More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3911 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



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Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  100 
 
 
388 aa  750  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  59.25 
 
 
428 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  1.19825e-05 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  34.68 
 
 
389 aa  191  3e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  35.8 
 
 
394 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  36.29 
 
 
453 aa  180  5e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.32 
 
 
395 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  34.18 
 
 
456 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  32.92 
 
 
385 aa  174  3e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  36.31 
 
 
456 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.95 
 
 
390 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  33.77 
 
 
454 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  33.94 
 
 
397 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.95 
 
 
390 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  34.88 
 
 
390 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  35.14 
 
 
447 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.13 
 
 
392 aa  171  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  33.43 
 
 
398 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  34.8 
 
 
383 aa  169  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.23 
 
 
387 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.99 
 
 
404 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  34.2 
 
 
446 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  32.58 
 
 
444 aa  167  3e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  35.84 
 
 
450 aa  167  3e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  34.89 
 
 
382 aa  167  3e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  34.55 
 
 
450 aa  165  1e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  34.35 
 
 
392 aa  165  1e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.98 
 
 
450 aa  164  2e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.13 
 
 
387 aa  165  2e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  33.33 
 
 
455 aa  163  4e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  33.76 
 
 
393 aa  163  4e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  33.25 
 
 
392 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  31.02 
 
 
393 aa  162  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.15 
 
 
382 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  33.63 
 
 
401 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  35.22 
 
 
396 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.29 
 
 
393 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.61 
 
 
391 aa  159  6e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.33 
 
 
441 aa  159  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  34.44 
 
 
396 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  34.44 
 
 
396 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  34.44 
 
 
396 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.19 
 
 
379 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  32.72 
 
 
401 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.45 
 
 
386 aa  157  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  1.35911e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  33.12 
 
 
401 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  34.39 
 
 
428 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  33.24 
 
 
442 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  32.39 
 
 
379 aa  154  3e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  32.83 
 
 
399 aa  153  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  33.51 
 
 
456 aa  153  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.51 
 
 
400 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  33.42 
 
 
463 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2446  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  36.24 
 
 
465 aa  151  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.853251  decreased coverage  4.39073e-08 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  34.28 
 
 
432 aa  150  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  32.97 
 
 
483 aa  149  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  31.3 
 
 
418 aa  149  9e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  31.5 
 
 
456 aa  148  1e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  31.27 
 
 
376 aa  149  1e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  32.17 
 
 
454 aa  149  1e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.06 
 
 
469 aa  148  2e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4248  chromate transporter  33.52 
 
 
450 aa  146  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.11 
 
 
468 aa  146  7e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  31.78 
 
 
390 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  31.78 
 
 
390 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  30.81 
 
 
376 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  31.78 
 
 
390 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  31.04 
 
 
420 aa  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1753  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.78 
 
 
467 aa  143  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4665  putative chromate transporter  31.71 
 
 
463 aa  143  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6162  chromate transporter  31.43 
 
 
466 aa  142  1e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1532  chromate transporter  32.2 
 
 
452 aa  140  5e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1475  chromate transporter  32.5 
 
 
467 aa  139  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.215191 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0742  chromate transporter  31.32 
 
 
461 aa  137  3e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3131  chromate transporter  29.74 
 
 
454 aa  137  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3337  chromate transporter  29.74 
 
 
454 aa  137  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4736  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.78 
 
 
471 aa  136  6e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3651  chromate transporter  32.23 
 
 
469 aa  135  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.947336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.98 
 
 
441 aa  135  1e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6097  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.66 
 
 
469 aa  134  2e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2389  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.17 
 
 
473 aa  134  2e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443126  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  31.32 
 
 
443 aa  132  8e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  34.2 
 
 
417 aa  132  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2679  chromate transporter  31.36 
 
 
443 aa  132  1e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  32.39 
 
 
460 aa  130  5e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  31.38 
 
 
378 aa  130  5e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4194  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.22 
 
 
469 aa  129  7e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  28.21 
 
 
376 aa  127  2e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2724  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.56 
 
 
473 aa  127  4e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506221  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  28.91 
 
 
383 aa  127  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.01 
 
 
352 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  27.12 
 
 
408 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  27.67 
 
 
408 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  30.52 
 
 
402 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0153  chromate transporter  31.17 
 
 
466 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.193683  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.41 
 
 
395 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0139  chromate transporter  31.75 
 
 
462 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3638  chromate transporter  32.21 
 
 
431 aa  122  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46355  normal  0.675394 
 
 
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NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.68 
 
 
415 aa  121  2e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  27.86 
 
 
383 aa  121  2e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  30.38 
 
 
401 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal 
 
 
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