57.78 
 
 
242 aa  151  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  37.15 
 
 
290 aa  149  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  37.96 
 
 
261 aa  146  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  41.2 
 
 
281 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.2 
 
 
281 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  34.97 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1818  phosphatidate cytidylyltransferase  36.24 
 
 
332 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955485  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  35.05 
 
 
271 aa  139  7e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  35.59 
 
 
286 aa  139  7e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  34.16 
 
 
295 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  34.16 
 
 
295 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1515  phosphatidate cytidylyltransferase  38.05 
 
 
271 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  38.38 
 
 
262 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  51.64 
 
 
246 aa  132  5e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  56.67 
 
 
273 aa  132  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  43.83 
 
 
303 aa  132  6e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  51.15 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  51.15 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  51.15 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  51.15 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  51.15 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  51.15 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  51.15 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  35.29 
 
 
310 aa  129  6e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0887  phosphatidate cytidylyltransferase  34.42 
 
 
261 aa  129  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000174513  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  33.57 
 
 
269 aa  129  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  32.97 
 
 
264 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  51.15 
 
 
249 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  51.15 
 
 
285 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  51.15 
 
 
285 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  51.97 
 
 
270 aa  128  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  51.15 
 
 
285 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  51.15 
 
 
285 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  51.15 
 
 
285 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  32.09 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  51.59 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  45.22 
 
 
280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3705  phosphatidate cytidylyltransferase  38.24 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  33.93 
 
 
269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  32.97 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  51.15 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  51.15 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  50.39 
 
 
282 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  50.39 
 
 
282 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  50.39 
 
 
282 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  37.1 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  35 
 
 
262 aa  126  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  31.93 
 
 
277 aa  125  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  53.08 
 
 
282 aa  125  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  49.31 
 
 
290 aa  125  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1385  putative phosphatidate cytidylyltransferase  34.78 
 
 
301 aa  125  9e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.681736  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  51.06 
 
 
276 aa  125  9e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  31.07 
 
 
285 aa  125  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  34.15 
 
 
275 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  30.36 
 
 
285 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  30.82 
 
 
285 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
475 aa  124  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0394  phosphatidate cytidylyltransferase  37.32 
 
 
288 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  46.58 
 
 
260 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
281 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  46.94 
 
 
266 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  44.52 
 
 
280 aa  123  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  36.67 
 
 
260 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  31.58 
 
 
285 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  36.67 
 
 
260 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  34.96 
 
 
341 aa  123  4e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  48.09 
 
 
285 aa  122  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  47.24 
 
 
259 aa  122  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  47.48 
 
 
287 aa  122  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0961  phosphatidate cytidylyltransferase  36.58 
 
 
283 aa  122  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  48.09 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  32.23 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0934  phosphatidate cytidylyltransferase  33.97 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  50.38 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00106784  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  49.64 
 
 
302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3431  phosphatidate cytidylyltransferase  33.9 
 
 
304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  43.84 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  29.86 
 
 
261 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  56.36 
 
 
278 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  33.09 
 
 
284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  30.32 
 
 
263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1858  phosphatidate cytidylyltransferase  49.23 
 
 
276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.502939  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  33.33 
 
 
263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  32.88 
 
 
280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2232  phosphatidate cytidylyltransferase  34.18 
 
 
295 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  46.26 
 
 
260 aa  119  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2286  phosphatidate cytidylyltransferase  34.18 
 
 
295 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318424 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2080  phosphatidate cytidylyltransferase  41.44 
 
 
293 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  51.28 
 
 
265 aa  118  9e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.62 
 
 
368 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  47.06 
 
 
211 aa  118  9.999999999999999e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>