More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3614 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3614  hypothetical protein  100 
 
 
463 aa  950    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2945  domain of unknown function DUF1727  56.53 
 
 
474 aa  484  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.833945  hitchhiker  0.00605856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0500  hypothetical protein  52.24 
 
 
491 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.496593  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1255  hypothetical protein  49.9 
 
 
507 aa  427  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1627  domain of unknown function DUF1727  45.3 
 
 
462 aa  412  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3270  domain of unknown function DUF1727  45.83 
 
 
458 aa  386  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.704416  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0514  hypothetical protein  39.7 
 
 
445 aa  340  4e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.265585  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1559  domain of unknown function DUF1727  40.22 
 
 
445 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4285  hypothetical protein  40.26 
 
 
447 aa  333  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2069  domain of unknown function DUF1727  36.15 
 
 
467 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0981076  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3012  domain of unknown function DUF1727  39.53 
 
 
448 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3108  domain of unknown function DUF1727  39.53 
 
 
448 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0008  hypothetical protein  35.89 
 
 
446 aa  317  3e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3016  hypothetical protein  44.72 
 
 
436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1345  domain of unknown function DUF1727  38.44 
 
 
476 aa  298  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000649333  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1153  domain of unknown function DUF1727  40.3 
 
 
474 aa  292  8e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0966  hypothetical protein  37.17 
 
 
464 aa  292  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0440  hypothetical protein  35.38 
 
 
467 aa  291  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0588  hypothetical protein  39.35 
 
 
469 aa  282  9e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.414158  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0443  domain of unknown function DUF1727  38.91 
 
 
463 aa  279  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0013  domain of unknown function DUF1727  34.66 
 
 
444 aa  266  5.999999999999999e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2009  hypothetical protein  37.74 
 
 
466 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000964515  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1208  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  33.12 
 
 
449 aa  257  4e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.970096  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1430  Mur ligase family protein  32.44 
 
 
437 aa  247  3e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1206  Mur ligase family protein  32.76 
 
 
451 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0554717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1392  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthetase MurC-like protein  32.76 
 
 
451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1785  domain of unknown function DUF1727  31.88 
 
 
446 aa  238  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0144804  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1946  hypothetical protein  31.86 
 
 
437 aa  232  9e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.102068  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1980  hypothetical protein  31.86 
 
 
437 aa  232  9e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.270286  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1233  Mur ligase family protein  33.33 
 
 
441 aa  229  9e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.198792  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0884  mur ligase family protein  31.39 
 
 
447 aa  224  2e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1027  domain of unknown function DUF1727  38.04 
 
 
456 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0450  hypothetical protein  30.45 
 
 
445 aa  223  6e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0996  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  35.45 
 
 
455 aa  219  6e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00110541  normal  0.028804 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0985  domain of unknown function DUF1727  29.78 
 
 
443 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000265712  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  32.81 
 
 
744 aa  214  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1250  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  29.89 
 
 
455 aa  211  3e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000012325  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1788  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  30.47 
 
 
452 aa  210  5e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1599  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  32.81 
 
 
445 aa  200  3.9999999999999996e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.709076  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2036  domain of unknown function DUF1727  36.3 
 
 
430 aa  196  9e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000388378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4298  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  33.71 
 
 
411 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0648  domain of unknown function DUF1727  32.59 
 
 
412 aa  187  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17860  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  28.34 
 
 
445 aa  185  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.934196  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1231  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  34.62 
 
 
490 aa  179  7e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.661721  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1706  hypothetical protein  35.43 
 
 
421 aa  178  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0418667  hitchhiker  0.00728652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0913  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase-like protein  30.62 
 
 
429 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.323703  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2306  hypothetical protein  33.55 
 
 
429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0105732  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0076  Mur ligase middle domain protein  31.33 
 
 
472 aa  174  3.9999999999999995e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000585492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1034  domain of unknown function DUF1727  33.49 
 
 
394 aa  172  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0282  Mur ligase  34.7 
 
 
416 aa  172  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0468  hypothetical protein  32.17 
 
 
424 aa  171  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.748006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6531  hypothetical protein  34.13 
 
 
417 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4002  domain of unknown function DUF1727  31 
 
 
412 aa  161  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2714  putative ligase  32.65 
 
 
418 aa  160  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2661  hypothetical protein  33.26 
 
 
410 aa  159  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4348  domain of unknown function DUF1727  31.15 
 
 
418 aa  159  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229746  normal  0.964565 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0442  domain of unknown function DUF1727  33.72 
 
 
425 aa  156  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.624005  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13744  ligase  32.88 
 
 
413 aa  153  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00431951  normal  0.370504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5520  hypothetical protein  32.01 
 
 
425 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33342  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3448  hypothetical protein  32.69 
 
 
420 aa  143  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4901  hypothetical protein  30.57 
 
 
408 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4990  hypothetical protein  30.57 
 
 
408 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5269  hypothetical protein  31.12 
 
 
408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235064  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1291  hypothetical protein  32.41 
 
 
406 aa  141  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3222  hypothetical protein  32.47 
 
 
415 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0406463 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1442  domain of unknown function DUF1727  31.06 
 
 
408 aa  133  5e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1327  Mur ligase middle domain protein  26.63 
 
 
470 aa  100  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000399076  decreased coverage  0.000242236 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2401  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  23.19 
 
 
455 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0480  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate/D-alanyl-D-alanyl ligase  24 
 
 
459 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000047898  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0849  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.8 
 
 
474 aa  69.7  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0355  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.9 
 
 
484 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000792879 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0504  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate/D-alanyl-D-alanyl ligase  31.18 
 
 
467 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4218  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.9 
 
 
488 aa  67  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2613  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  27.9 
 
 
473 aa  67  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00649562  unclonable  0.00000000000596507 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0487  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate--D-alanyl-D-alanyl ligase  30.65 
 
 
469 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0451  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  29.85 
 
 
491 aa  66.6  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367175  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0587  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  21.45 
 
 
449 aa  65.9  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00425266  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1995  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  25.97 
 
 
472 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.490336  normal  0.214631 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2428  UDP-N-acetylmuramate--alanine ligase  28.84 
 
 
472 aa  65.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4067  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate/D-alanyl-D-alanyl ligase  27.1 
 
 
482 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1300  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate--D-alanyl-D-alanyl ligase  22.7 
 
 
442 aa  65.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.432569  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0977  UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase  20.38 
 
 
457 aa  65.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000230391  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2268  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.64 
 
 
475 aa  65.1  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0488  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.54 
 
 
488 aa  65.1  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.275208  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  23.08 
 
 
894 aa  64.3  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0844  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.3 
 
 
468 aa  64.3  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.952175 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2502  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  21.82 
 
 
457 aa  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0486  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  30.99 
 
 
489 aa  63.9  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00092134  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3426  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  25.99 
 
 
471 aa  63.9  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.294637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2700  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  26.02 
 
 
479 aa  63.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.278778  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0403  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.9 
 
 
488 aa  63.5  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0491685  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0402  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.9 
 
 
488 aa  63.5  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.366897  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0414  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.9 
 
 
488 aa  63.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0428  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.9 
 
 
488 aa  63.5  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19875  hitchhiker  0.0000000000935532 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2047  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  27.55 
 
 
477 aa  63.5  0.000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00131729  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2192  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  23.43 
 
 
479 aa  63.2  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.604206  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3880  UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamyl-2, 6-diaminopimelate--D-alanyl-D-alanyl ligase  31.71 
 
 
460 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.769171  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2816  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  21.82 
 
 
466 aa  63.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1829  UDP-N-acetylmuramate/alanine ligase  24.07 
 
 
463 aa  62.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.543551  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1076  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.5 
 
 
467 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.594453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>