More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3513 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  100 
 
 		 286 aa  575  1.0000000000000001e-163  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  45.77 
 
 		 271 aa  162  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  45.15 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  41.6 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  44.5 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  33.71 
 
 		 365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  39.44 
 
 		 389 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  35.6 
 
 		 342 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  35.6 
 
 		 342 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  37.82 
 
 		 235 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  38.39 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  37.82 
 
 		 235 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  35.96 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  37 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  39.78 
 
 		 358 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  36.41 
 
 		 554 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  37.75 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  38.25 
 
 		 519 aa  102  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  37.62 
 
 		 371 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  37.62 
 
 		 227 aa  100  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  41.14 
 
 		 223 aa  100  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  32.76 
 
 		 225 aa  99.8  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  33.85 
 
 		 356 aa  99.4  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  36.11 
 
 		 511 aa  98.6  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  34.47 
 
 		 569 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  37.95 
 
 		 226 aa  95.9  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  35.35 
 
 		 541 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  35.53 
 
 		 286 aa  93.2  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1073  hypothetical protein  32.84 
 
 		 267 aa  92  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.44354e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15482  predicted protein  35.98 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  41.22 
 
 		 224 aa  92  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  30.53 
 
 		 289 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  30.53 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  37.31 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  36.98 
 
 		 287 aa  88.2  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  30.53 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  32.8 
 
 		 486 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  38.16 
 
 		 487 aa  87  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  38.16 
 
 		 487 aa  87  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9252  predicted protein  35.26 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00301456  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  31.43 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  32.98 
 
 		 523 aa  86.3  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  33.68 
 
 		 267 aa  85.9  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  33.71 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  38.24 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  32.98 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  39.24 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0904  rhomboid family protein  39.87 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42743  predicted protein  36 
 
 		 669 aa  84.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599119  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39588  Rhomboid-related protein 1 (RRP) (Rhomboid-like protein 1)  32.04 
 
 		 556 aa  84.3  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0102742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  38.62 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1145  rhomboid-like protein  40.46 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.062247  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2194  rhomboid family protein  32.37 
 
 		 489 aa  82.8  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47107  predicted protein  38.61 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432891  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  38.16 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  31.92 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  36.76 
 
 		 547 aa  82  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  39.42 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  32.21 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  36.76 
 
 		 541 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1449  Rhomboid family protein  33.13 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.6312  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  30 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  37.24 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  40 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  33.83 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  33.83 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  34.18 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3651  Rhomboid family protein  37.13 
 
 		 747 aa  78.2  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.015996 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  30.65 
 
 		 625 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  34.21 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  40 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  33.54 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  36.11 
 
 		 513 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  30.26 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  33.63 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  30.65 
 
 		 625 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.65 
 
 		 625 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  32.29 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  30.65 
 
 		 625 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  34.04 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  38.58 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6351  Rhomboid family protein  38.12 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  33.33 
 
 		 348 aa  75.5  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  36 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2186  rhomboid family protein  35.19 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2212  Rhomboid family protein  30.58 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00605445  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  35.22 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  30.37 
 
 		 579 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  31.64 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  36.69 
 
 		 515 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  36.77 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0591  peptidase, S54 (rhomboid) family  30.85 
 
 		 625 aa  72.4  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00150  uncharacterized membrane protein  33.33 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0235  rhomboid family protein  44.32 
 
 		 186 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42439  predicted protein  33.53 
 
 		 570 aa  71.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00659721  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10929  rhomboid family membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16490)  33.8 
 
 		 503 aa  70.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0025  peptidase, S54 (rhomboid) family protein  38.85 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.777845 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2385  rhomboid-like protein  36.55 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  33.54 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02120  uncharacterized membrane protein  33.57 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>