166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3649 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3649  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
361 aa  718    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0179  anti-sigma-factor antagonist  39.08 
 
 
359 aa  172  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00135922 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  51.5 
 
 
361 aa  166  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0221  anti-sigma-factor antagonist  33.43 
 
 
366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1894  anti-sigma-factor antagonist  36.07 
 
 
344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  32.08 
 
 
361 aa  149  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0373  anti-sigma-factor antagonist  43.35 
 
 
365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4325  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 
359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0978917  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  44.57 
 
 
549 aa  146  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  43.09 
 
 
371 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2206  anti-sigma-factor antagonist  42.2 
 
 
367 aa  142  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  44.32 
 
 
556 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0577  anti-sigma-factor antagonist  33.44 
 
 
385 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  39.63 
 
 
357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  55.83 
 
 
421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0268  anti-sigma-factor antagonist  31.4 
 
 
363 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0598617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  40.74 
 
 
377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  37.63 
 
 
388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4698  anti-sigma-factor antagonist  37.76 
 
 
363 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  28.46 
 
 
362 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5196  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 
365 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4191  anti-sigma-factor antagonist  34.46 
 
 
372 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4192  anti-sigma-factor antagonist  26.7 
 
 
380 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  28.81 
 
 
385 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3609  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 
411 aa  105  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.196503  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2296  anti-sigma-factor antagonist  35.8 
 
 
342 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0948081  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2660  anti-sigma-factor antagonist  29.89 
 
 
359 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1856  anti-sigma-factor antagonist  36.82 
 
 
365 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.616563 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  36.67 
 
 
372 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1485  anti-sigma-factor antagonist  35.35 
 
 
367 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3476  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 
380 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.837777  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  29.89 
 
 
521 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  41.74 
 
 
689 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3473  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 
422 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.551903  normal  0.0822697 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4422  putative PAS/PAC sensor protein  38.1 
 
 
492 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1810  anti-sigma-factor antagonist  39.01 
 
 
252 aa  96.7  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  39.57 
 
 
523 aa  96.3  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  40.5 
 
 
445 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  42.31 
 
 
433 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1270  anti-sigma-factor antagonist  39.1 
 
 
325 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 
370 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.36 
 
 
272 aa  94  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2931  anti-sigma-factor antagonist  34.29 
 
 
338 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353591  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1708  putative PAS/PAC sensor protein  30.67 
 
 
444 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0409  putative PAS/PAC sensor protein  31.97 
 
 
492 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2210  anti-sigma-factor antagonist  36.59 
 
 
580 aa  93.2  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  38.04 
 
 
568 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  39.29 
 
 
291 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  39.29 
 
 
281 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1037  putative PAS/PAC sensor protein  31.97 
 
 
484 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  39.55 
 
 
293 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  38.81 
 
 
439 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0621  anti-sigma-factor antagonist  24.35 
 
 
377 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0312248 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  32.04 
 
 
357 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0052  anti-sigma-factor antagonist  35.48 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2937  anti-sigma-factor antagonist  34.13 
 
 
271 aa  91.3  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000434706  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 
428 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  36.76 
 
 
306 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 
430 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  36.76 
 
 
315 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4153  anti-sigma-factor antagonist  39.89 
 
 
425 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.893474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  31.64 
 
 
388 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  38.02 
 
 
667 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  32.87 
 
 
653 aa  87.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4490  anti-sigma-factor antagonist  44.63 
 
 
511 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  decreased coverage  0.000741245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3437  anti-sigma-factor antagonist  38.84 
 
 
315 aa  86.3  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379355  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  35.51 
 
 
538 aa  86.3  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 
549 aa  86.3  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  41.96 
 
 
323 aa  85.9  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  41.67 
 
 
424 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0604  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 
428 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0938215  hitchhiker  0.000133748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  37.41 
 
 
559 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  36.89 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  35.29 
 
 
509 aa  84  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3442  anti-sigma-factor antagonist  35.62 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  36.67 
 
 
653 aa  82.8  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4771  anti-sigma-factor antagonist  36.11 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  31.21 
 
 
694 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3508  anti-sigma-factor antagonist  25.08 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3857  anti-sigma-factor antagonist  32.45 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1098  anti-sigma-factor antagonist  34.96 
 
 
514 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0148  putative PAS/PAC sensor protein  34.38 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0141  anti-sigma-factor antagonist  38.33 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0116373  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  39.26 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0116  anti-sigma-factor antagonist  35.33 
 
 
357 aa  79.7  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00357246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  34.75 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  34.51 
 
 
562 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  32.89 
 
 
358 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  38.18 
 
 
638 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  39.18 
 
 
653 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  39.18 
 
 
655 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1492  anti-sigma-factor antagonist  33.88 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2740  anti-sigma-factor antagonist  32.81 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3124  anti-sigma-factor antagonist  29.57 
 
 
379 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1936  anti-sigma-factor antagonist  33.09 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.729747  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0868  anti-sigma-factor antagonist  39.1 
 
 
506 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4858  anti-sigma-factor antagonist  32.52 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2635  anti-sigma-factor antagonist  32.65 
 
 
355 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0413  anti-sigma-factor antagonist  41.74 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>