More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3773 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3773  RNA methyltransferase  100 
 
 
246 aa  496  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3458  RNA methyltransferase  61.63 
 
 
252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4394  RNA methyltransferase  62.14 
 
 
248 aa  289  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.528228  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2692  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  57.14 
 
 
252 aa  256  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107399  normal  0.310165 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1828  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  46.47 
 
 
264 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.08 
 
 
315 aa  223  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  45.49 
 
 
277 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  45.27 
 
 
243 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.35 
 
 
245 aa  215  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0088  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  45.56 
 
 
246 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2734  RNA methyltransferase  39.92 
 
 
289 aa  209  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2420  RNA methyltransferase  39.92 
 
 
289 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0401  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.86 
 
 
246 aa  209  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0086  RNA methyltransferase  41.15 
 
 
247 aa  208  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239075  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  40.74 
 
 
247 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0091  RNA methyltransferase  40.74 
 
 
247 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0088  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  40.74 
 
 
247 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0087  TrmH family tRNA methyltransferase  40.74 
 
 
247 aa  206  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.74 
 
 
247 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000258465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.74 
 
 
247 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  40.74 
 
 
247 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000227809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.74 
 
 
247 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000196945  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.89 
 
 
247 aa  205  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0086  RNA methyltransferase  40 
 
 
247 aa  205  7e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000284808  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  44.86 
 
 
246 aa  204  9e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  44.72 
 
 
246 aa  198  6e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0305  RNA methyltransferase  38.93 
 
 
249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00990  RNA methyltransferase  39.34 
 
 
244 aa  191  7e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314375  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1822  rRNA methylase  35.8 
 
 
249 aa  191  9e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1356  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.92 
 
 
250 aa  189  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000394989  hitchhiker  8.416419999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  35.39 
 
 
247 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.5 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  40.91 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  38.93 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0209  RNA methyltransferase  37.45 
 
 
251 aa  181  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  39.18 
 
 
248 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  39.18 
 
 
248 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1867  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.27 
 
 
246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40.49 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2067  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.21 
 
 
326 aa  179  4e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2730  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.74 
 
 
255 aa  179  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.751116  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0507  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.46 
 
 
322 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533536  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  36.99 
 
 
245 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.3 
 
 
249 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1909  RNA methyltransferase  39.92 
 
 
256 aa  178  7e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000520024  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3322  RNA methyltransferase  39.75 
 
 
248 aa  177  9e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.752431  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4020  RNA methyltransferase  41.42 
 
 
314 aa  177  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.980605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2481  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.39 
 
 
246 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314444  hitchhiker  0.00338936 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0122  tRNA/rRNA methyltransferase  37.7 
 
 
247 aa  177  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.96 
 
 
256 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.55 
 
 
256 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0971  rRNA methylase-like protein  41.06 
 
 
322 aa  175  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0172  RNA methyltransferase  36.44 
 
 
249 aa  175  6e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0806813  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  38.68 
 
 
245 aa  175  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0174  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.19 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000034032  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  37.55 
 
 
242 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.63 
 
 
248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.73 
 
 
256 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0190  RNA methyltransferase  41.32 
 
 
251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.153268  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03790  rRNA methylase, putative, group 3  38.15 
 
 
300 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000601463  normal  0.201311 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.21 
 
 
292 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.21 
 
 
292 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2172  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.04 
 
 
237 aa  171  6.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146478  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12700  rRNA methylase, putative, group 3  41.32 
 
 
320 aa  171  6.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2285  TrmA family RNA methyltransferase  36.69 
 
 
323 aa  171  9e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.240402  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2398  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.14 
 
 
248 aa  171  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.670056 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35140  rRNA methylase, putative, group 3  38.4 
 
 
312 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19440  rRNA methylase, putative, group 3  37.55 
 
 
256 aa  169  5e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000129696 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0213  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.36 
 
 
324 aa  168  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4413  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.44 
 
 
327 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0712  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.51 
 
 
306 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0405  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.37 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0083776  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1425  rRNA methylase  35.53 
 
 
233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022514  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0359  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  38.68 
 
 
321 aa  166  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2043  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.15 
 
 
253 aa  164  9e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000129806  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0416  RNA methyltransferase  37.34 
 
 
246 aa  164  9e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.896719  normal  0.93402 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0685  rRNA methyltranferase  40.25 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000100052  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4924  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  40.16 
 
 
326 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1474  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.48 
 
 
239 aa  161  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0162513  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4616  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.18 
 
 
251 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2065  rRNA methylase  34.16 
 
 
242 aa  160  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4669  RNA methyltransferase  35.92 
 
 
248 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0289755 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4658  RNA methyltransferase  37.45 
 
 
372 aa  159  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277573  normal  0.477344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4246  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.22 
 
 
363 aa  158  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0974  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.33 
 
 
316 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0793749  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4221  RNA methyltransferase  37.04 
 
 
373 aa  157  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2952  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.92 
 
 
327 aa  157  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4216  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.98 
 
 
245 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4934  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  35.63 
 
 
250 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0580  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.63 
 
 
251 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0340  rRNA methylase  31.56 
 
 
251 aa  157  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000065422  hitchhiker  0.000000457527 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.73 
 
 
248 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0655  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.55 
 
 
319 aa  156  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.229838  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0083  RNA methyltransferase  39 
 
 
250 aa  156  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0781  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  37.3 
 
 
324 aa  155  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208015  normal  0.241731 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3066  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  35.27 
 
 
240 aa  155  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0466903  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0851  RNA methyltransferase TrmH, group 3  31.51 
 
 
336 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.367945  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07630  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.15 
 
 
247 aa  155  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03462  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.73 
 
 
246 aa  155  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1644  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.88 
 
 
234 aa  154  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000329546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>