More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3928 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3928  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 299 aa  606  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0609  ApbE family lipoprotein  45.93 
 
 		 316 aa  243  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104099 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0542  ApbE family lipoprotein  45.28 
 
 		 313 aa  229  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.206913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0226  ApbE family lipoprotein  48.03 
 
 		 305 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2128  ApbE family lipoprotein  42.34 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0696  ApbE family lipoprotein  37.2 
 
 		 360 aa  170  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2080  ApbE family lipoprotein  36.89 
 
 		 370 aa  165  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.744114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1182  ApbE family lipoprotein  37.14 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00699622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  30.82 
 
 		 341 aa  119  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  30.62 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2592  ApbE family lipoprotein  33.81 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  29.76 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  32.52 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  31.01 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  32.36 
 
 		 326 aa  113  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  29.06 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.26 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4425  ApbE family lipoprotein  37.33 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205443  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.46 
 
 		 336 aa  107  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  29.84 
 
 		 336 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  26.34 
 
 		 381 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  29.96 
 
 		 348 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  30 
 
 		 345 aa  102  9e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  31.48 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  25.51 
 
 		 360 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.11 
 
 		 357 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3829  ApbE family lipoprotein  32.89 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0256757  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  30 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  32.36 
 
 		 351 aa  99.4  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.27 
 
 		 367 aa  99.4  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2585  ApbE-like lipoprotein  36.78 
 
 		 350 aa  99.4  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.501359  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.72 
 
 		 363 aa  99  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  30.15 
 
 		 331 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.3 
 
 		 350 aa  98.6  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  31.8 
 
 		 336 aa  98.2  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  29.62 
 
 		 350 aa  98.6  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  31.11 
 
 		 300 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  31.11 
 
 		 300 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  27.05 
 
 		 309 aa  97.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  26.44 
 
 		 366 aa  96.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  25.9 
 
 		 323 aa  96.3  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  28.95 
 
 		 323 aa  96.7  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  29.93 
 
 		 337 aa  96.3  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.01 
 
 		 332 aa  95.5  9e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.72 
 
 		 351 aa  95.5  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0695  ApbE-like lipoprotein  28.35 
 
 		 337 aa  95.5  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  29.07 
 
 		 343 aa  95.5  9e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  22.53 
 
 		 350 aa  95.1  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  29.79 
 
 		 338 aa  94.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  24.61 
 
 		 342 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  30.48 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  30.74 
 
 		 344 aa  94.4  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  27.37 
 
 		 351 aa  94  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  27.37 
 
 		 351 aa  94  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.33 
 
 		 331 aa  94  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  28.33 
 
 		 345 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  27.96 
 
 		 325 aa  94  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  28.33 
 
 		 359 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02100  hypothetical protein  27.37 
 
 		 351 aa  94  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.873608  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.37 
 
 		 351 aa  94  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.37 
 
 		 351 aa  94  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.37 
 
 		 351 aa  94  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1926  ApbE family lipoprotein  30.63 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0099815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2400  ApbE family lipoprotein  31 
 
 		 302 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00541927  hitchhiker  0.00229612 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  27.78 
 
 		 348 aa  93.6  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.82 
 
 		 349 aa  93.6  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0414  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  26.62 
 
 		 325 aa  93.6  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0146647  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2103  apbE family protein  29.3 
 
 		 275 aa  93.2  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  31.25 
 
 		 380 aa  93.2  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.03 
 
 		 334 aa  92.8  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  29.2 
 
 		 317 aa  92.8  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1893  ApbE family lipoprotein  30.63 
 
 		 301 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000770435  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1919  ApbE family lipoprotein  30.63 
 
 		 301 aa  92.8  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000213083  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  28.67 
 
 		 336 aa  92.4  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  29.57 
 
 		 379 aa  91.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  35.04 
 
 		 331 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  29.72 
 
 		 343 aa  92  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  30.08 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0955  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  27.7 
 
 		 345 aa  91.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  27.54 
 
 		 344 aa  91.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.42 
 
 		 343 aa  90.9  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03269  hypothetical protein  24.83 
 
 		 379 aa  90.9  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  28.52 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  30.71 
 
 		 370 aa  91.3  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  28.15 
 
 		 341 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  29.02 
 
 		 349 aa  90.5  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  29.02 
 
 		 349 aa  90.5  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  25 
 
 		 316 aa  90.1  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0092  ApbE family lipoprotein  31.32 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0025456  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  34.65 
 
 		 368 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  24.91 
 
 		 335 aa  89.7  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.67 
 
 		 351 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  27.9 
 
 		 350 aa  89.7  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  33.33 
 
 		 345 aa  89.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  28.38 
 
 		 342 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.67 
 
 		 351 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2787  apbE family protein  29.55 
 
 		 305 aa  87.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.778889  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2492  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.52 
 
 		 350 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2450  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.52 
 
 		 350 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247044 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  32.35 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>